
JORMA PALVIMO
Professori
Professori
Lääketieteellisen biokemian professori
Biolääketieteen koulutusohjelman johtaja
Tutkimuksemme perustuu vankkaan osaamiseemme geenien luennan, transkription, säätelystä, steroidihormonien signaalinvälityksesta ja molekyylitason vaikutuksista sekä SUMO-muokkauksista. Keskitymme kahteen lääketieteellisesti tärkeään transkriptiotekijään, glukokortikoidi- ja androgeenireseptoriin ja solujen hormonaaliseen ohjelmoitumiseen. Selvitämme myös kuinka SUMO-modifikaatiot säätävät perimämme aktiivivisuutta solujen ohjelmoituessa ja erilaistuessa, myös stressitilanteissa. Tutkimme myös kuinka SUMO-muokkaukset säätelevät androgeenireseptorin ja glukokortikoidireseptorin toimintaa eturauhassyöpäsoluissa. Mallisysteemeinä käytämme viljeltyjä ihmisen solulinjoja. Käytössämme on ajantasaiset biokemian, solu- ja molekyylibiologian menetelmät, ml. koko perimän kattavat DNA-sekvensointi- ja koko proteomin kattavat proteomiikan tekniikat yhdistettyinä bioinformaattisiin analyyseihin. Nämä yhdessä mahdollistavat hormonaalisesti ja solujen erilaistumistilan mukaan määräytyvien geeniohjelmien säätelyn systemaattisen analysoinnin.
Yhteystiedot
Organisaatio
Lääketieteen laitos, Biolääketiede
Sähköposti
jorma.palvimo@uef.fi
Puhelin
040 591 0693
Avainsanat
Opetustehtävät
Endokrinologia, molekyylibiologia, biolääketieteellinen tutkimus ja tutkimuksen suunnittelu
Tutkimusryhmät - UEF
-
EDCMET
-
Steroid Receptor Research Center
-
Steroidireseptorit ja SUMO-muokkaukset geenien luennan ja solujen erilaistumisen säätelyssä
Linkit
Julkaisut
-
Antonio Urrutia, Gustavo; Ramachandran, Haribaskar; Cauchy, Pierre; Boo, Kyungjin; Ramamoorthy, Senthilkumar; Boller, Soeren; Dogan, Esen; Clapes, Thomas; Trompouki, Eirini; Torres-Padilla, Maria-Elena; Palvimo, Jorma J.; Pichler, Andrea; Grosschedl, Rudolf. 2021. ZFP451-mediated SUMOylation of SATB2 drives embryonic stem cell differentiation Genes and development 35 15-16: 1142-1160. 2021
-
Launonen, Kaisa-Mari; Paakinaho, Ville; Sigismondo, Gianluca; Malinen, Marjo; Sironen, Reijo; Hartikainen, Jaana M; Laakso, Hanna; Visakorpi, Tapio; Krijgsveld, Jeroen; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J. 2021. Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells Oncogene 40 27: 4567-4579. 2021
-
Manjur, ABMK; Lempiäinen, JK; Malinen, M; Varjosalo, M; Palvimo, JJ; Niskanen, EA. 2021. BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility Journal of steroid biochemistry and molecular biology 210: 105873. 2021
-
Paakinaho, Ville; Lempiäinen, Joanna K; Sigismondo, Gianluca; Niskanen, Einari A; Malinen, Marjo; Jääskeläinen, Tiina; Varjosalo, Markku; Krijgsveld, Jeroen; Palvimo, Jorma J. 2021. SUMOylation regulates the protein network and chromatin accessibility at glucocorticoid receptor-binding sites Nucleic acids research 49 4: 1951-1971. 2021
-
Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J. 2021. Genome-wide crosstalk between steroid receptors in breast and prostate cancers Endocrine-related cancer 28 9: R231-R250. 2021
-
Rawat, Prashant; Boehning, Marc; Hummel, Barbara; Aprile-Garcia, Fernando; Pandit, Anwit S; Eisenhardt, Nathalie; Khavaran, Ashkan; Niskanen, Einari; Vos, Seychelle M; Palvimo, Jorma J; Pichler, Andrea; Cramer, Patrick; Sawarkar, Ritwick. 2021. Stress-induced nuclear condensation of NELF drives transcriptional downregulation Molecular cell 81 5: 1013-1026. 2021
-
Vanderhaeghen, Tineke; Timmermans, Steven; Watts, Deepika; Paakinaho, Ville; Eggermont, Melanie; Vandewalle, Jolien; Wallaeys, Charlotte; Van Wyngene, Lise; Van Looveren, Kelly; Nuyttens, Louise; Dewaele, Sylviane; Vanden Berghe, Joke; Lemeire, Kelly; De Backer, Joey; Dirkx, Laura; Vanden Berghe, Wim; Caljon, Guy; Ghesquière, Bart; De Bosscher, Karolien; Wielockx, Ben et al [incl. Palvimo, Jorma J. 2021. Reprogramming of glucocorticoid receptor function by hypoxia Embo reports 2022; 23 1: e53083. 2021
-
Vandewalle, Jolien; Timmermans, Steven; Paakinaho, Ville; Vancraeynest, Lies; Dewyse, Liza; Vanderhaeghen, Tineke; Wallaeys, Charlotte; Van Wyngene, Lise; Van Looveren, Kelly; Nuyttens, Louise; Eggermont, Melanie; Dewaele, Sylviane; Velho, Tiago R; Moita, Luis F; Weis, Sebastian; Sponholz, Christoph; van Grunsven, Leo A; Dewerchin, Mieke; Carmeliet, Peter; De Bosscher, Karolien; et al.; [incl. Pal. 2021. Combined glucocorticoid resistance and hyperlactatemia contributes to lethal shock in sepsis Cell metabolism 33 9: 1763-1776.e5. 2021
-
El Kharraz, Sarah; Dubois, Vanessa; Royen, Martin E; Houtsmuller, Adriaan B; Pavlova, Ekatarina; Atanassova, Nina; Nguyen, Tien; Voet, Arnout; Eerlings, Roy; Handle, Florian; Prekovic, Stefan; Smeets, Elien; Moris, Lisa; Devlies, Wout; Ohlsson, Claes; Poutanen, Matti; Verstrepen, Kevin J; Carmeliet, Geert; Launonen, Kaisa-Mari; Helminen, Laura et al [incl. Palvimo, Jorma J]. 2021. The androgen receptor depends on ligand-binding domain dimerization for transcriptional activation Embo reports 22 12: e52764. 2021
-
Jaillard, Sylvie; Bell, Katrina; Akloul, Linda; Walton, Kelly; McElreavy, Kenneth; Stocker, William A; Beaumont, Marion; Harrisson, Craig; Jääskeläinen, Tiina; Palvimo, Jorma J; Robevska, Gorjana; Launay, Erika; Satié, Anne-Pascale; Listyasari, Nurin; Bendavid, Claude; Sreenivasan, Rajini; Duros, Solène; van den Bergen, Jocelyn; Henry, Catherine; Domin-Bernhard, Mathilde et al.. 2020. New insights into the genetic basis of premature ovarian insufficiency: novel causative variants and candidate genes revealed by genomic sequencing Maturitas 141: 9-19. 2020