Jorma Palvimo
Professori
Professori
Lääketieteellisen biokemian professori Biolääketieteen koulutusohjelman johtaja
Biolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
[email protected] | 040 591 0693
Tutkimuksemme perustuu vankkaan osaamiseemme geenien luennan, transkription, säätelystä, steroidihormonien signaalinvälityksesta ja molekyylitason vaikutuksista sekä SUMO-muokkauksista. Keskitymme kahteen lääketieteellisesti tärkeään transkriptiotekijään, glukokortikoidi- ja androgeenireseptoriin ja solujen hormonaaliseen ohjelmoitumiseen. Selvitämme myös kuinka SUMO-modifikaatiot säätävät perimämme aktiivivisuutta solujen ohjelmoituessa ja erilaistuessa, myös stressitilanteissa. Tutkimme myös kuinka SUMO-muokkaukset säätelevät androgeenireseptorin ja glukokortikoidireseptorin toimintaa eturauhassyöpäsoluissa. Mallisysteemeinä käytämme viljeltyjä ihmisen solulinjoja. Käytössämme on ajantasaiset biokemian, solu- ja molekyylibiologian menetelmät, ml. koko perimän kattavat DNA-sekvensointi- ja koko proteomin kattavat proteomiikan tekniikat yhdistettyinä bioinformaattisiin analyyseihin. Nämä yhdessä mahdollistavat hormonaalisesti ja solujen erilaistumistilan mukaan määräytyvien geeniohjelmien säätelyn systemaattisen analysoinnin.
Tutkimusryhmät
-
Steroid Receptor Research Center 01.01.2019 - -
Steroidireseptorit ja SUMO-muokkaukset geenien lu… 01.01.2022 -
Projektit
Julkaisut
102/102 kappaletta-
A critical role for HNF4α in polymicrobial sepsis-associated metabolic reprogramming and death
Van Dender, Céline; Timmermans, Steven; Paakinaho, Ville; Vanderhaeghen, Tineke; Vandewalle, Jolien; Claes, Maarten; Garcia, Bruno; Roman, Bart; De Waele, Jan; Croubels, Siska; De Bosscher, Karolien; Meuleman, Philip; Herpain, Antoine; Palvimo, Jorma J; Libert, Claude. 2024. Embo molecular medicine. 16: 2485-2515 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Central role of SUMOylation in the regulation of chromatin interactions and transcriptional outputs of the androgen receptor in prostate cancer cells
Launonen, Kaisa-Mari; Varis, Vera; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Varjosalo, Markku; Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J. 2024. Nucleic acids research. 52: 9519-9535 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chromatin accessibility and pioneer factor FOXA1 restrict glucocorticoid receptor action in prostate cancer
Helminen, Laura; Huttunen, Jasmin; Tulonen, Melina; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville. 2023. Nucleic acids research. 2024; 52: 625-642 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
N/C Interactions Are Dispensable for Normal In Vivo Functioning of the Androgen Receptor in Male Mice
El Kharraz, Sarah; Dubois, Vanessa; Launonen, Kaisa-Mari; Helminen, Laura; Palvimo, Jorma J; Libert, Claude; Smeets, Elien; Moris, Lisa; Eerlings, Roy; Vanderschueren, Dirk; Helsen, Christine; Claessens, Frank. 2022. Endocrinology. 163: . bqac104 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility
Manjur, ABMK; Lempiäinen, JK; Malinen, M; Varjosalo, M; Palvimo, JJ; Niskanen, EA. 2021. Journal of steroid biochemistry and molecular biology. 210: 105873 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells
Launonen, Kaisa-Mari; Paakinaho, Ville; Sigismondo, Gianluca; Malinen, Marjo; Sironen, Reijo; Hartikainen, Jaana M; Laakso, Hanna; Visakorpi, Tapio; Krijgsveld, Jeroen; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J. 2021. Oncogene. 40: 4567-4579 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Combined glucocorticoid resistance and hyperlactatemia contributes to lethal shock in sepsis
Vandewalle, Jolien; Timmermans, Steven; Paakinaho, Ville; Vancraeynest, Lies; Dewyse, Liza; Vanderhaeghen, Tineke; Wallaeys, Charlotte; Van Wyngene, Lise; Van Looveren, Kelly; Nuyttens, Louise; Eggermont, Melanie; Dewaele, Sylviane; Velho, Tiago R; Moita, Luis F; Weis, Sebastian; Sponholz, Christoph; van Grunsven, Leo A; Dewerchin, Mieke; Carmeliet, Peter; De Bosscher, Karolien; et al.; [incl. Palvimo, Jorma]. 2021. Cell metabolism. 33: 1763-1776.e5 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genome-wide crosstalk between steroid receptors in breast and prostate cancers
Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J. 2021. Endocrine-related cancer. 28: R231-R250 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Reprogramming of glucocorticoid receptor function by hypoxia
Vanderhaeghen, Tineke; Timmermans, Steven; Watts, Deepika; Paakinaho, Ville; Eggermont, Melanie; Vandewalle, Jolien; Wallaeys, Charlotte; Van Wyngene, Lise; Van Looveren, Kelly; Nuyttens, Louise; Dewaele, Sylviane; Vanden Berghe, Joke; Lemeire, Kelly; De Backer, Joey; Dirkx, Laura; Vanden Berghe, Wim; Caljon, Guy; Ghesquière, Bart; De Bosscher, Karolien; Wielockx, Ben et al [incl. Palvimo, Jorma J]. 2021. Embo reports. 2022; 23: e53083 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
SUMOylation regulates the protein network and chromatin accessibility at glucocorticoid receptor-binding sites
Paakinaho, Ville; Lempiäinen, Joanna K; Sigismondo, Gianluca; Niskanen, Einari A; Malinen, Marjo; Jääskeläinen, Tiina; Varjosalo, Markku; Krijgsveld, Jeroen; Palvimo, Jorma J. 2021. Nucleic acids research. 49: 1951-1971 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä