Jorma Palvimo
Professori
Professori
Lääketieteellisen biokemian professori
Biolääketieteen koulutusohjelman johtaja
Lääketieteen laitos, Biolääketiede
jorma.palvimo@uef.fi | 040 591 0693
Tutkimuksemme perustuu vankkaan osaamiseemme geenien luennan, transkription, säätelystä, steroidihormonien signaalinvälityksesta ja molekyylitason vaikutuksista sekä SUMO-muokkauksista. Keskitymme kahteen lääketieteellisesti tärkeään transkriptiotekijään, glukokortikoidi- ja androgeenireseptoriin ja solujen hormonaaliseen ohjelmoitumiseen. Selvitämme myös kuinka SUMO-modifikaatiot säätävät perimämme aktiivivisuutta solujen ohjelmoituessa ja erilaistuessa, myös stressitilanteissa. Tutkimme myös kuinka SUMO-muokkaukset säätelevät androgeenireseptorin ja glukokortikoidireseptorin toimintaa eturauhassyöpäsoluissa. Mallisysteemeinä käytämme viljeltyjä ihmisen solulinjoja. Käytössämme on ajantasaiset biokemian, solu- ja molekyylibiologian menetelmät, ml. koko perimän kattavat DNA-sekvensointi- ja koko proteomin kattavat proteomiikan tekniikat yhdistettyinä bioinformaattisiin analyyseihin. Nämä yhdessä mahdollistavat hormonaalisesti ja solujen erilaistumistilan mukaan määräytyvien geeniohjelmien säätelyn systemaattisen analysoinnin.
Tutkimusryhmät
Projektit
Julkaisut
94 kappaletta-
N/C Interactions Are Dispensable for Normal In Vivo Functioning of the Androgen Receptor in Male Mice
El Kharraz, Sarah; Dubois, Vanessa; Launonen, Kaisa-Mari; Helminen, Laura; Palvimo, Jorma J; Libert, Claude; Smeets, Elien; Moris, Lisa; Eerlings, Roy; Vanderschueren, Dirk; Helsen, Christine; Claessens, Frank. 2022. Endocrinology. 163: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility
Manjur, ABMK; Lempiäinen, JK; Malinen, M; Varjosalo, M; Palvimo, JJ; Niskanen, EA. 2021. Journal of steroid biochemistry and molecular biology. 210: 105873 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells
Launonen, Kaisa-Mari; Paakinaho, Ville; Sigismondo, Gianluca; Malinen, Marjo; Sironen, Reijo; Hartikainen, Jaana M; Laakso, Hanna; Visakorpi, Tapio; Krijgsveld, Jeroen; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J. 2021. Oncogene. 40: 4567-4579 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Combined glucocorticoid resistance and hyperlactatemia contributes to lethal shock in sepsis
Vandewalle, Jolien; Timmermans, Steven; Paakinaho, Ville; Vancraeynest, Lies; Dewyse, Liza; Vanderhaeghen, Tineke; Wallaeys, Charlotte; Van Wyngene, Lise; Van Looveren, Kelly; Nuyttens, Louise; Eggermont, Melanie; Dewaele, Sylviane; Velho, Tiago R; Moita, Luis F; Weis, Sebastian; Sponholz, Christoph; van Grunsven, Leo A; Dewerchin, Mieke; Carmeliet, Peter; De Bosscher, Karolien; et al.; [incl. Palvimo, Jorma]. 2021. Cell metabolism. 33: 1763-1776.e5 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genome-wide crosstalk between steroid receptors in breast and prostate cancers
Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J. 2021. Endocrine-related cancer. 28: R231-R250 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Reprogramming of glucocorticoid receptor function by hypoxia
Vanderhaeghen, Tineke; Timmermans, Steven; Watts, Deepika; Paakinaho, Ville; Eggermont, Melanie; Vandewalle, Jolien; Wallaeys, Charlotte; Van Wyngene, Lise; Van Looveren, Kelly; Nuyttens, Louise; Dewaele, Sylviane; Vanden Berghe, Joke; Lemeire, Kelly; De Backer, Joey; Dirkx, Laura; Vanden Berghe, Wim; Caljon, Guy; Ghesquière, Bart; De Bosscher, Karolien; Wielockx, Ben et al [incl. Palvimo, Jorma J]. 2021. Embo reports. 2022; 23: e53083 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
SUMOylation regulates the protein network and chromatin accessibility at glucocorticoid receptor-binding sites
Paakinaho, Ville; Lempiäinen, Joanna K; Sigismondo, Gianluca; Niskanen, Einari A; Malinen, Marjo; Jääskeläinen, Tiina; Varjosalo, Markku; Krijgsveld, Jeroen; Palvimo, Jorma J. 2021. Nucleic acids research. 49: 1951-1971 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Stress-induced nuclear condensation of NELF drives transcriptional downregulation
Rawat, Prashant; Boehning, Marc; Hummel, Barbara; Aprile-Garcia, Fernando; Pandit, Anwit S; Eisenhardt, Nathalie; Khavaran, Ashkan; Niskanen, Einari; Vos, Seychelle M; Palvimo, Jorma J; Pichler, Andrea; Cramer, Patrick; Sawarkar, Ritwick. 2021. Molecular cell. 81: 1013-1026 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The androgen receptor depends on ligand-binding domain dimerization for transcriptional activation
El Kharraz, Sarah; Dubois, Vanessa; Royen, Martin E; Houtsmuller, Adriaan B; Pavlova, Ekatarina; Atanassova, Nina; Nguyen, Tien; Voet, Arnout; Eerlings, Roy; Handle, Florian; Prekovic, Stefan; Smeets, Elien; Moris, Lisa; Devlies, Wout; Ohlsson, Claes; Poutanen, Matti; Verstrepen, Kevin J; Carmeliet, Geert; Launonen, Kaisa-Mari; Helminen, Laura et al [incl. Palvimo, Jorma J]. 2021. Embo reports. 22: e52764 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
ZFP451-mediated SUMOylation of SATB2 drives embryonic stem cell differentiation
Antonio Urrutia, Gustavo; Ramachandran, Haribaskar; Cauchy, Pierre; Boo, Kyungjin; Ramamoorthy, Senthilkumar; Boller, Soeren; Dogan, Esen; Clapes, Thomas; Trompouki, Eirini; Torres-Padilla, Maria-Elena; Palvimo, Jorma J.; Pichler, Andrea; Grosschedl, Rudolf. 2021. Genes and development. 35: 1142-1160 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä