Johannes Ojanen
Apurahatutkija
A.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta
Tutkimusryhmät
Julkaisut
3/3 kappaletta-
Protocol for achieving enhanced snRNA-seq data quality using Quality Clustering
Tavi, Paavo J; Ojanen, Johannes; Laitinen, Pia; Linna-Kuosmanen, Suvi, 2025, STAR protocols, 6, 2, 103717. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
QClus: a droplet filtering algorithm for enhanced snRNA-seq data quality in challenging samples
Schmauch, Eloi; Ojanen, Johannes; Galani, Kyriakitsa; Jalkanen, Juho; Harju, Kristiina; Hollmen, Maija; Kokki, Hannu; Gunn, Jarmo; Halonen, Jari; Hartikainen, Juha; Kiviniemi, Tuomas; Tavi, Pasi; Kaikkonen, Minna U.; Kellis, Manolis; Linna-Kuosmanen, Suvi, 2024, Nucleic acids research, 53, 1, gkae1145. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Transcriptomic and spatial dissection of human ex vivo right atrial tissue reveals proinflammatory microvascular changes in ischemic heart disease
Linna-Kuosmanen, Suvi; Schmauch, Eloi; Galani, Kyriakitsa; Ojanen, Johannes; Boix, Carles A; Örd, Tiit; Toropainen, Anu; Singha, Prosanta K; Moreau, Pierre R; Harju, Kristiina; Blazeski, Adriana; Segerstolpe, Åsa; Lahtinen, Veikko; Hou, Lei; Kang, Kai; Meibalan, Elamaran; Agudelo, Leandro Z; Kokki, Hannu; Halonen, Jari; Jalkanen, Juho; Gunn, Jarmo; MacRae, Calum A; Hollmén, Maija; Hartikainen, Juha EK; Kaikkonen, Minna U; García-Cardeña, Guillermo; Tavi, Pasi; Kiviniemi, Tuomas; Kellis, Manolis, 2024, Cell reports medicine, 5, 5, 101556. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä