Antti Poso

A twist in the tale: shifting from covalent targeting of a tyrosine in JAK3 to a lysine in MK2

Hillebrand, Laura; Wang, Guiqun; Rasch, Alexander; Masberg, Benedikt; Chaikuad, Apirat; Kronenberger, Thales; Günther, Ellen; Forster, Michael; Poso, Antti; Lämmerhofer, Michael; Laufer, Stefan A.; Knapp, Stefan; Gehringer, Matthias, 2025, RSC medicinal chemistry, [First published 01 Aug 2025], 1-14. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Activation of steroid hormone receptors by metabolism-disrupting chemicals

Pitkänen, Sini; Niskanen, Jonna; Mysore, Raghavendra; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Pijnenburg, Dirk; van Beuningen, Rinie; Rashidian, Azam; Kronenberger, Thales; Poso, Antti; Levonen, Anna-Liisa; Küblbeck, Jenni; Honkakoski, Paavo, 2025, Toxicology and applied pharmacology, 499, 117335. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Design, Synthesis, and Unprecedented Interactions of Covalent Dipeptide-Based Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease and Its Variants Displaying Potent Antiviral Activity

Flury, Philipp; Krüger, Nadine; Sylvester, Katharina; Breidenbach, Julian; Al Hamwi, Ghazl; Qiao, Jingxin; Chen, Yan; Rocha, Cheila; Serafim, Mateus Sá Magalhães; Barbosa da Silva, Elany; Pöhlmann, Stefan; Poso, Antti; Kronenberger, Thales; Rox, Katharina; O’Donoghue, Anthony J.; Yang, Shengyong; Sträter, Norbert; Gütschow, Michael; Laufer, Stefan A.; Müller, Christa E.; Pillaiyar, Thanigaimalai, 2025, Journal of medicinal chemistry, 68, 3, 3626-3652. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery of synthetic small molecules targeting the central regulator of <i>Salmonella</i> pathogenicity

Boudrioua, Abdelhakim; Joiner, Joe D.; Grin, Iwan; Kronenberger, Thales; Korotkov, Vadim S.; Steinchen, Wieland; Kohler, Alexander; Schminke, Sophie; Schulte, Julia-Christina; Pietsch, Michael; Naini, Arun; Kalverkamp, Simon; Hotop, Sven-Kevin; Coyle, Travis; Piselli, Claudio; Coles, Murray; Rox, Katharina; Marschal, Matthias; Bange, Gert; Flieger, Antje; Poso, Antti; Brönstrup, Mark; Hartmann, Marcus D.; Wagner, Samuel, 2025, Science advances, 11, 15, 1-23. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Look What You Made Me Do: Discerning Feature for Classification of Endocrine-Disrupting Chemical Binding to Steroid Hormone Receptors

Rashidian, Azam; Pitkänen, Sini; Maltarollo, Vinicius Goncalves; Schoppmeier, Ulrich; Shevchenko, Ekaterina; Medarametla, Prasanthi; Poso, Antti; Küblbeck, Jenni; Honkakoski, Paavo; Kronenberger, Thales, 2025, Journal of chemical information and modeling, 65, 8, 4148-4162. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

New players from the old chalcone scaffold: Synthesis, identification, and characterization of new potent ABCG2 inhibitors

Ruginsk, Bruna Estelita; Zattoni, Ingrid Fatima; Gomes De Oliveira, Arthur Henrique; Zanzarini, Isadora da Silva; de Moraes Rego, Fabiane Gomes; Picheth, Geraldo; Poso, Antti; Kronenberger, Thales; Goda, Katalin; Moure, Vivian Rotuno; Boumendjel, Ahcène; Valdameri, Glaucio, 2025, European journal of medicinal chemistry, 299, 118077. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2

Karim, Marwah; Mishra, Manjari; Lo, Chieh Wen; Saul, Sirle; Cagirici, Halise Busra; Gourdelier, Manon; Ghita, Luca; Ojha, Amrita; Tran, Do Hoang Nhu; Agrawal, Aditi; McGraw, Connor; East, Michael P; Gammeltoft, Karen Anbro; Sahoo, Malaya Kumar; Mooney, Nancie A; Johnson, Gary L; Das, Soumita; Leyssen, Pieter; Neyts, Johan; Chiu, Winston; Cohen, Courtney A; Bukh, Jens; Gottwein, Judith; Dye, John M; Neff, Norma; Jackson, Peter K; Pinsky, Benjamin A; Laitinen, Tuomo; Pantsar, Tatu; Poso, Antti; Za, 2025, Nature communications, 16, 1, 6397. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Pseudomonas aeruginosa acyl-CoA dehydrogenases and structure-guided inversion of their substrate specificity

Wang, Meng; Medarametla, Prasanthi; Kronenberger, Thales; Deingruber, Tomas; Brear, Paul; Figueroa, Wendy; Ho, Pok-Man; Krueger, Thomas; Pearce, James C.; Poso, Antti; Wakefield, James G.; Spring, David R.; Welch, Martin, 2025, Nature communications, 16, 1, 2334. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Tetrahydroquinoline/4,5-dihydroisoxazoline hybrids counteracts multidrug resistance by inhibiting MRP1-mediated drug efflux

da Silva Pereira, Giovana; Vesga, Luis C.; Scheiffer, Gustavo; Zattoni, Ingrid Fatima; Ruginsk, Bruna Estelita; Bernal, Cristian C.; Romero Bohórquez, Arnold R.; Mendez-Sanchez, Stelia Carolina; Rashidian, Azam; Poso, Antti; Gomes de Moraes Rego, Fabiane; Picheth, Geraldo; Moure, Vivian Rotuno; Kronenberger, Thales; Valdameri, Glaucio, 2025, Biochemical and biophysical research communications, 774, 152074. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The human microbiome-derived antimicrobial lugdunin self-regulates its biosynthesis by a feed-forward mechanism

Reetz, Leonie; Schulze, Lukas; Kronenberger, Thales; Selim, Khaled A.; Schaefle, Timm; Dema, Taulant; Zipperer, Alexander; Mößner, Jens; Poso, Antti; Grond, Stephanie; Peschel, Andreas; Krismer, Bernhard, 2025, Mbio, 16, 4, e03571-24. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Ultra-Large-Scale Virtual Screening

Pöhner, Ina; Sivula, Toni; Poso, Antti, 2025, Maltarollo, Vinícius Gonçalves, Computer-Aided Drug Discovery and Design: From Theory to Applications, 299-343. A3 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Cathepsin-Targeting SARS-CoV-2 Inhibitors: Design, Synthesis, and Biological Activity

Flury, Philipp; Breidenbach, Julian; Krüger, Nadine; Voget, Rabea; Schäkel, Laura; Si, Yaoyao; Krasniqi, Vesa; Calistri, Sara; Olfert, Matthias; Sylvester, Katharina; Rocha, Cheila; Ditzinger, Raphael; Rasch, Alexander; Pöhlmann, Stefan; Kronenberger, Thales; Poso, Antti; Rox, Katharina; Laufer, Stefan A; Müller, Christa E; Gütschow, Michael; Pillaiyar, Thanigaimalai, 2024, ACS pharmacology & translational science, 7, 2, 493-514. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Cyclophilin A is a ligand for RAGE in thrombo-inflammation

Seizer, Peter; von Ungern-Sternberg, Saskia N I; Haug, Verena; Dicenta, Valerie; Rosa, Annabelle; Butt, Elke; Noethel, Moritz; Rohlfing, Anne-Katrin; Sigle, Manuel; Nawroth, Peter P; Nussbaum, Claudia; Sperandio, Markus; Kusch, Charly; Meub, Mara; Sauer, Markus; Muenzer, Patrick; Bieber, Kristin; Stanger, Anna; Mack, Andreas F; Huber, Rene; Brand, Korbinian; Lehners, Moritz; Feil, Robert; Poso, Antti; Krutzke, Konstantin; Schaeffer, Tilman E; Nieswandt, Bernhard; Borst, Oliver; May, Andreas E; Z, 2024, Cardiovascular research, 120, 4, 385-402. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Development of Selective Pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one-Based Mammalian STE20-Like (MST3/4) Kinase Inhibitors

Rak, Marcel; Menge, Amelie; Tesch, Roberta; Berger, Lena M; Balourdas, Dimitrios-Ilias; Shevchenko, Ekaterina; Kramer, Andreas; Elson, Lewis; Berger, Benedict-Tilman; Abdi, Ismahan; Wahl, Laurenz M; Poso, Antti; Kaiser, Astrid; Hanke, Thomas; Kronenberger, Thales; Joerger, Andreas C; Muller, Susanne; Knapp, Stefan, 2024, Journal of medicinal chemistry, 67, 5, 3813-3842. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery and optimization of narrow spectrum inhibitors of Tousled like kinase 2 (TLK2) using quantitative structure activity relationships

Asquith, Christopher R M; East, Michael P; Laitinen, Tuomo; Alamillo-Ferrer, Carla; Hartikainen, Erkka; Wells, Carrow I; Axtman, Alison D; Drewry, David H; Tizzard, Graham J; Poso, Antti; Willson, Timothy M; Johnson, Gary L, 2024, European journal of medicinal chemistry, 271, 116357. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Drug repurposing platform for deciphering the druggable SARS-CoV-2 interactome

Bogacheva, Mariia S; Kuivanen, Suvi; Potdar, Swapnil; Hassinen, Antti; Huuskonen, Sini; Pöhner, Ina; Luck, Tamara J; Turunen, Laura; Feodoroff, Michaela; Szirovicza, Leonora; Savijoki, Kirsi; Saarela, Jani; Tammela, Päivi; Paavolainen, Lassi; Poso, Antti; Varjosalo, Markku; Kallioniemi, Olli; Pietiäinen, Vilja; Vapalahti, Olli, 2024, Antiviral research, 223, 105813. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Filling the Blank Space: Branched 4-Nonylphenol Isomers Are Responsible for Robust Constitutive Androstane Receptor (CAR) Activation by Nonylphenol

Rashidian, Azam; Dusek, Jan; Drastik, Martin; Smutna, Lucie; Fritsche, Kristin; Braeuning, Albert; Pijnenburg, Dirk; van Beuningen, Rinie; Honkakoski, Paavo; Poso, Antti; Kronenberger, Thales; Pavek, Petr, 2024, Environmental science and technology, 58, 16, 6913-6923. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

First-in-class MKK4 inhibitors enhance liver regeneration and prevent liver failure

Zwirner, Stefan; Abu Rmilah, Anan A; Klotz, Sabrina; Pfaffenroth, Bent; Kloevekorn, Philip; Moschopoulou, Athina A; Schuette, Svenja; Haag, Mathias; Selig, Roland; Li, Kewei; Zhou, Wei; Nelson, Erek; Poso, Antti; Chen, Harvey; Amiot, Bruce; Jia, Yao; Minshew, Anna; Michalak, Gregory; Cui, Wei; Rist, Elke; Longerich, Thomas; Jung, Birgit; Felgendreff, Philipp; Trompak, Omelyan; Premsrirut, Prem K; Gries, Katharina; Muerdter, Thomas E; Heinkele, Georg; Wuestefeld, Torsten; Shapiro, David; Weissbac, 2024, Cell, 187, 7, 1666–1684. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Halogen Bonding on Water─A Drop in the Ocean?

Engelhardt, Marc U.; Zimmermann, Markus O.; Dammann, Marcel; Stahlecker, Jason; Poso, Antti; Kronenberger, Thales; Kunick, Conrad; Stehle, Thilo; Boeckler, Frank M., 2024, Journal of chemical theory and computation, 20, 23, 10716-10730. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Linking ATP and allosteric sites to achieve superadditive binding with bivalent EGFR kinase inhibitors

Wittlinger, Florian; Ogboo, Blessing C; Shevchenko, Ekaterina; Damghani, Tahereh; Pham, Calvin D; Schaeffner, Ilse K; Oligny, Brandon T; Chitnis, Surbhi P; Beyett, Tyler S; Rasch, Alexander; Buckley, Brian; Urul, Daniel A; Shaurova, Tatiana; May, Earl W; Schaefer, Erik M; Eck, Michael J; Hershberger, Pamela A; Poso, Antti; Laufer, Stefan A; Heppner, David E, 2024, Communications chemistry, 7, 1, 38. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Lääkkeen vaikutuskohteen tietokonemalleista apua yksilöidyn syöpälääkkeen valintaan

Bartos, Piia; Kuittinen, Outi; Poso, Antti, 2024, Duodecim, 140, 20, 1703-9. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Pyrazinyl-Substituted Aminoazoles as Covalent Inhibitors of Thrombin: Synthesis, Structure, and Anticoagulant Properties

Imberg, Lukas; Siutkina, Alena I; Erbacher, Catharina; Schmidt, Judith; Broekmans, Darius F; Ovsepyan, Ruzanna A; Daniliuc, Constantin G; de Oliveira, Ellen Goncalves; Serafim, Mateus Sa Magalhaes; O'Donoghue, Anthony J; Pillaiyar, Thanigaimalai; Panteleev, Mikhail A; Poso, Antti; Kalinina, Svetlana A; Bermudez, Marcel; Nekipelov, Katrin; Bendas, Gerd; Karst, Uwe; Kalinin, Dmitrii V, 2024, ACS pharmacology & translational science, 2025; 8, 1, 146-172. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Solid-State NMR Validation of OPLS4: Structure of PC-Lipid Bilayers and Its Modulation by Dehydration

Kurki, Milla; Nesterenko, Alexey M; Alsaker, Nicolai E; M Ferreira, Tiago; Kyllönen, Sami; Poso, Antti; Bartos, Piia; Miettinen, Markus S, 2024, Journal of physical chemistry b, 128, 50, 12483-12492. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Targeting Cyclophilin A in the Cardiac Microenvironment Preserves Heart Function and Structure in Failing Hearts

Sigle, Manuel; Rohlfing, Anne-Katrin; Cruz Santos, Melanie; Kopp, Timo; Krutzke, Konstantin; Gidlund, Vincent; Kollotzek, Ferdinand; Marzi, Julia; von Ungern-Sternberg, Saskia; Poso, Antti; Heikenwälder, Mathias; Schenke-Layland, Katja; Seizer, Peter; Möllmann, Julia; Marx, Nikolaus; Feil, Robert; Feil, Susanne; Lukowski, Robert; Borst, Oliver; Schäffer, Tilman E.; Müller, Karin Anne Lydia; Gawaz, Meinrad P; Heinzmann, David, 2024, Circulation research, 135, 7, 758-773. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The comprehensive SARS-CoV-2 ‘hijackome’ knowledge base

Huuskonen, Sini; Liu, Xiaonan; Pöhner, Ina; Redchuk, Taras; Salokas, Kari; Lundberg, Rickard; Maljanen, Sari; Belik, Milja; Reinholm, Arttu; Kolehmainen, Pekka; Tuhkala, Antti; Tripathi, Garima; Laine, Pia; Belanov, Sergei; Auvinen, Petri; Vartiainen, Maria; Keskitalo, Salla; Österlund, Pamela; Laine, Larissa; Poso, Antti; Julkunen, Ilkka; Kakkola, Laura; Varjosalo, Markku, 2024, Cell discovery, 10, 1, 125. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The molecular interaction pattern of lenvatinib enables inhibition of wild-type or kinase-mutated FGFR2-driven cholangiocarcinoma

Spahn, Stephan; Kleinhenz, Fabian; Shevchenko, Ekaterina; Stahl, Aaron; Rasen, Yvonne; Geisler, Christine; Ruhm, Kristina; Klaumuenzer, Marion; Kronenberger, Thales; Laufer, Stefan A; Sundberg-Malek, Holly; Bui, Khac Cuong; Horger, Marius; Biskup, Saskia; Schulze-Osthoff, Klaus; Templin, Markus; Malek, Nisar P; Poso, Antti; Bitzer, Michael, 2024, Nature communications, 15, 1, 1287. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

1,3-Diphenylureido hydroxamate as a promising scaffold for generation of potent antimalarial histone deacetylase inhibitors

Tavares, Maurício T; Krüger, Arne; Yan, Sun L Rei; Waitman, Karoline B; Gomes, Vinícius M; de Oliveira, Daffiny Sumam; Paz, Franciarli; Hilscher, Sebastian; Schutkowski, Mike; Sippl, Wolfgang; Ruiz, Claudia; Toledo, Mônica F Z J; Hassimotto, Neuza M A; Machado-Neto, João A; Poso, Antti; Cameron, Michael D; Bannister, Thomas D; Palmisano, Giuseppe; Wrenger, Carsten; Kronenberger, Thales; Parise-Filho, Roberto, 2023, Scientific reports, 13, 1, 21006. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Characterization of Potent ABCG2 Inhibitor Derived from Chromone: From the Mechanism of Inhibition to Human Extracellular Vesicles for Drug Delivery

Valdameri, Glaucio; Kita, Diogo Henrique; Dutra, Julia de Paula; Gomes, Diego Lima; Tonduru, Arun Kumar; Kronenberger, Thales; Gavinho, Bruno; Rossi, Izadora Volpato; Carvalho, Mariana Mazetto de; Pérès, Basile; Zattoni, Ingrid Fatima; Rego, Fabiane Gomes de Moraes; Picheth, Geraldo; Freitas, Rilton Alves de; Poso, Antti; Ambudkar, Suresh V.; Ramirez, Marcel I.; Boumendjel, Ahcène; Moure, Vivian Rotuno, 2023, Pharmaceutics, 15, 4, 1259. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Design and Optimization of Novel Benzimidazole- and Imidazo[4,5-b]pyridine-Based ATM Kinase Inhibitors with Subnanomolar Activities

Dimitrov, Teodor; Moschopoulou, Athina Anastasia; Seidel, Lennart; Kronenberger, Thales; Kudolo, Mark; Poso, Antti; Geibel, Christian; Wölffing, Pascal; Dauch, Daniel; Zender, Lars; Schollmeyer, Dieter; Bajorath, Jürgen; Forster, Michael; Laufer, Stefan, 2023, Journal of medicinal chemistry, 66, 11, 7304-7330. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Development of Ligands for the Super Conserved Orphan G Protein-Coupled Receptor GPR27 with Improved Efficacy and Potency

Pillaiyar, Thanigaimalai; Wozniak, Monika; Abboud, Dayana; Rasch, Alexander; Liebing, Aenne-Dorothea; Poso, Antti; Kronenberger, Thales; Stäubert, Claudia; Laufer, Stefan A; Hanson, Julien, 2023, Journal of medicinal chemistry, 66, 24, 17118-17137. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Direct pathway cloning and expression of the radiosumin biosynthetic gene cluster

Ouyang, Xiaodan; D'Agostino, Paul M; Wahlsten, Matti; Delbaje, Endrews; Jokela, Jouni; Permi, Perttu; Gaiani, Greta; Poso, Antti; Bartos, Piia; Gulder, Tobias AM; Koistinen, Hannu; Fewer, David P, 2023, Organic and biomolecular chemistry, 21, 23, 4893-4908. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Farmaseuttinen kemia

Jarho, Pekka; Lahtela-Kakkonen, Maija; Vepsäläinen, Jouko; Rautio, Jarkko; Huttunen, Kristiina; Poso, Antti; Auriola, Seppo, 2023, Publications of the University of Eastern Finland : general series, 44, 32-35. E1 Yleistajuinen artikkeli, sanomalehtiartikkeli

Machine Learning-Boosted Docking Enables the Efficient Structure-Based Virtual Screening of Giga-Scale Enumerated Chemical Libraries

Sivula, Toni; Yetukuri, Laxman; Kalliokoski, Tuomo; Käsnänen, Heikki; Poso, Antti; Pöhner, Ina, 2023, Journal of chemical information and modeling, 63, 18, 5773-5783. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Shifting the selectivity of pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one inhibitors towards the salt-inducible kinase (SIK) subfamily

Rak, Marcel; Tesch, Roberta; Berger, Lena M; Shevchenko, Ekaterina; Raab, Monika; Tjaden, Amelie; Zhubi, Rezart; Balourdas, Dimitrios-Ilias; Joerger, Andreas C; Poso, Antti; Krämer, Andreas; Elson, Lewis; Lučić, Aleksandar; Kronenberger, Thales; Hanke, Thomas; Strebhardt, Klaus; Sanhaji, Mourad; Knapp, Stefan, 2023, European journal of medicinal chemistry, 254, 115347. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Sodium-Dependent Neutral Amino Acid Transporter 2 Can Serve as a Tertiary Carrier for l -Type Amino Acid Transporter 1-Utilizing Prodrugs

Huttunen, Johanna; Kronenberger, Thales; Montaser, Ahmed B.; Králová, Adéla; Terasaki, Tetsuya; Poso, Antti; Huttunen, Kristiina M., 2023, Molecular pharmaceutics, 20, 2, 1331-1346. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structural and molecular characterization of lopinavir and ivermectin as breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2) inhibitors

Dutra, Julia de Paula; Scheiffer, Gustavo; Kronenberger, Thales; Gomes, Lucas Julian Cruz; Zanzarini, Isadora; dos Santos, Kelly Karoline; Tonduru, Arun K.; Poso, Antti; Rego, Fabiane Gomes de Moraes; Picheth, Geraldo; Valdameri, Glaucio; Moure, Vivian Rotuno, 2023, Excli journal, 22, 1155-1172. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-based discovery of thiosemicarbazones as SARS-CoV-2 main protease inhibitors

Maltarollo, Vinicius Goncalves; da Silva, Elany Barbosa; Kronenberger, Thales; Andrade, Marina Mol Sena; Marques, Gabriel V. de Lima; Oliveira, Nereu J. Candido; Santos, Lucianna H.; Rezende Junior, Celso de Oliveira; Martinho, Ana C. Cassiano; Skinner, Danielle; Fajtova, Pavla; Fernandes, Thais H.; dos Santos, Eduardo da Silveira; Gazolla, Poliana A. Rodrigues; de Souza, Ana P. Martins; da Silva, Milene Lopes; dos Santos, Fabiola S.; Lavorato, Stefania N.; Bretas, Ana C. Oliveira; Carvalho, Dio, 2023, Future medicinal chemistry, 15, 11, 959-985. B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä

Targeting Glial Cells by Organic Anion-Transporting Polypeptide 1C1 (OATP1C1)-Utilizing l-Thyroxine-Derived Prodrugs

Tonduru, Arun Kumar; Maljaei, Seyed Hamed; Adla, Santosh Kumar; Anamea, Landry; Tampio, Janne; Králová, Adéla; Jalkanen, Aaro J; Espada, Catarina; Santos, Inês Falcato; Montaser, Ahmed B; Rautio, Jarkko; Kronenberger, Thales; Poso, Antti; Huttunen, Kristiina M, 2023, Journal of medicinal chemistry, 66, 22, 15094-15114. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Trypanosoma cruzi Sirtuin 2 as a Relevant Druggable Target: New Inhibitors Developed by Computer-Aided Drug Design

Ferreira, Glaucio Monteiro; Kronenberger, Thales; Maltarollo, Vinicius Gonçalves; Poso, Antti; de Moura Gatti, Fernando; Almeida, Vitor Medeiros; Marana, Sandro Roberto; Lopes, Carla Duque; Tezuka, Daiane Yukie; de Albuquerque, Sérgio; da Silva Emery, Flavio; Trossini, Gustavo Henrique Goulart, 2023, Pharmaceuticals, 16, 3, 428. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Virtual Screening Assisted Search for Inhibitors of the Translocated Intimin Receptor of Enteropathogenic Escherichia Coli

Pylkkö, Tuomas; Tomašič, Tihomir; Poso, Antti; Tammela, Päivi, 2023, Chembiochem, 2024; 25, 2, e202300638. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Amide-functionalized 1,2,4-Triazol-5-amines as Covalent Inhibitors of Blood Coagulation Factor XIIa and Thrombin

Imberg, Lukas; Platte, Simon; Erbacher, Catharina; Daniliuc, Constantin G.; Kalinina, Svetlana A.; Dörner, Wolfgang; Poso, Antti; Karst, Uwe; Kalinin, Dmitrii V., 2022, ACS pharmacology & translational science, 5, 12, 1318-1347. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparative Modelling of Organic Anion Transporting Polypeptides: Structural Insights and Comparison of Binding Modes

Tonduru, Arun Kumar; Adla, Santosh Kumar; Huttunen, Kristiina M.; Kronenberger, Thales; Poso, Antti, 2022, Molecules, 27, 23, 8531. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery and Development of First-in-Class ACKR3/CXCR7 Superagonists for Platelet Degranulation Modulation

Bayrak, Alp; Mohr, Florian; Kolb, Kyra; Szpakowska, Martyna; Shevchenko, Ekaterina; Dicenta, Valerie; Rohlfing, Anne-Katrin; Kudolo, Mark; Pantsar, Tatu; Günther, Marcel; Kaczor, Agnieszka A.; Poso, Antti; Chevigné, Andy; Pillaiyar, Thanigaimalai; Gawaz, Meinrad; Laufer, Stefan A., 2022, Journal of medicinal chemistry, 65, 19, 13365–13384. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Do Go Chasing Waterfalls: Enoyl Reductase (FabI) in Complex with Inhibitors Stabilizes the Tetrameric Structure and Opens Water Channels

Maltarollo, Vinicius Gonçalves; Shevchenko, Ekaterina; Lima, Igor Daniel de Miranda; Cino, Elio A; Ferreira, Glaucio Monteiro; Poso, Antti; Kronenberger, Thales, 2022, Journal of chemical information and modeling, 66, 22, 5746-5761. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Effects of PCSK9 missense variants on molecular conformation and biological activity in transfected HEK293FT cells

Los, Bruna; Monteiro Ferreira, Glaucio; Bassani Borges, Jéssica; Kronenberger, Thales; Fernandes de Oliveira, Victor; Dagli-Hernandez, Carolina; Hernandes Bortolin, Raul; Marques Gonçalves, Rodrigo; Arpad Faludi, Andre; Akira Mori, Augusto; Kristini Almendros Barbosa, Thais; Caroline Costa de Freitas, Renata; Elim Jannes, Cinthia; da Costa Pereira, Alexandre; Medeiros Bastos, Gisele; Poso, Antti; Dominguez Crespo Hirata, Rosario; Hiroyuki Hirata, Mario, 2022, Gene, 2023; 851, 146979. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Funnel metadynamics and behavioral studies reveal complex effect of D2AAK1 ligand on anxiety-like processes

Bartuzi, Damian; Kędzierska, Ewa; Targowska-Duda, Katarzyna M.; Koszła, Oliwia; Wróbel, Tomasz M.; Jademyr, Simon; Karcz, Tadeusz; Szczepańska, Katarzyna; Stępnicki, Piotr; Wronikowska-Denysiuk, Olga; Biała, Grażyna; Handzlik, Jadwiga; Kristensen, Jesper L.; Poso, Antti; Kaczor, Agnieszka A., 2022, Scientific reports, 12, 1, 21192. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Inhibitor induced conformational changes in SARS-COV-2 papain-like protease

Ferreira, Glaucio Monteiro; Pillaiyar, Thanigaimalai; Hirata, Mario Hiroyuki; Poso, Antti; Kronenberger, Thales, 2022, Scientific reports, 12, 1, 11585. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Small-Molecule Thioesters as SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors: Enzyme Inhibition, Structure–Activity Relationships, Antiviral Activity, and X-ray Structure Determination

Pillaiyar, Thanigaimalai; Flury, Philipp; Krüger, Nadine; Su, Haixia; Schäkel, Laura; Barbosa Da Silva, Elany; Eppler, Olga; Kronenberger, Thales; Nie, Tianqing; Luedtke, Stephanie; Rocha, Cheila; Sylvester, Katharina; Petry, Marvin RI; McKerrow, James H; Poso, Antti; Pöhlmann, Stefan; Gütschow, Michael; O’Donoghue, Anthony J; Xu, Yechun; Müller, Christa E; Laufer, Stefan A, 2022, Journal of medicinal chemistry, 65, 13, 9376-9395. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structural Features Affecting the Interactions and Transportability of LAT1-Targeted Phenylalanine Drug Conjugates

Bahrami, Katayun; Järvinen, Juulia; Laitinen, Tuomo; Reinisalo, Mika; Honkakoski, Paavo; Poso, Antti; Huttunen, Kristiina M.; Rautio, Jarkko, 2022, Molecular pharmaceutics, 2023; 20, 1, 206-218. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure of POPC Lipid Bilayers in OPLS3e Force Field

Kurki, Milla; Poso, Antti; Bartos, Piia; Miettinen, Markus S, 2022, Journal of chemical information and modeling, 62, 24, 6462–6474. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-Based Identification of Naphthoquinones and Derivatives as Novel Inhibitors of Main Protease Mpro and Papain-like Protease PLpro of SARS-CoV-2

Santos, Lucianna H.; Kronenberger, Thales; Almeida, Renata G.; Silva, Elany B.; Rocha, Rafael E. O.; Oliveira, Joyce C.; Barreto, Luiza V.; Skinner, Danielle; Fajtová, Pavla; Giardini, Miriam A.; Woodworth, Brendon; Bardine, Conner; Lourenço, André L.; Craik, Charles S.; Poso, Antti; Podust, Larissa M.; McKerrow, James H.; Siqueira-Neto, Jair L.; O’Donoghue, Anthony J.; da Silva Júnior, Eufrânio N.; Ferreira, Rafaela S., 2022, Journal of chemical information and modeling, 62, 24, 6553-6573. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Synthesis and evaluation of 1,2,3-dithiazole inhibitors of the nucleocapsid protein of feline immunodeficiency virus (FIV) as a model for HIV infection

Laitinen, Tuomo; Meili, Theres; Koyioni, Maria; Koutentis, Panayiotis A; Poso, Antti; Hofmann-Lehmann, Regina; Asquith, Christopher RM, 2022, Bioorganic and medicinal chemistry, 68, 116834. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The Use of Lymphocyte Stimulation Test in Severe Nabumetone-Induced Stevens-Johnson Syndrome: A Case Report

Harvima, Rauno J; Harvima, Ilkka T; Poso, Antti; Rysä , Jaana; Ojala, Raimo, 2022, Journal of clinical case reports, 12, 8, 1520. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

WaterMap‐Guided Structure‐Based Virtual Screening for Acetylcholinesterase Inhibitors

Targowska‐Duda, Katarzyna M.; Maj, Maciej; Drączkowski, Piotr; Budzyńska, Barbara; Boguszewska‐Czubara, Anna; Wróbel, Tomasz M.; Laitinen, Tuomo; Kaczmar, Patrycja; Poso, Antti; Kaczor, Agnieszka A., 2022, Chemmedchem, 17, 8, e202100721. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

When the two become one: conformational changes in FXR/RXR heterodimers bound to steroidal antagonists

Díaz-Holguín, Alejandro; Rashidian, Azam; Pijnenburg, Dirk; Ferreira, Glaucio Monteiro; Stefela, Alzbeta; Kaspar, Miroslav; Kudova, Eva; Poso, Antti; van Beuningen, Rinie; Pavek, Petr; Kronenberger, Thales, 2022, Chemmedchem, 2023; 18, 4, e202200556. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

A new porphyrin as selective substrate-based inhibitor of breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2)

Zattoni, Ingrid Fatima; Kronenberger, Thales; Kita, Diogo Henrique; Guanaes, Lais Danciguer; Guimarães, Matheus Murmel; de Oliveira Prado, Larissa; Ziasch, Melanie; Vesga, Luis C.; Gomes de Moraes Rego, Fabiane; Picheth, Geraldo; Gonçalves, Marcos Brown; Noseda, Miguel D.; Ducatti, Diogo R.B.; Poso, Antti; Robey, Robert W.; Ambudkar, Suresh V.; Moure, Vivian Rotuno; Gonçalves, Alan Guilherme; Valdameri, Glaucio, 2021, Chemico-biological interactions, 351, 109718. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Docking-Based 3D-QSAR Studies for 1,3,4-oxadiazol-2-one Derivatives as FAAH Inhibitors

Zieba, Agata; Laitinen, Tuomo; Patel, Jayendra Z.; Poso, Antti; Kaczor, Agnieszka A., 2021, International journal of molecular sciences, 22, 11, 6108. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

In vitro identification and in vivo confirmation of inhibitors for SPCSV RNA silencing suppressor, a viral RNase III

Wang, Linping; Poque, Sylvain; Laamanen, Karoliina; Saarela, Jani; Poso, Antti; Laitinen, Tuomo; Valkonen, Jari PT, 2021, Journal of virology, 95, 12, e00107-21. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Inhibition of prolyl oligopeptidase: A promising pathway to prevent the progression of age-related macular degeneration

Hellinen, Laura; Koskela, Ali; Vattulainen, Elina; Liukkonen, Mikko; Wegler, Christine; Treyer, Andrea; Handin, Niklas; Svensson, Richard; Myöhänen, Timo; Poso, Antti; Kaarniranta, Kai; Artursson, Per; Urtti, Arto, 2021, Biomedicine and pharmacotherapy, 2022; 146, 112501. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

LXRα activation and Raf inhibition trigger lethal lipotoxicity in liver cancer

Rudalska, Ramona; Harbig, Jule; Snaebjornsson, Marteinn T; Klotz, Sabrina; Zwirner, Stefan; Taranets, Liudmyla; Heinzmann, Florian; Kronenberger, Thales; Forster, Michael; Cui, Wei; D'Artista, Luana; Einig, Elias; Hinterleitner, Martina; Schmitz, Werner; Dylawerska, Agata; Kang, Tae-Won; Poso, Antti; Rosenfeldt, Mathias T; Malek, Nisar P; Bitzer, Michael; et al., 2021, Nature cancer, 2, 2, 201-217. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Ligand Accessibility Insights to the Dengue virus NS3-NS2B Protease Assessed by long-timescale Molecular Dynamics Simulations

Kronenberger, Thales; Sa Magalhaes Serafim, Mateus; Kumar Tonduru, Arun; Goncalves Maltarollo, Vinicius; Poso, Antti, 2021, Chemmedchem, 16, 16, 2524-2534. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Molecular characteristics supporting L-Type amino acid transporter 1 (LAT1)-mediated translocation

Kärkkäinen, Jussi; Laitinen, Tuomo; Markowicz-Piasecka, Magdalena; Montaser, Ahmed; Lehtonen, Marko; Rautio, Jarkko; Gynther, Mikko; Poso, Antti; Huttunen, Kristiina M, 2021, Bioorganic chemistry, 112, 104921. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Neurosteroids: Structure-Uptake Relationships and Computational Modeling of Organic Anion Transporting Polypeptides (OATP)1A2

Adla, Santosh Kumar; Tonduru, Arun Kumar; Kronenberger, Thales; Kudova, Eva; Poso, Antti; Huttunen, Kristiina M., 2021, Molecules, 26, 18, 5662. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Potent Inhibitor of Human Trypsins from the Aeruginosin Family of Natural Products

Ahmed, Muhammad N.; Wahlsten, Matti; Jokela, Jouni; Nees, Matthias; Stenman, Ulf-Håkan; Alvarenga, Danillo O.; Strandin, Tomas; Sivonen, Kaarina; Poso, Antti; Permi, Perttu; Metsä-Ketelä, Mikko; Koistinen, Hannu; Fewer, David P., 2021, Acs chemical biology, 16, 11, 2537-2546. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

SARS-COV-2 Mpro conformational changes induced by covalently bound ligands

Ferreira, Glaucio Monteiro; Kronenberger, Thales; Tonduru, Arun Kumar; Hirata, Rosario Dominguez, Crespo; Hirata, Mario Hiroyuki; Poso, Antti, 2021, Journal of biomolecular structure and dynamics, Published online: 13 Sep 2021, 1 - 11. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

SARS-CoV-2--host proteome interactions for antiviral drug discovery

Liu, Xiaonan; Huuskonen, Sini; Laitinen, Tuomo; Redchuk, Taras; Bogacheva, Mariia; Salokas, Kari; Pöhner, Ina; Öhman, Tiina; Tonduru, Arun Kumar; Hassinen, Antti; Gawriyski, Lisa; Keskitalo, Salla; Vartiainen, Maria K.; Pietiäinen, Vilja; Poso, Antti; Varjosalo, Markku, 2021, Molecular systems biology, 17, 11, e10396. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structural Characterization of LsrK as a Quorum Sensing Target and a Comparison between X-ray and Homology Models

Medarametla, Prasanthi; Kronenberger, Thales; Laitinen, Tuomo; Poso, Antti, 2021, Journal of chemical information and modeling, 61, 3, 1346-1353. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-Based Design of Selective Salt-Inducible Kinase Inhibitors

Tesch, R; Rak, M; Raab, M; Berger, LM; Kronenberger, T; Joerger, AC; Berger, BT; Abdi, I; Hanke, T; Poso, A; Strebhardt, K; Sanhaji, M; Knapp, S, 2021, Journal of medicinal chemistry, 64, 12, 8142-8160. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Targeting extracellular and juxtamembrane FGFR2 mutations in chemotherapy-refractory cholangiocarcinoma

Bitzer, Michael; Spahn, Stephan; Babaei, Sepideh; Horger, Marius; Singer, Stephan; Schulze-Osthoff, Klaus; Missios, Pavlos; Gatidis, Sergios; Nann, Dominik Mattern, Sven; Scheble, Veit; Nikolaou, Konstantin; Armeanu-Ebinger, Sorin; Schulze, Martin; Schroeder, Christopher; Biskup, Saskia; Beha, Janina; Claassen, Manfred; Ruhm, Kristina; Poso, Antti et al, 2021, npj precision oncology, 5, 1, 80. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Tetrahydroquinoline/4,5-Dihydroisoxazole Molecular Hybrids as Inhibitors of Breast Cancer Resistance Protein (BCRP/ABCG2)

Vesga, Luis C; Kronenberger, Thales; Tonduru, Arun Kumar; Kita, Diogo Henrique; Zattoni, Ingrid Fatima; Bernal, Cristian Camilo; Bohorquez, Arnold R Romero; Mendez-Sanchez, Stelia Carolina; Ambudkar, Suresh V; Valdameri, Glaucio; Poso, Antti, 2021, Chemmedchem, 16, 17, 2686-2694. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The Future of Medicinal Chemistry, PROTAC, and Undruggable Drug Targets

Poso, Antti, 2021, Journal of medicinal chemistry, 64, 15, 10680-10681. B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä

Virus structure and structure-based antivirals

Plavec, Zlatka; Pöhner, Ina; Poso, Antti; Butcher, Sarah J, 2021, Current opinion in virology, 51, 16-24. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Acylated 1 H-1,2,4-Triazol-5-amines Targeting Human Coagulation Factor XIIa and Thrombin: Conventional and Microscale Synthesis, Anticoagulant Properties, and Mechanism of Action

Korff, Marvin; Imberg, Lukas; Will, Jonas M; Bückreiß, Nico; Kalinina, Svetlana A; Wenzel, Benjamin M; Kastner, Gregor A; Daniliuc, Constantin G; Barth, Maximilian; Ovsepyan, Ruzanna A; Butov, Kirill R; Humpf, Hans-Ulrich; Lehr, Matthias; Panteleev, Mikhail A; Poso, Antti; Karst, Uwe; Steinmetzer, Torsten; Bendas, Gerd; Kalinin, Dmitrii V, 2020, Journal of medicinal chemistry, 63, 21, 13159-13186. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Antimicrobial and Antifungal Activity of Rare Substituted 1,2,3-Thiaselenazoles and Corresponding Matched Pair 1,2,3-Dithiazoles

Laitinen, Tuomo; Baranovsky, Ilia V; Konstantinova, Lidia S; Poso, Antti; Rakitin, Oleg A; Asquith, Christopher RM, 2020, Antibiotics, 9, 7, E369. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Deep Learning in Drug Target Interaction Prediction: Current and Future Perspective

Abbasi, Karim; Razzaghi, Parvin; Poso, Antti; Ghanbari-Ara, Saber; Masoudi-Nejad, Ali, 2020, Current medicinal chemistry, 27, 1-14. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

DeepCDA: Deep Cross-Domain Compound-Protein Affinity Prediction through LSTM and Convolutional Neural Networks

Abbasi, Karim; Razzaghi, Parvin; Poso, Antti; Amanlou, Massoud; Ghasemi, Jahan B; Masoudi-Nejad, Ali, 2020, Bioinformatics, 36, 17, 4633-4642. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Design, Synthesis and Biological Activity of Novel Substituted 3-benzoic Acid Derivatives as MtDHFR Inhibitors

Kronenberger, Thales; Ferreira, Glaucio Monteiro; de Souza, Alfredo Danilo Ferreira; da Silva Santos, Soraya; Poso, Antti; Ribeiro, João Augusto; Tavares, Maurício Temotheo; Pavan, Fernando Rogério; Trossini, Gustavo Henrique Goulart; Dias, Marcio Vinícius Bertacine; Parise-Filho, Roberto, 2020, Bioorganic and medicinal chemistry, 28, 15, 115600. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Evaluation of FASN inhibitors by a versatile toolkit reveals differences in pharmacology between human and rodent FASN preparations and in antiproliferative efficacy in vitro vs. in situ in human cancer cells

Singha, Prosanta; Mäklin, Kiira; Vihavainen, Taina; Laitinen, Tuomo; Nevalainen, Tapio; Patil, Mahadeo; Tonduru, Arun; Poso, Antti; Laitinen, Jarmo; Savinainen, Juha, 2020, European journal of pharmaceutical sciences, 149, 105321. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Molecular Modeling of Protein Kinases: Current Status and Challenges

Poso, Antti, 2020, Laufer, Stefan, Proteinkinase Inhibitors, 25-41. B2 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Targeting the water network in cyclin G associated kinase (GAK) with 4-anilino-quin(az)oline inhibitors

Asquith, Christopher Robert Michael; Tizzard, Graham J; Bennett, James M; Wells, Carrow I; Elkins, Jonathan M; Willson, Timothy M; Poso, Antti; Laitinen, Tuomo, 2020, Chemmedchem, 15, 13, 1200-1215. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The application of machine learning techniques to innovative antibacterial discovery and development

Serafim, Mateus Sá Magalhães; Kronenberger, Thales; Oliveira, Patrícia Rufino; Poso, Antti; Honório, Káthia Maria; Mota, Bruno Eduardo Fernandes; Maltarollo, Vinícius Gonçalves, 2020, Expert opinion on drug discovery, 15, 10, 1165-1180. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The autoinhibited state of MKK4: Phosphorylation, putative dimerization and R134W mutant studied by molecular dynamics simulations

Shevchenko, Ekaterina; Poso, Antti; Pantsar, Tatu, 2020, Computational and Structural Biotechnology Journal, 18, 2687-2698. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Transcription and Translation Inhibitors in Cancer Treatment

Laham-Karam, Nihay; Pinto, Gaspar; Poso, Antti; Kokkonen, Piia, 2020, Frontiers in chemistry, 8, 276. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

DPD-Inspired Discovery of Novel LsrK Kinase Inhibitors: An Opportunity To Fight Antimicrobial Resistance

Stotani, Silvia; Gatta, Viviana; Medarametla, Prasanthi; Padmanaban, Mohan; Karawajczyk, Anna; Giordanetto, Fabrizio; Tammela, Päivi; Laitinen, Tuomo; Poso, Antti; Tzalis, Dimitros; Collina, Simona, 2019, Journal of medicinal chemistry, 62, 5, 2720-2737. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Deep Transferable Compound Representation across Domains and Tasks for Low Data Drug Discovery

Abbasi, Karim; Poso, Antti; Ghasemi, Jahanbakhsh; Amanlou, Massoud; Masoudi-Nejad, Ali, 2019, Journal of chemical information and modeling, 59, 11, 4528-4539. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Design and analysis of the 4-anilino-quin(az)oline kinase inhibition profiles of GAK/SLK/STK10 using quantitative structure activity relationships

Asquith, CRM; Laitinen, T; Bennett, JM; Wells, CI; Elkins, JM; Zuercher, WJ; Tizzard, G; Poso, A, 2019, Chemmedchem, 2020; 15, 1, 26-49. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Exploring the chemical space for freeze-drying excipients

Meng-Lund, Helena; Holm, Tobias Palle; Poso, Antti; Jorgensen, Lene; Rantanen, Jukka; Grohganz, Holger, 2019, International journal of pharmaceutics, 566, 254-263. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

In vitro and in silico evaluation of bikaverin as a potent inhibitor of human protein kinase CK2

Haidar, Samer; Aichele, Dagmar; Birus, Robin; Hielscher, Janine; Laitinen, Tuomo; Poso, Antti; Jose, Joachim, 2019, Molecules, 24, 7, 1380. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Investigation of the pentathiepin functionality as an inhibitor of Feline Immunodeficiency Virus (FIV) via a potential zinc ejection mechanism, as a model for HIV infection

Asquith, CRM; Laitinen, T; Konstantinova, LS; Tizzard, G; Poso, A; Rakitin, OA; Hofmann-Lehmann, R; Hilton, ST, 2019, Chemmedchem, 14, 4, 454-461. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Ligand- and Structure-Based Approaches of Escherichia coli FabI Inhibition by Triclosan Derivatives: From Chemical Similarity to Protein Dynamics Influence

Kronenberger, Thales; de Oliveira Fernades, Philipe; Drumond Franco, Isabella; Poso, Antti; Gonçalves Maltarollo, Vinícius, 2019, Chemmedchem, 14, 23, 1995-2004. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Pyridinylimidazoles as dual glycogen synthase kinase 3β/p38α mitogen-activated protein kinase inhibitors

Heider, Fabian; Ansideri, Francesco; Tesch, Roberta; Pantsar, Tatu; Haun, Urs; Döring, Eva; Kudolo, Mark; Poso, Antti; Albrecht, Wolfgang; Laufer, Stefan A; Koch, Pierre, 2019, European journal of medicinal chemistry, 175, 309-329. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The Universal 3D QSAR Model for Dopamine D2 Receptor Antagonists

Zieba, A; Zuk, J; Bartuzi, D; Matosiuk, D; Poso, A; Kaczor, AA, 2019, International journal of molecular sciences, 20, 18, 4555. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The inner rod of virulence-associated type III secretion systems constitutes a needle adapter of one helical turn that is deeply integrated into the system's export apparatus.

Torres-Vargas, CE; Kronenberger, T; Roos, N; Dietsche, T; Poso, A; Wagner, S, 2019, Molecular microbiology, 112, 3, 918-931. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Assessment of mutation probabilities of KRAS G12 missense mutants and their long-timescale dynamics by atomistic molecular simulations and Markov state modeling

Pantsar, Tatu; Rissanen, Sami; Dauch, Daniel; Laitinen, Tuomo; Vattulainen, Ilpo; Poso, Antti, 2018, PLoS computational biology, 14, 9, e1006458. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Binding Affinity via Docking: Fact and Fiction

Pantsar, Tatu; Poso, Antti, 2018, Molecules, 23, 8, 1899. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Molecular Modelling Approaches to Antibacterial Drug Design and Discovery

Kaczor, Agnieszka A; Medarametla, Prasanthi; Bartuzi, Damian; Kondej, Magdalena; Matosiuk, Dariusz; Poso, Antti, 2018, Rahman, Atta-ur; Choudhary, Iqbal M, Frontiers in Anti-Infective Drug Discovery, 153-222. B2 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Structure-based virtual screening of LsrK kinase inhibitors to target quorum sensing

Medarametla, Prasanthi; Gatta, Viviana; Kajander, Tommi; Laitinen, Tuomo; Tammela, Päivi; Poso Antti, 2018, Chemmedchem, 13, 22, 2400-2407. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The use of molecular descriptors in the development of co-amorphous formulations

Meng-Lund, Helena; Kasten, Georgia; Jensen, Katrina Tarp; Poso, Antti; Pantsar, Tatu; Rades, Thomas; Rantanen, Jukka; Grohganz, Holger, 2018, European journal of pharmaceutical sciences, 119, 31-38. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Whole grain intake associated molecule 5-aminovaleric acid betaine decreases ß-oxidation of fatty acids in mouse cardiomyocytes

Kärkkäinen, Olli; Tuomainen, Tomi; Koistinen, Ville; Tuomainen, Marjo; Leppänen, Jukka; Laitinen, Tuomo; Lehtonen, Marko; Rysä, Jaana; Auriola, Seppo; Poso, Antti; Tavi, Pasi; Hanhineva, Kati, 2018, Scientific reports, 8, 13036. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Correlation between calculated molecular descriptors of excipient amino acids and experimentally observed thermal stability of lysozyme

Meng-Lund Helena, Friis Natascha, van de Weert Marco, Rantanen Jukka, Poso Antti, Grohganz Holger, Jorgensen Lene, 2017, International journal of pharmaceutics, 523, 1, 238-245. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Design, Synthesis, and Biological Evaluation of 2,4-Dihydropyrano[2,3-c]pyrazole Derivatives as Autotaxin Inhibitors

Pantsar T, Singha P, Nevalainen TJ, Koshevoy I, Leppänen J, Poso A, Niskanen JMA, Pasonen-Seppänen S, Savinainen JR, Laitinen T, Laitinen JT, 2017, European journal of pharmaceutical sciences, 107, 97-111. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Development of Pharmacophore Model for Indeno[1,2-b]indoles as Human Protein Kinase CK2 Inhibitors and Database Mining

Haidar Samer, Bouaziz Zouhair, Marminon Christelle, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Le Borgne Marc, Jose Joachim, 2017, Pharmaceuticals, 10, 1, 8. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery of Small Molecules Targeting the Synergy of Cardiac Transcription Factors GATA4 and NKX2-5

Välimäki Mika J, Tölli Maria A, Kinnunen Sini M, Aro Jani, Serpi Raisa, Pohjolainen Lotta, Talman Virpi, Poso Antti, Ruskoaho Heikki J, 2017, Journal of medicinal chemistry, 60, 18, 7781-7798. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structural and Functional Characterization of Malate Synthase G from Opportunistic Pathogen Pseudomonas aeruginosa

McVey Alyssa C, Medarametla Prasanthi, Chee Xavier, Bartlett Sean, Poso Antti, Spring David R, Rahman Taufiq, Welch Martin, 2017, Biochemistry, 56, 41, 5539-5549. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structural review of PPAR gamma in complex with ligands: Cartesian-and dihedral angle principal component analyses of X-ray crystallographic data

Kaupang Asmund, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Hansen Trond Vidar, 2017, Proteins: structure function and bioinformatics, 85, 9, 1684-1698. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Surface area, volume and shape descriptors as a novel tool for polymer lead design and discovery

Christensen JR, Meng-Lund H, Grohganz H, Poso A, Laitinen T, Korhonen O, Jørgensen L, Pajander J, 2017, European journal of pharmaceutical sciences, 102, 188-195. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Virtual Screening of Transmembrane Serine Protease Inhibitors

Poso Antti, Tervonen Topi, Klefström Juha, 2017, Bio-protocol, 7, 8, 1-10. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

A MYC-aurora kinase A protein complex represents an actionable drug target in p53-altered liver cancer

Dauch Daniel, Rudalska Ramona, Cossa Giacomo, Nault Jean-Charles, Kang Tae-Won, Wuestefeld Torsten, Hohmeyer Anja, Imbeaud Sandrine, Yevsa Tetyana, Hoenicke Lisa, Pantsar Tatu, Bozko Przemyslaw, Malek Nisar P, Longerich Thomas, Laufer Stefan, Poso Antti, Zucman-Rossi Jessica, Eilers Martin, Zender Lars, 2016, Nature medicine, 22, 7, 744-753. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Common and Distinct Interactions of Chemical Inhibitors with Cytochrome P450 CYP1A2, CYP2A6 and CYP2B6 Enzymes

Raunio Hannu, Juvonen Risto O, Poso Antti, Lahtela-Kakkonen Maija, Rahnasto-Rilla Minna, 2016, Drug metabolism letters, 10, 1, 56-64. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Evaluation of Substituted 1,2,3-Dithiazoles as Inhibitors of the Feline Immunodeficiency Virus (FIV) Nucleocapsid Protein via a Proposed Zinc Ejection Mechanism

Asquith Christopher R, Konstantinova Lidia S, Laitinen Tuomo, Meli Marina L, Poso Antti, Rakitin Oleg A, Hofmann-Lehmann Regina, Hilton Stephen T, 2016, Chemmedchem, 11, 9, 2119-2126. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-Based Virtual Screening for Dopamine D2 Receptor Ligands as Potential Antipsychotics

Kaczor Agnieszka A, Silva Andrea G, Loza Maria I, Kolb Peter, Castro Marián, Poso Antti, 2016, Chemmedchem, 11, 7, 718-729. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The Effects of Sequence Variation on Genome-wide NRF2 Binding - New Target Genes and Regulatory SNPs

Kuosmanen Suvi M, Viitala Sari, Laitinen Tuomo, Peräkylä Mikael, Pölönen Petri, Kansanen Emilia, Leinonen Hanna, Raju Suresh, Wienecke-Baldacchino Anke, Närvänen Ale, Poso Antti, Heinäniemi Merja, Heikkinen Sami, Levonen Anna-Liisa, 2016, Nucleic acids research, 44, 4, 1760-1775. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Virtual Screening of Small Drug-Like Compounds Stimulating the Enzymatic Activity of Kallikrein-Related Peptidase3 (KLK3)

Ylikangas Henna, Mattsson Johanna M, Stenman Ulf-Håkan, Koistinen Hannu, Poso Antti, Lahtela-Kakkonen Maija, 2016, Chemmedchem, 11, 18, 2043-2049. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparative molecular field analysis and molecular dynamics studies of alpha/beta hydrolase domain containing 6 (ABHD6) inhibitors

Kaczor Agnieszka A, Targowska-Duda Katarzyna M, Patel Jayendra Z, Laitinen Tuomo, Parkkari Teija, Adams Yahaya, Nevalainen Tapio J, Poso Antti, 2015, Journal of molecular modeling, 21:250. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Deregulated hepsin protease activity confers oncogenicity by concomitantly augmenting HGF/MET signalling and disrupting epithelial cohesion

Tervonen TA, Belit¨kin D, Pant SM, Englund JI, Marques E, Ala-Hongisto H, Nevalaita L, Sihto H, Heikkilä P, Leidenius M, Hewitson K, Ramachandra M, Moilanen A, Joensuu H, Kovanen PE, Poso A, Klefström J, 2015, Oncogene, 35 (2016), 1832-1846. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Multi-Component Protein - Protein Docking Based Protocol with External Scoring for Modeling Dimers of G Protein-Coupled Receptors

Kaczor Agnieszka A, Guixà-González Ramon, Carrió Pau, Poso Antti, Dove Stefan, Pastor Manuel, Selent Jana, 2015, Molecular informatics, 34, 4, 246-255. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

New, Non-quinone Fluorogeldanamycin Derivatives Strongly Inhibit Hsp90

Hermane Jekaterina, Bulyszko Ilona, Eichner Simone, Sasse Florenz, Collisi Wera, Poso Antti, Schax Emilia, Walter Johanna-Gabriela, Scheper Thomas, Kock Klaus, Herrmann Christian, Aliuos Pooyan, Reuter Günter, Zeilinger Carsten, Kirschning Andreas, 2015, Chembiochem, 16, 2, 302-311. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Potent and selective N-(4-sulfamoylphenyl)thiourea-based GPR55 agonists

Yrjölä Sari, Parkkari Teija, Navia-Paldanius Dina, Laitinen Tuomo, Kaczor Agnieszka A, Kokkola Tarja, Adusei-Mensah Frank, Savinainen Juha R, Laitinen Jarmo T, Poso Antti, Alexander Amy, Penman June, Stott Lisa, Anskat Marie, Irving Andrew J, Nevalainen Tapio J, 2015, European journal of medicinal chemistry, 107 (2016), 119-132. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Prediction of human population responses to toxic compounds by a collaborative competition

Eduati Federica, Mangravite Lara M, Wang Tao, Tang Hao, Bare J Christopher, Huang Ruili, Norman Thea, Kellen Mike,, 2015, Nature biotechnology, 33, 9, 933-943. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Time-dependent inhibition of CYP2C19 by isoquinoline alkaloids: in vitro and in silico analysis

Salminen Kaisa A, Rahnasto-Rilla Minna, Vaananen Raija, Imming Peter, Meyer Achim, Horling Aline, Poso Antti, Laitinen Tuomo, Raunio Hannu, Lahtela-Kakkonen Maija, 2015, Drug metabolism and disposition, 43, 1891-1904. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Virtual screening approach of sirtuin inhibitors results in two new scaffolds

Kokkonen Piia, Kokkola Tarja, Suuronen Tiina, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija, 2015, European journal of pharmaceutical sciences, 76, 27-32. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Centmitor-1, a Novel Acridinyl-Acetohydrazide, Possesses Similar Molecular Interaction Field and Antimitotic Cellular Phenotype as Rigosertib, ON 01910.Na

Mäki-Jouppila Jenni H, Laine Leena J, Rehnberg Jonathan, Narvi Elli, Tiikkainen Pekka, Hukasova Elvira, Halonen Pasi, Lindqvist Arne, Kallio Lila, Poso Antti, Kallio Marko J, 2014, Molecular cancer therapeutics, 13, 1054-1066. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Evaluation of the antiviral efficacy of bis[1,2]dithiolo[1,4]thiazines and bis[1,2]dithiolopyrrole derivatives against the nucelocapsid protein of the Feline Immunodeficiency Virus (FIV) as a model for HIV infection

Asquith Christopher R, Meli Marina L, Konstantinova Lidia S, Laitinen Tuomo, Peräkylä Mikael, Poso Antti, Rakitin Oleg A, Allenspach Karin, Hofmann-Lehmann Regina, Hilton Stephen T, 2014, Bioorganic and medicinal chemistry letters, 24, 2640-2644. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Identification of structural features in chemicals associated with cancer drug response: a systematic data-driven analysis

Khan Suleiman A, Virtanen Seppo, Kallioniemi Olli P, Wennerberg Krister, Poso Antti, Kaski Samuel, 2014, Bioinformatics, 30, i497-i504. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

In Vitro Screening of Some Heterocyclic Compounds Against Human ABHD6 and ABHD12 Hydrolases

Kaczor Agnieszka A, Poso Antti, Pitucha Monika, 2014, Letters in drug design and discovery, 11, 944-952. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Integrative and Personalized QSAR Analysis in Cancer by Kernelized Bayesian Matrix Factorization

Ammad-ud-din Muhammad, Georgii Elisabeth, Gönen Mehmet, Laitinen Tuomo, Kallioniemi Olli, Wennerberg Krister, Poso Antti, Kaski Samuel, 2014, Journal of chemical information and modeling, 54, 2347-2359. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Investigation of novel ropinirole analogues: synthesis, pharmacological evaluation and computational analysis of dopamine D2 receptor functionalized congeners and homobivalent ligands

Jörg Manuela, Kaczor Agnieszka A, Mak Frankie S, Lee Kiew Ching K, Poso Antti, Miller Neil D, Scammells Peter J, Capuano Ben, 2014, Medchemcomm, 5, 891-898. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Novel fused tetrathiocines as antivirals that target the nucleocapsid zinc finger containing protein of the Feline Immunodeficiency Virus (FIV) as a model of HIV infection

Asquith Christopher R, Meli Marina L, Konstantinova Lidia S, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Rakitin Oleg A, Hofmann-Lehmann Regina, Allenspach Karin, Hilton Stephen T, 2014, Bioorganic and medicinal chemistry letters, 2015; 25, 6, 1352-1355. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Pharmacological and molecular studies on the interaction of varenicline with different nicotinic acetylcholine receptor subtypes. Potential mechanism underlying partial agonism at human alpha4ß2 and alpha3ß4 subtypes

Arias Hugo R, Feuerbach Dominik, Targowska-Duda Katarzyna, Kaczor Agnieszka A, Poso Antti, Jozwiak Krzysztof, 2014, Biochimica et biophysica acta: biomembranes, 2015; 1848, 731-741. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Quantitative Insight into the Design of Compounds Recognized by the L-Type Amino Acid Transporter 1 (LAT1)

Ylikangas Henna, Malmioja Kalle, Peura Lauri, Gynther Mikko, Nwachukwu Emmanuel O, Leppänen Jukka, Laine Krista, Rautio Jarkko, Lahtela-Kakkonen Maija, Huttunen Kristiina M, Poso Antti, 2014, Chemmedchem, 9, 2699-2707. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Quantitative insights for the design of substrate-based SIRT1 inhibitors

Kokkonen Piia, Mellini Paolo, Nyrhilä Olli, Rahnasto-Rilla Minna, Suuronen Tiina, Kiviranta Päivi, Huhtiniemi Tero, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija, 2014, European journal of pharmaceutical sciences, 59, 12-19. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Robust hydrolysis of prostaglandin glycerol esters by human monoacylglycerol lipase (MAGL)

Savinainen Juha R, Kansanen Emilia, Pantsar Tatu, Navia-Paldanius Dina, Parkkari Teija, Lehtonen Marko, Laitinen Tuomo, Nevalainen Tapio, Poso Antti, Levonen Anna-Liisa, Laitinen Jarmo T, 2014, Molecular pharmacology, Epub ahead of print. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Synthesis, in vitro and in vivo evaluation of 1,3,5-triazines as cannabinoid CB2 receptor agonists

Yrjölä Sari, Sarparanta Mirkka, Airaksinen Anu J, Hytti Maria, Kauppinen Anu, Pasonen-Seppänen Sanna, Adinolfi Barbara, Nieri Paola, Manera Clementina, Keinänen Outi, Poso Antti, Nevalainen Tapio J, Parkkari Teija, 2014, European journal of pharmaceutical sciences, 2015; 67, 85-96. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Synthesis, in vitro and in vivo studies, and molecular modeling of N-alkylated dextromethorphan derivatives as non-competitive inhibitors of alpha3beta4 nicotinic acetylcholine receptor

Jozwiak Krzysztof, Targowska-Duda Katarzyna M, Kaczor Agnieszka A, Kozak Joanna, Ligeza Agnieszka, Szacon Elzbieta, Wrobel Tomasz M, Budzynska Barbara, Biala Grazyna, Fornal Emilia, Poso Antti, Wainer Irving W, Matosiuk Dariusz, 2014, Bioorganic and medicinal chemistry, 22, 6846-6856. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Uusia yhdisteitä maksasyöpään

Poso Antti, Laitinen Tuomo, Zender Lars, Kalesse Markus, Laufer Stefan, 2014, Dosis, 30, 3, 205. B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä

1,3,4-Oxadiazol-2-ones as fatty-acid amide hydrolase and monoacylglycerol lipase inhibitors: Synthesis, in vitro evaluation and insight into potency and selectivity determinants by molecular modelling

Käsnänen Heikki, Minkkilä Anna, Taupila Susanna, Patel Jayendra Z, Parkkari Teija, Lahtela-Kakkonen Maija, Saario Susanna M, Nevalainen Tapio, Poso Antti, 2013, European journal of pharmaceutical sciences, 49, 423-433. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Chiral 1,3,4-oxadiazol-2-ones as highly selective FAAH inhibitors

Patel Jayendra Z, Parkkari Teija, Laitinen Tuomo, Kaczor Agnieszka A, Saario Susanna M, Savinainen Juha R, Navia-Paldanius Dina, Cipriano Mariateresa, Leppänen Jukka, Koshevoy Igor O, Poso Antti, Fowler Christopher J, Laitinen Jarmo T, Nevalainen Tapio, 2013, Journal of medicinal chemistry, 56, 8484-8496. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Experimental and computational studies on the tautomerism of N-substituted 3-amino-5-oxo-4-phenyl-1H-pyrazolo-1-carboxamides with antibacterial activity

Kaczor Agnieszka A, Wróbel Tomasz, Karczmarzyk Zbigniew, Wysocki Waldemar, Mendyk Ewaryst, Poso Antti, Matosiuk Dariusz, Pitucha Monika, 2013, Journal of molecular structure, 1051, 188-196. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Farmaseuttinen kemia - uudet haasteet Itä-Suomen yliopistossa

Nevalainen Tapio, Poso Antti, Rautio Jarkko, 2013, Ahonen R, Laitinen K, Lapinjoki S, Mensalo P, Ranta V-P, Ylikangas H (toim)., Muutosten vuosikymmen : Itä-Suomen yliopiston farmasian laitos 40 vuotta, 34-42. D2 Artikkeli ammatillisessa kokoomateoksessa (ml. toimittajan kirjoittama johdantoartikkeli)

Identification of novel SIRT3 inhibitor scaffolds by virtual screening

Salo Heikki S, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija, 2013, Bioorganic and medicinal chemistry letters, 23, 2990-2995. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Mutation of Cys242 of human monoacylglycerol lipase disrupts balanced hydrolysis of 1- and 2-monoacylglycerols and selectively impairs inhibitor potency

Laitinen Tuomo, Navia-Paldanius Dina, Rytilahti Roosa, Marjamaa Joona J, Karizkova Julie, Parkkari Teija, Pantsar Tatu, Poso Antti, Laitinen Jarmo T, Savinainen Juha R, 2013, Molecular pharmacology, 2014:85, 510-519. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Piperazine and piperidine triazole ureas as ultrapotent and highly selective inhibitors of monoacylglycerol lipase

Aaltonen Niina, Savinainen Juha R, Ribas Casandra R, Rönkkö Jani, Kuusisto Anne, Korhonen Jani, Navia-Paldanius Dina, Häyrinen Jukka, Takabe Piia, Käsnänen Heikki, Pantsar Tatu, Laitinen Tuomo, Lehtonen Marko, Pasonen-Seppänen Sanna, Poso Antti, Nevalainen Tapio, Laitinen Jarmo T, 2013, Chemistry and biology, 20, 379-390. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structural studies, homology modeling and molecular docking of novel noncompetitive antagonists of GluK1/GluK2 receptors

Kaczor Agnieszka A, Karczmarzyk Zbigniew, Fruziński Andrzej, Pihlaja Kalevi, Sinkkonen Jari, Wiinamäki Kirsti, Kronbach Christiane, Unverferth Klaus, Poso Antti, Matosiuk Dariusz, 2013, Bioorganic and medicinal chemistry, 2014:22, 787-795. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-based molecular modeling approaches to GPCR oligomerization

Kaczor Agnieszka A, Selent Jana, Poso Antti, 2013, P. Michael Conn, Receptor-Receptor Interactions, 91-104. B2 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Synthesis and biological evaluation of arylthiourea derivatives with antitubercular activity

Luo Rusong, Laitinen Tuomo, Teng Liyan, Nevalainen Tapio, Lahtela-Kakkonen Maija, Zheng Baofu, Wang Honghai, Poso Antti, Zhang Xuelian, 2013, Letters in drug design and discovery, 10, 7, 640-650. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comprehensive data-driven analysis of the impact of chemoinformatic structure on the genome-wide biological response profiles of cancer cells to 1159 drugs

Khan Suleiman A, Faisal Ali, Mpindi John P, Parkkinen Juuso A, Kalliokoski Tuomo, Poso Antti, Kallioniemi Olli P, Wennerberg Krister, Kaski Samuel, 2012, Bmc bioinformatics, 13, 112. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery of novel cannabinoid receptor ligands by a virtual screening approach: Further development of 2,4,6-trisubstituted 1,3,5-triazines as CB2 agonists

Yrjölä Sari, Kalliokoski Tuomo, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Parkkari Teija, Nevalainen Tapio, 2012, European journal of pharmaceutical sciences, 2013:48, 1-2, 9-20. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery of salermide-related sirtuin inhibitors: binding mode studies and antiproliferative effects in cancer cells including cancer stem cells

Rotili Dante, Tarantino Domenico, Nebbioso Angela, Paolini Chantal, Huidobro Covadonga, Lara Ester, Mellini Paolo, Lenoci Alessia, Pezzi Riccardo, Giorgia Botta, Lahtela-Kakkonen Maija, Poso Antti, Steinkuhler Christian, Gallinari Paola, De Maria Ruggero, Fraga Mario F, Esteller Manel, Altucci Lucia, Mai Antonello, 2012, Journal of medicinal chemistry, 55, 10937-10947. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Molecular dynamics simulations for human CAR inverse agonists

Jyrkkärinne Johanna, Küblbeck Jenni, Pulkkinen Juha, Honkakoski Paavo, Laatikainen Reino, Poso Antti, Laitinen Tuomo, 2012, Journal of chemical information and modeling, 52, 457-464. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Peptides and pseudopeptides as SIRT6 deacetylation inhibitors

Kokkonen Piia, Rahnasto-Rilla Minna, Kiviranta Päivi H, Huhtiniemi Tero, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija, 2012, Acs medicinal chemistry letters, 3, 969-974. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-activity relationship study of compounds binding to large amino acid transporter 1 (LAT1) based on pharmacophore modeling and in situ rat brain perfusion

Ylikangas Henna, Peura Lauri, Malmioja Kalle, Leppänen Jukka, Laine Krista, Poso Antti, Lahtela-Kakkonen Maija, Rautio Jarkko, 2012, European journal of pharmaceutical sciences, 2013:48, 523-531. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Constitutive activity and ligand-dependent activation of the nuclear reseptor CAR - insights from molecular dynamics simulations

Windshügel Björn, Poso Antti, 2011, Journal of molecular recognition, 24, 875-882. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Identification of novel CYP2A6 inhibitors by virtual screening

Rahnasto Minna K, Raunio Hannu A, Wittekindt Carsten, Salminen Kaisa A, Leppänen Jukka, Juvonen Risto O, Poso Antti, Lahtela-Kakkonen Maija K, 2011, Bioorganic and medicinal chemistry, 19, 7186-7193. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

New in vitro tools to study human constitutive androstane receptor (CAR) biology: discovery and comparison of human CAR inverse agonists

Küblbeck Jenni, Jyrkkärinne Johanna, Molnár Ferdinand, Kuningas Tiina, Patel Jayendra, Windshügel Björn, Nevalainen Tapio, Laitinen Tuomo, Sippl Wolfgang, Poso Antti, Honkakoski Paavo, 2011, Molecular pharmaceutics, 8, 2424-2433. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Structure-based design of pseudopeptidic inhibitors for SIRT1 and SIRT2

Huhtiniemi Tero, Salo Heikki S, Suuronen Tiina, Poso Antti, Salminen Antero, Leppänen Jukka, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija, 2011, Journal of medicinal chemistry, 54, 6456-6468. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Studying the catechol binding cavity in comparative models of human dopamine D2 receptor

Sakhteman Amirhossein, Lahtela-Kakkonen Maija, Poso Antti, 2011, Journal of molecular graphics and modelling, 29, 5, 685-692. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The discovery of compounds that stimulate the activity of kallikrein-related peptidase 3 (KLK3)

Härkönen Henna H, Mattsson Johanna M, Määttä Juha AE, Stenman Ulf-Håkan, Koistinen Hannu, Matero Sanni, Windshügel Björn, Poso Antti, Lahtela-Kakkonen Maija, 2011, Chemmedchem, 6, 12, 2170-2178. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

3-heterocycle-phenyl N-alkylcarbamates as FAAH inhibitors: desing, synthesis and 3D-QSAR studies

Käsnänen H, Myllymäki MJ, Minkkilä A, Kataja AO, Saario SM, Nevalainen T, Koskinen AMP & Poso A, 2010, Chemmedchem, 5, 213 - 231. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

ChemInform Abstract: The effect of ligand-based tautomer and protomer prediction on structure-based virtual screening

Kalliokoski T, Salo HS, Lahtela-Kakkonen M & Poso A, 2010, CHEMINFORM, 13, DOI: 10.1002/chin.201013212. E1 Yleistajuinen artikkeli, sanomalehtiartikkeli

Increasing the throughput of shape-based virtual screening with GPU processing and single conformation database

Kalliokoski T, Ronkko TP, Poso A, 2010, Molecular informatics, 29, 4, 293 - 296. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Chiral 3-(4,5-dihydrooxazol-2-yl)phenyl alkylcarbamates as novel FAAH inhibitors: Insight into FAAH enantioselectivity by molecular docking and interaction fields

Myllymäki MJ, Käsnänen H, Kataja AO, Lahtela-Kakkonen M, Saario SM, Poso A, Koskinen AMP, 2009, European journal of medicinal chemistry, 44, 4179-4191. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparison of structure fingerprint and molecular interaction field based methods in explaining biological simularity of small molecules in cell-based screens

Tiikkainen P, Poso A, Kallioniemi O, 2009, Journal of computer-aided molecular design, 23, 227-239. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Critical comparison of virtual screening methods against the MUV data set

Tiikkainen P, Markt P, Wolber G, Kirchmair J, Distinto S, Poso A, Kallioniemi O, 2009, Journal of chemical information and modeling, 49, 2168-2178. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Monitoring the wetting phase of fluidized bed granulation process using multi-way methods: The separation of successful from unsuccessful batches

Matero S, Poutiainen S, Leskinen J, Reinikainen S-P, Ketolainen J, Järvinen K, Poso A, 2009, Chemometrics and intelligent laboratory systems, 96, 88-93. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

N(epsilon)-Thioacetyl-lysine-containing tri-, tetra-, and pentapeptides as SIRT1 and SIRT2 inhibitors

Kiviranta PH, Suuronen T, Wallén EAA, Leppänen J, Tervonen J, Kyrylenko S, Salminen A, Poso A, Jarho EM, 2009, Journal of medicinal chemistry, 52, 2153-2156. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Screening of various hormone-sensitive lipase inhibitors as endocannabinoid-hydrolyzing enzyme inhibitors

Minkkilä A, Savinainen JR, Käsnänen H, Xhaard H, Nevalainen T, Laitinen JT, Poso A, Leppänen J, Saario SM, 2009, Chemmedchem, 4, 1253-1259. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The effect of ligand-based tautomer and protomer prediction on structure-based virtual screening

Kalliokoski T, Salo HS, Lahtela-Kakkonen M, Poso A, 2009, Journal of chemical information and modeling, 49, 2742-2748. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The feasibility of using acoustic emissions for monitoring of fluidized bed granulation

Matero S, Poutiainen S, Leskinen J, Järvinen K, Ketolainen J, Reinikainen S-P, Hakulinen M, Lappalainen R, Poso A, 2009, Chemometrics and intelligent laboratory systems, 97, 75-81. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Uncertainty in dissolution test of drug release

Paakkunainen M, Matero S, Ketolainen J, Lahtela-Kakkonen M, Poso A, Reinikainen S-P, 2009, Chemometrics and intelligent laboratory systems, 97, 82-90. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Characterization of the binding properties of SIRT2 inhibitors with a N-(3-phenylpropenoyl)-glycine tryptamide backbone

Kiviranta PH, Salo HS, Leppänen J, Rinne VM, Kyrylenko S, Kuusisto E, Suuronen T, Salminen A, Poso A, Lahtela-Kakkonen M, Wallén EAA, 2008, Bioorganic and medicinal chemistry, 16, 8054-8062. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery of boronic acids as novel and potent inhibitors of fatty acid amide hydrolase

Minkkilä A, Saario SM, Käsnänen H, Leppänen J, Poso A, Nevalainen T, 2008, Journal of medicinal chemistry, 51, 7057-7060. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Discovery of substituted sulfonamides and thiazolidin-4-one derivatives as agonists of human constitutive androstane receptor

Küblbeck J, Jyrkkärinne J, Poso A, Turpeinen M, Sippl W, Honkakoski P, Windshügel B, 2008, Biochemical pharmacology, 76, 1288-1297. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Estimation of drug release profiles of a heterogeneous set of drugs from a hydrophobic matrix tablet using molecular descriptors

Matero S, Reinikainen S-P, Lahtela-Kakkonen M, Korhonen O, Ketolainen J, Poso A, 2008, Journal of chemometrics, 22, 653-660. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

FieldChopper, a new tool for automatic model generation and virtual screening based on molecular fields

Kalliokoski T, Rönkkö T, Poso A, 2008, Journal of chemical information and modeling, 48, 1131-1137. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Identification of inhibitors of the nicotine metabolising CYP2A6 enzyme-an in silico approach

Rahnasto M, Wittekindt C, Juvonen RO, Turpeinen M, Petsalo A, Pelkonen O, Poso A, Stahl G, Höltje H-D, Raunio H, 2008, Pharmacogenomics journal, 8, 5, 328-338. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Insights into ligand-elicited activation of human constitutive androstane receptor based on novel agonists and three-dimensional quantitative structure-activity relationship

Jyrkkärinne J, Windshügel B, Rönkkö T, Tervo AJ, Küblbeck J, Lahtela-Kakkonen M, Sippl W, Poso A, Honkakoski P, 2008, Journal of medicinal chemistry, 51, 7181-7192. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Oxadiazole-carbonylaminothioureas as SIRT1 and SIRT2 inhibitors

Huhtiniemi T, Suuronen T, Rinne VM, Wittekindt C, Lahtela-Kakkonen M, Jarho E, Wallén EAA, Salminen A, Poso A, Leppänen J, 2008, Journal of medicinal chemistry, 51, 4377-4380. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Targeting the cannabinoid CB2 receptor: modelling and structural determinants of CB2 selective ligands

Poso A, Huffman JW, 2008, British journal of pharmacology, 153, 335-346. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Ultrasound transmission technique as a potential tool for physical evaluation of monolithic matrix tablets

Hakulinen MA, Pajander J, Leskinen J, Ketolainen J, van Veen B, Niinimäki K, Pirskanen K, Poso A, Lappalainen R, 2008, AAPS PharmSciTech, 9, 1, 267-273. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparison of homology models and X-ray structures of the nuclear receptor CAR: Assessing the structural basis of constitutive activity

Windshügel B, Jyrkkärinne J, Vanamo J, Poso A, Honkakoski P, Sippl W, 2007, Journal of molecular graphics and modelling, 25, 644-657. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

N-(3-(4-hydroxyphenyl)-propenoyl)-amino acid tryptamides as SIRT2 inhibitors

Kiviranta PH, Leppänen J, Rinne VM, Suuronen T, Kyrylenko O, Kyrylenko S, Kuusisto E, Tervo AJ, Järvinen T, Salminen A, Poso A, Wallén EAA, 2007, Bioorganic and medicinal chemistry letters, 17, 2448-2451. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

New potent and selective cytochrome P450 2B6 (CYP2B6) inhibitors based on three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) analysis

Korhonen LE, Turpeinen M, Rahnasto M, Wittekindt C, Poso A, Pelkonen O, Raunio H, Juvonen RO, 2007, British journal of pharmacology, 150, 932-942. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Predicting the drug concentration in starch acetate matrix tablets from ATR-FTIR spectra using multi-way methods

Matero S, Pajander J, Soikkeli A-M, Reinikainen S-P, Lahtela-Kakkonen M, Korhonen O, Ketolainen J, Poso A, 2007, Analytica chimica acta, 595, 190-197. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

3D-QSAR studies on cannabinoid CB1 receptor agonists: G-protein activation as biological data

Salo OMH, Savinainen JR, Parkkari T, Nevalainen T, Lahtela-Kakkonen M, Gynther J, Laitinen JT, Järvinen T, Poso A, 2006, Journal of medicinal chemistry, 49, 554-566. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

BRUTUS: Optimization of a grid-based similarity function for rigid-body molecular superposition. II. Description and characterization

Rönkkö T, Tervo AJ, Parkkinen J, Poso A, 2006, Journal of computer-aided molecular design, 20, 227-236. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Fatty acid amide hydrolase inhibitors from virtual screening of the endocannabinoid system

Saario SM, Poso A, Juvonen RO, Järvinen T, Salo-Ahen OMH, 2006, Journal of medicinal chemistry, 49, 4650-4656. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Ligand recognition by drug-activated nuclear receptors PXR and CAR: structural, site-directed mutagenesis and molecular modeling studies

Poso A, Honkakoski P, 2006, Mini-reviews in medicinal chemistry, 6, 937-943. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

N,N'-bisbenzylidenebenzene-1,4-diamines and N,N'-bisbenzylidenenaphthalene-1,4-diamines as sirtuin type 2 (SIRT2) inhibitors

Kiviranta PH, Leppänen J, Kyrylenko S, Salo HS, Lahtela-Kakkonen M, Tervo AJ, Wittekindt C, Suuronen T, Kuusisto E, Järvinen T, Salminen A, Poso A, Wallén EAA, 2006, Journal of medicinal chemistry, 49, 7907-7911. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Synthesis and CB1receptor activities of dimethylheptyl derivatives of 2-arachidonoyl glycerol (2-AG) and 2-arachidonyl glyceryl ether (2-AGE)

Parkkari T, Salo OMH, Huttunen KM, Savinainen JR, Laitinen JT, Poso A, Nevalainen T, Järvinen T, 2006, Bioorganic and medicinal chemistry, 14, 2850-2858. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Synthesis and SAR studies of 2-oxoquinoline derivatives as CB2 receptor inverse agonists

Raitio KH, Savinainen JR, Vepsäläinen J, Laitinen JT, Poso A, Järvinen T, Nevalainen T, 2006, Journal of medicinal chemistry, 49, 2022-2027. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Amino acids important for ligand specificity of the human constitutive androstane receptor

Jyrkkärinne J, Windshügel B, Mäkinen J, Ylisirniö M, Peräkylä M, Poso A, Sippl W, Honkakoski P, 2005, Journal of biological chemistry, 280, 7, 5960-5971. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

BRUTUS: Optimization of a grid-based similarity function for rigid-body molecular superposition. 1. alignment and virtual screening applications

Tervo AJ, Rönkkö T, Nyrönen TH, Poso A, 2005, Journal of medicinal chemistry, 48, 4076-4086. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Characterization of the sulfhydryl-sensitive site in the enzyme responsible for hydrolysis of 2-arachidonoyl-glycerol in rat cerebellar membranes

Saario SM, Salo OMH, Nevalainen T, Poso A, Laitinen JT, Järvinen T, Niemi R, 2005, Chemistry and biology, 12, 649-656. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Dicarboxylic acid azacycle L-prolyl-pyrrolidine amides as prolyl oligopeptidase inhibitors and three-dimensional quantitative structure-activity relationship of the enzyme-inhibitor interactions

Jarho EM, Wallén EAA, Christiaans JAM, Forsberg MM, Venäläinen JI, Männistö PT, Gynther J, Poso A, 2005, Journal of medicinal chemistry, 48, 4772-4782. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Identification of WIN55212-3 as a competitive neutral antagonist of the human cannabinoid CB2 receptor

Savinainen JR, Kokkola T, Salo OMH, Poso A, Järvinen T, Laitinen JT, 2005, British journal of pharmacology, 145, 636-645. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Partial least square projections to latent structures analysis (PLS) in evaluating and predicting drug release from starch acetate matrix tablets

Korhonen O, Matero S, Poso A, Ketolainen J, 2005, Journal of pharmaceutical sciences, 94, 12, 2716-2730. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Prediction of contact angle for pharmaceutical solids from their molecular structure

Suihko E, Forbes RT, Korhonen O, Ketolainen J, Paronen P, Gynther J, Poso A, 2005, Journal of pharmaceutical sciences, 94, 4, 745-758. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Predictive three-dimensional quantitative structure-activity relationship of cytochrome P450 1A2 inhibitors

Korhonen LE, Rahnasto M, Mähönen N J, Wittekindt C, Poso A, Juvonen RO, Raunio H, 2005, Journal of medicinal chemistry, 48, 3808-3815. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Quantitative structure - activity relationship analysis of inhibitors of the nicotine metabolizing CYP2A6 enzyme

Rahnasto M, Raunio H, Poso A, Wittekindt C, Juvonen RO, 2005, Journal of medicinal chemistry, 48, 440-449. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Synthesis and characterization of the novel fluorescent prolyl oligopeptidase inhibitor 4-fluoresceinthiocarbamoyl-6-aminocaproyl-L-prolyl-2(S)-(hydroxyacetyl)pyrrolidine

Venäläinen JI, Wallén EAA, Poso A, García-Horsman JA, Männistö PT, 2005, Journal of medicinal chemistry, 48, 7093-7095. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Targeting the cannabinoid CB2 receptor: Mutations, modeling and development of CB2 selective ligands

Raitio KH, Salo OMH, Nevalainen T, Poso A, Järvinen T, 2005, Current medicinal chemistry, 12, 1217-1237. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The effect of powder blend and tablet structure on drug release mechanisms of hydrophobic starch acetate matrix tablets

van Veen B , Pajander J, Zuurman K, Lappalainen R, Poso A, Frijlink HW, Ketolainen J, 2005, European journal of pharmaceutics and biopharmaceutics, 61, 149-157. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

The functional role of cysteines adjacent to the NRY motif of the human MT1 melatonin receptor

Kokkola T, Salo OMH, Poso A, Laitinen JT, 2005, Journal of pineal research, 39, 1-11. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Virtual screening of novel CB2 ligands using a comparative model of the human cannabinoid CB2 receptor

Salo OMH, Raitio KH, Savinainen JR, Nevalainen T, Lahtela-Kakkonen M, Laitinen JT, Järvinen T, Poso A, 2005, Journal of medicinal chemistry, 48, 7166-7171. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

An in silico approach to discovering novel inhibitors of human sirtuin type 2

Tervo AJ, Kyrylenko S, Niskanen P, Salminen A, Leppänen J, Nyrönen TH, Järvinen T, Poso A, 2004, Journal of medicinal chemistry, 47, 25, 6292-6298. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparing the quality and predictiveness between 3D QSAR models obtained from manual and automated alignment

Tervo AJ, Nyrönen TH, Rönkkö T, Poso A, 2004, JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND COMPUTER SCIENCES (WASHINGTON), 44, 807-816. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Development of a 3D model for the human cannabinoid CB1 receptor

Salo OMH, Lahtela-Kakkonen M, Gynther J, Järvinen T, Poso A, 2004, Journal of medicinal chemistry, 47, 3048-3057. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Drug release from starch-acetate microparticles and films with and without incorporated alfa-amylase

Tuovinen L, Peltonen S, Liikola M, Hotakainen M, Lahtela-Kakkonen M, Poso A, Järvinen K, 2004, Biomaterials, 25, 4355-4362. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Molecular dynamics simulations of the human CAR ligand-binding domain: deciphering the molecular basis for constitutive activity

Windshügel B, Jyrkkärinne J, Poso A, Honkakoski P, Sippl W, 2004, Journal of molecular modeling. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

A structure-activity relationship study of catechol-O-methyltransferase inhibitors combining molecular docking and 3D QSAR methods

Tervo AJ, Nyrönen TH, Rönkkö T, Poso A, 2003, Journal of computer-aided molecular design, 17, 797-810. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Molecular determinants of steroid inhibition for the mouse constitutive androstane receptor

Jyrkkärinne J, Mäkinen J, Gynther J, Savolainen H, Poso A, Honkakoski P, 2003, Journal of medicinal chemistry, 46, 4687-4695. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

More potent inhibition of human CYP2A6 than mouse CYP2A5 enzyme activities by derivatives of phenylethylamine and benzaldehyde

Rahnasto M, Raunio H, Poso A, Juvonen RO, 2003, Xenobiotica, 33, 5, 529-539. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Predictive value of comparative molecular field analysis modelling of naphthalene inhibition of human CYP2A6 and mouse CYP2A5 enzymes

Asikainen A, Tarhanen J, Poso A, Pasanen M, Alhava E, Juvonen RO, 2003, Toxicology in vitro, 17, 449-455. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Aggregation and solvation of steroid molecules in different solvents

Päivärinta JT, Poso AT, Hotokka M, Muttonen E, 2002, Crystal growth and design, 2, 2, 121-126. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Substrate-dependent, non-hyperbolic kinetics of pig brain prolyl oligopeptidase and its tight binding inhibition by JTP-4819

Venäläinen JI, Juvonen RO, Forsberg MM, Garcia-Horsman A, Poso A, Wallen EAA, Gynther J, Männistö PT, 2002, Biochemical pharmacology, 64, 463-471. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

A comparative molecular field analysis of cytochrome P450 2A5 and 2A6 inhibitors

Poso A, Gynther J, Juvonen R, 2001, Journal of computer-aided molecular design, 15, 195-202. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Predicting plasticization efficiency from three-dimensional molecular structure of a polymer plasticizer

Tarvainen M, Sutinen R, Somppi M, Paronen P, Poso A, 2001, Pharmaceutical research, 18, 12, 1760-1766. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

A proton relay process as the mechanism of activation of the histamine H3-receptor determined by 1H NMR and ab initio quantum mechanical calculations

Kovalainen JT, Christiaans JAM, Ropponen R, Poso A, Peräkylä M, Vepsäläinen J, Laatikainen R, Gynther J, 2000, Journal of the American Chemical Society, 122, 29, 6989-6996. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Calculated and measured vibrational frequencies in an alkanoic acid-alkylamine complex

Päivärinta J, Karlsson S, Hotokka M, Poso A, 2000, Chemical physics letters, 327, 420-424. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Deformation behaviors of tolbutamide, hydroxypropyl-beta-cyclodextrin, and their dispersions

Suihko E, Poso A, Korhonen O, Gynther J, Ketolainen J, Paronen P, 2000, Pharmaceutical research, 17, 8, 942-948. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Pronounced differences in inhibition potency of lactone and non-lactone compounds for mouse and human coumarin 7-hydroxylases (CYP2A5 and CYP2A6)

Juvonen RO, Gynther J, Pasanen M, Alhava E, Poso A, 2000, Xenobiotica, 30, 1, 81-92. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

1H NMR study on putative intramolecular hydrogen bonding for histamine H3-receptor agonists

Kovalainen JT, Christiaans JAM, Poso A, Vepsäläinen J, Laatikainen R, Gynther J, 1999, Tetrahedron letters, 40, 2425-2428. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Computational elasticity of anhydrous betalactose

Päivärinta J, Poso A, Gynther J, Suihko E, Ketolainen J, 1997, 16th Pharmaceutical Technology Conference and Exhibition. Vol. 2., 509-522. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa

Dehydration of theophylline monohydrate - a two step process

Suihko E, Ketolainen J, Poso A, Ahlgren M, Gynther J, Paronen P, 1997, International journal of pharmaceutics, 158, 47-55. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

A rhodopsin-based model for melatonin recognition at its G protein-coupled receptor

Navajas C, Kokkola T, Poso A, Honka N, Gynther J, Laitinen JT, 1996, European journal of pharmacology, 304, 173-183. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

CoMFA of flavonoids with antimutagenic activity against 2-amino-3-methylimidazo[4,5-f]quinoline (IQ). [Online]

Navajas C, Poso A, Gynther J, 1996, ELECTRONIC JOURNAL OF THEORETICAL CHEMISTRY (EJTC), 1, 1-8 [10.1.1997]. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparative molecular field analysis (CoMFA) ja sen soveltaminen eräiden biologisesti aktiivisten yhdisteiden tutkimiseen

Poso A, 1996, Dosis, 12, 2, 97-101. D1 Artikkeli ammattilehdessä

Comparative molecular field analysis (CoMFA) of MX compounds using different semi-empirical methods: LUMO field and its correlation with mutagenic activity

Navajas C, Poso A, Tuppurainen K, Gynther J, 1996, Quantitative structure-activity relationships, 15, 189-193. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Partial least squares (pls) analysis in prediction of contact angles for pharmaceutical materials

Suihko E, Poso A, Ketolainen J, Gynther J, Paronen P, 1996, Proceedings of the 15th Pharmaceutical Technology Conference. Vol. 2a., 259-264. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa

An empirical and theoretical study on mechanisms of mutagenic activity of hydrazine compounds

Poso A, von Wright A, Gynther J, 1995, Mutation research, 332, 63-71. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Changes in solid-state structure of cyclophosphamide monohydrate induced by mechanical treatment and storage

Ketolainen J, Poso A, Viitasaari V, Gynther J, Pirttimäki J, Laine E, Paronen P, 1995, Pharmaceutical research, 12, 2, 299-304. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Characterization of physical properties of theophylline and its polymorphs

Ketolainen J, Suihko E, Poso A, Ahlgren M, Gynther J, Paronen P, 1995, Proceedings of the 14th Pharmaceutical Technology Conference. Vol. 3, 109-115. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa

Comparative molecular field analysis of compounds with CYP2A5 binding affinity

Poso A, Juvonen R, Gynther J, 1995, Quantitative structure-activity relationships, 14, 507-511. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Competitive inhibition of coumarin 7-hydroxylation by pilocarpine and its interaction with mouse CYP 2A5 and human CYP 2A6

Kinonen T, Pasanen M, Gynther J, Poso A, Järvinen T, Alhava E, Juvonen RO, 1995, British journal of pharmacology, 116, 2625-2630. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Modeling of Some Bioactive Compounds Utilizing CoMFA with Different Field Types

Poso A, 1995, Kuopion yliopiston julkaisuja A. Farmaseuttiset tieteet. G5 Artikkeliväitöskirja

Tarkenna hakuasi

Tutkimusryhmät

Projektit

Avainsanat

A twist in the tale: shifting from covalent targeting of a tyrosine in JAK3 to a lysine in MK2

Activation of steroid hormone receptors by metabolism-disrupting chemicals

Design, Synthesis, and Unprecedented Interactions of Covalent Dipeptide-Based Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease and Its Variants Displaying Potent Antiviral Activity

Discovery of synthetic small molecules targeting the central regulator of <i>Salmonella</i> pathogenicity

Look What You Made Me Do: Discerning Feature for Classification of Endocrine-Disrupting Chemical Binding to Steroid Hormone Receptors

New players from the old chalcone scaffold: Synthesis, identification, and characterization of new potent ABCG2 inhibitors

PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2

Pseudomonas aeruginosa acyl-CoA dehydrogenases and structure-guided inversion of their substrate specificity

Tetrahydroquinoline/4,5-dihydroisoxazoline hybrids counteracts multidrug resistance by inhibiting MRP1-mediated drug efflux

The human microbiome-derived antimicrobial lugdunin self-regulates its biosynthesis by a feed-forward mechanism

Ultra-Large-Scale Virtual Screening

Cathepsin-Targeting SARS-CoV-2 Inhibitors: Design, Synthesis, and Biological Activity

Cyclophilin A is a ligand for RAGE in thrombo-inflammation

Development of Selective Pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one-Based Mammalian STE20-Like (MST3/4) Kinase Inhibitors

Discovery and optimization of narrow spectrum inhibitors of Tousled like kinase 2 (TLK2) using quantitative structure activity relationships

Drug repurposing platform for deciphering the druggable SARS-CoV-2 interactome

Filling the Blank Space: Branched 4-Nonylphenol Isomers Are Responsible for Robust Constitutive Androstane Receptor (CAR) Activation by Nonylphenol

First-in-class MKK4 inhibitors enhance liver regeneration and prevent liver failure

Halogen Bonding on Water─A Drop in the Ocean?

Linking ATP and allosteric sites to achieve superadditive binding with bivalent EGFR kinase inhibitors

Lääkkeen vaikutuskohteen tietokonemalleista apua yksilöidyn syöpälääkkeen valintaan

Pyrazinyl-Substituted Aminoazoles as Covalent Inhibitors of Thrombin: Synthesis, Structure, and Anticoagulant Properties

Solid-State NMR Validation of OPLS4: Structure of PC-Lipid Bilayers and Its Modulation by Dehydration

Targeting Cyclophilin A in the Cardiac Microenvironment Preserves Heart Function and Structure in Failing Hearts

The comprehensive SARS-CoV-2 ‘hijackome’ knowledge base

The molecular interaction pattern of lenvatinib enables inhibition of wild-type or kinase-mutated FGFR2-driven cholangiocarcinoma

1,3-Diphenylureido hydroxamate as a promising scaffold for generation of potent antimalarial histone deacetylase inhibitors

Characterization of Potent ABCG2 Inhibitor Derived from Chromone: From the Mechanism of Inhibition to Human Extracellular Vesicles for Drug Delivery

Design and Optimization of Novel Benzimidazole- and Imidazo[4,5-b]pyridine-Based ATM Kinase Inhibitors with Subnanomolar Activities

Development of Ligands for the Super Conserved Orphan G Protein-Coupled Receptor GPR27 with Improved Efficacy and Potency

Direct pathway cloning and expression of the radiosumin biosynthetic gene cluster

Farmaseuttinen kemia

Machine Learning-Boosted Docking Enables the Efficient Structure-Based Virtual Screening of Giga-Scale Enumerated Chemical Libraries

Shifting the selectivity of pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one inhibitors towards the salt-inducible kinase (SIK) subfamily

Sodium-Dependent Neutral Amino Acid Transporter 2 Can Serve as a Tertiary Carrier for l -Type Amino Acid Transporter 1-Utilizing Prodrugs

Structural and molecular characterization of lopinavir and ivermectin as breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2) inhibitors

Structure-based discovery of thiosemicarbazones as SARS-CoV-2 main protease inhibitors

Targeting Glial Cells by Organic Anion-Transporting Polypeptide 1C1 (OATP1C1)-Utilizing l-Thyroxine-Derived Prodrugs

Trypanosoma cruzi Sirtuin 2 as a Relevant Druggable Target: New Inhibitors Developed by Computer-Aided Drug Design

Virtual Screening Assisted Search for Inhibitors of the Translocated Intimin Receptor of Enteropathogenic Escherichia Coli

Amide-functionalized 1,2,4-Triazol-5-amines as Covalent Inhibitors of Blood Coagulation Factor XIIa and Thrombin

Comparative Modelling of Organic Anion Transporting Polypeptides: Structural Insights and Comparison of Binding Modes

Discovery and Development of First-in-Class ACKR3/CXCR7 Superagonists for Platelet Degranulation Modulation

Do Go Chasing Waterfalls: Enoyl Reductase (FabI) in Complex with Inhibitors Stabilizes the Tetrameric Structure and Opens Water Channels

Effects of PCSK9 missense variants on molecular conformation and biological activity in transfected HEK293FT cells

Funnel metadynamics and behavioral studies reveal complex effect of D2AAK1 ligand on anxiety-like processes

Inhibitor induced conformational changes in SARS-COV-2 papain-like protease

Small-Molecule Thioesters as SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors: Enzyme Inhibition, Structure–Activity Relationships, Antiviral Activity, and X-ray Structure Determination

Structural Features Affecting the Interactions and Transportability of LAT1-Targeted Phenylalanine Drug Conjugates

Structure of POPC Lipid Bilayers in OPLS3e Force Field

Structure-Based Identification of Naphthoquinones and Derivatives as Novel Inhibitors of Main Protease Mpro and Papain-like Protease PLpro of SARS-CoV-2

Synthesis and evaluation of 1,2,3-dithiazole inhibitors of the nucleocapsid protein of feline immunodeficiency virus (FIV) as a model for HIV infection

The Use of Lymphocyte Stimulation Test in Severe Nabumetone-Induced Stevens-Johnson Syndrome: A Case Report

WaterMap‐Guided Structure‐Based Virtual Screening for Acetylcholinesterase Inhibitors

When the two become one: conformational changes in FXR/RXR heterodimers bound to steroidal antagonists

A new porphyrin as selective substrate-based inhibitor of breast cancer resistance protein (BCRP/ABCG2)

Docking-Based 3D-QSAR Studies for 1,3,4-oxadiazol-2-one Derivatives as FAAH Inhibitors

In vitro identification and in vivo confirmation of inhibitors for SPCSV RNA silencing suppressor, a viral RNase III

Inhibition of prolyl oligopeptidase: A promising pathway to prevent the progression of age-related macular degeneration

LXRα activation and Raf inhibition trigger lethal lipotoxicity in liver cancer

Ligand Accessibility Insights to the Dengue virus NS3-NS2B Protease Assessed by long-timescale Molecular Dynamics Simulations

Molecular characteristics supporting L-Type amino acid transporter 1 (LAT1)-mediated translocation

Neurosteroids: Structure-Uptake Relationships and Computational Modeling of Organic Anion Transporting Polypeptides (OATP)1A2

Potent Inhibitor of Human Trypsins from the Aeruginosin Family of Natural Products

SARS-COV-2 Mpro conformational changes induced by covalently bound ligands

SARS-CoV-2--host proteome interactions for antiviral drug discovery

Structural Characterization of LsrK as a Quorum Sensing Target and a Comparison between X-ray and Homology Models

Structure-Based Design of Selective Salt-Inducible Kinase Inhibitors

Targeting extracellular and juxtamembrane FGFR2 mutations in chemotherapy-refractory cholangiocarcinoma

Tetrahydroquinoline/4,5-Dihydroisoxazole Molecular Hybrids as Inhibitors of Breast Cancer Resistance Protein (BCRP/ABCG2)

The Future of Medicinal Chemistry, PROTAC, and Undruggable Drug Targets

Virus structure and structure-based antivirals

Acylated 1 H-1,2,4-Triazol-5-amines Targeting Human Coagulation Factor XIIa and Thrombin: Conventional and Microscale Synthesis, Anticoagulant Properties, and Mechanism of Action

Antimicrobial and Antifungal Activity of Rare Substituted 1,2,3-Thiaselenazoles and Corresponding Matched Pair 1,2,3-Dithiazoles

Deep Learning in Drug Target Interaction Prediction: Current and Future Perspective