
JORMA PALVIMO
Professori
Lääketieteellisen biokemian professori
Biolääketieteen koulutusohjelman johtaja
Terveystieteiden tiedekunnan 2. varadekaani
Tutkimuksemme perustuu vankkaan osaamiseemme geenien luennan, transkription, säätelystä, steroidihormonien signaalinvälityksesta ja molekyylitason vaikutuksista sekä SUMO-muokkauksista. Keskitymme kahteen lääketieteellisesti tärkeään transkriptiotekijään, glukokortikoidi- ja androgeenireseptoriin ja solujen hormonaaliseen ohjelmoitumiseen. Selvitämme myös kuinka SUMO-modifikaatiot säätävät perimämme aktiivivisuutta solujen ohjelmoituessa ja erilaistuessa, myös stressitilanteissa. Tutkimme myös kuinka SUMO-muokkaukset säätelevät androgeenireseptorin ja glukokortikoidireseptorin toimintaa eturauhassyöpäsoluissa. Mallisysteemeinä käytämme viljeltyjä ihmisen solulinjoja. Käytössämme on ajantasaiset biokemian, solu- ja molekyylibiologian menetelmät, ml. koko perimän kattavat DNA-sekvensointi- ja koko proteomin kattavat proteomiikan tekniikat yhdistettyinä bioinformaattisiin analyyseihin. Nämä yhdessä mahdollistavat hormonaalisesti ja solujen erilaistumistilan mukaan määräytyvien geeniohjelmien säätelyn systemaattisen analysoinnin.
Yhteystiedot
Organisaatio
Lääketieteen laitos, Biolääketiede
Sähköposti
jorma.palvimo@uef.fi
Puhelin
040 591 0693
Avainsanat
Opetustehtävät
Endokrinologia, molekyylibiologia, biolääketieteellinen tutkimus ja tutkimuksen suunnittelu
Tutkimusryhmät
-
EDCMET
-
Steroid Receptor Research Center
-
Steroidireseptorit ja SUMO-muokkaukset geenien luennan ja solujen erilaistumisen säätelyssä
Linkit
Julkaisut
-
Manjur, ABMK; Lempiäinen, JK; Malinen, M; Varjosalo, M; Palvimo, JJ; Niskanen, EA;. 2021. BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility Journal of steroid biochemistry and molecular biology 210: 105873. 2021
-
Paakinaho, Ville; Lempiäinen, Joanna K; Sigismondo, Gianluca; Niskanen, Einari A; Malinen, Marjo; Jääskeläinen, Tiina; Varjosalo, Markku; Krijgsveld, Jeroen; Palvimo, Jorma J. 2021. SUMOylation regulates the protein network and chromatin accessibility at glucocorticoid receptor-binding sites Nucleic acids research 49 4: 1951-1971. 2021
-
Rawat, Prashant ; Boehning, Marc ; Hummel, Barbara ; Aprile-Garcia, Fernando ; Pandit, Anwit S ; Eisenhardt, Nathalie ; Khavaran, Ashkan ; Niskanen, Einari ; Vos, Seychelle M ; Palvimo, Jorma J ; Pichler, Andrea ; Cramer, Patrick ; Sawarkar, Ritwick. 2021. Stress-induced nuclear condensation of NELF drives transcriptional downregulation Molecular cell 81 5: 1013-1026. 2021
-
Jaillard, Sylvie; Bell, Katrina; Akloul, Linda; Walton, Kelly; McElreavy, Kenneth; Stocker, William A; Beaumont, Marion; Harrisson, Craig; Jääskeläinen, Tiina; Palvimo, Jorma J; Robevska, Gorjana; Launay, Erika; Satié, Anne-Pascale; Listyasari, Nurin; Bendavid, Claude; Sreenivasan, Rajini; Duros, Solène; van den Bergen, Jocelyn; Henry, Catherine; Domin-Bernhard, Mathilde et al.. 2020. New insights into the genetic basis of premature ovarian insufficiency: novel causative variants and candidate genes revealed by genomic sequencing Maturitas 141: 9-19. 2020
-
Lempiäinen, JK; Manjur, ABMK; Malinen, M; Ketola, K; Niskanen, EA; Palvimo, JJ. 2020. BCOR-coupled H2A monoubiquitination represses a subset of androgen receptor target genes regulating prostate cancer proliferation Oncogene 39: 2391-2407. 2020
-
Kaiser Manjur, ABM; Lempiäinen, Joanna K; Malinen, Marjo; Palvimo, Jorma J; Niskanen, Einari A. 2019. IRF2BP2 Modulates the Crosstalk between Glucocorticoid and TNF Signaling Journal of steroid biochemistry and molecular biology 192: 105382. 2019
-
Tolonen, JP; Heikkilä, M; Malinen, M; Lee, HM; Palvimo, JJ; Wei, GH; Myllyharju, J. 2019. A long hypoxia-inducible factor 3 isoform 2 is a transcription activator that regulates erythropoietin Cellular and molecular life sciences [First Online 25 November 2019]: 1-16. 2019
-
Zhang, Fu-Ping; Malinen, Marjo; Mehmood, Arfa; Lehtiniemi, Tiina; Jääskeläinen, Tiina; Niskanen, Einari A; Korhonen, Hanna; Laiho, Asta; Elo, Laura L; Ohlsson, Claes; Kotaja, Noora; Poutanen, Matti; Sipilä, Petra; Palvimo, Jorma J. 2019. Lack of androgen receptor SUMOylation results in male infertility due to epididymal dysfunction Nature communications 10: 777. 2019
-
Dendoncker, K; Timmermans, S; Vandewalle, J; Eggermont, M; Lempiäinen, J; Van Hamme, E; Dewaele, S; Vandevyver, S; Ballegeer, M; Souffriau, J; Van Wyngene, L; Van Looveren, K; Vanderhaeghen, T; Beyaert, R; De Bosscher, K; Palvimo, JJ; Van Montagu, M; Libert, C. 2019. TNF-α inhibits glucocorticoid receptor-induced gene expression by reshaping the GR nuclear cofactor profile Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116 26: 12942-12951. 2019
-
Lempiäinen Joanna K, Niskanen Einari A, Vuoti Kaisa-Mari, Lampinen Riikka E, Göös Helka, Varjosalo Markku, Palvimo Jorma J. 2017. Agonist-specific Protein Interactomes of Glucocorticoid and Androgen Receptor as Revealed by Proximity Mapping. Molecular & Cellular Proteomics 16 8: 1462-1474. 2017