Piia Bartos
Yliopistotutkija
Tietokoneavusteista lääkeainesuunnittelua ja RNA-molekyylien simulointia, kohteena syöpä ja sydän- sekä verisuonitaudit.
Terveystieteiden tiedekunta, Farmasian laitos
piia.kokkonen@uef.fi
Olen lääketutkija, jonka kiinnostuksen kohteena ovat nyt RNA sekvenssit sekä miten voitaisiin kehittää lääkeaine jolla olisi samantyyppisiä vaikutuksia kuin näillä lyhyillä RNA-sekvensseillä. Taustaltani olen proviisori, ja väittelin farmaseuttiselta kemialta lääkeainekehityksestä sirtuiineille syksyllä 2015 UEF:ssa. Väitöskirjani jälkeen lähdin maailmalle oppimaan molekyylidynamiikan ja entsyymisuunnittelun perusteita Brnoon, Tsekkiin. Käytän sujuvasti kaikkia tietokoneavusteisen lääkeainekehityksen menetelmiä telakoinnista ja molekyylidynamiikan simulaatiosta yksinkertaisiin kvanttimekaniikan laskuihin asti.
Tutkimusryhmät
Avainsanat
Julkaisut
10 kappaletta-
Direct pathway cloning and expression of the radiosumin biosynthetic gene cluster
Ouyang, Xiaodan; D'Agostino, Paul M; Wahlsten, Matti; Delbaje, Endrews; Jokela, Jouni; Permi, Perttu; Gaiani, Greta; Poso, Antti; Bartos, Piia; Gulder, Tobias AM; Koistinen, Hannu; Fewer, David P. 2023. Organic and biomolecular chemistry. 21: 4893-4908 -
RNA-protein complexes and force field polarizability
Baltrukevich, Hanna; Bartos, Piia. 2023. Frontiers in chemistry. 11: . 1217506 -
Structure of POPC Lipid Bilayers in OPLS3e Force Field
Kurki, Milla; Poso, Antti; Bartos, Piia; Miettinen, Markus S. 2022. Journal of chemical information and modeling. 62: 6462–6474 -
Transcription and Translation Inhibitors in Cancer Treatment
Laham-Karam, Nihay; Pinto, Gaspar; Poso, Antti; Kokkonen, Piia. 2020. Frontiers in chemistry. 8: 276 -
Studying sirtuin inhibitors with in silico and in vitro approaches
Kokkonen Piia. 2015. Publications of the University of Eastern Finland. Dissertations in Health Sciences -
Virtual screening approach of sirtuin inhibitors results in two new scaffolds
Kokkonen Piia, Kokkola Tarja, Suuronen Tiina, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija. 2015. European journal of pharmaceutical sciences. 76: 27-32 -
Quantitative insights for the design of substrate-based SIRT1 inhibitors
Kokkonen Piia, Mellini Paolo, Nyrhilä Olli, Rahnasto-Rilla Minna, Suuronen Tiina, Kiviranta Päivi, Huhtiniemi Tero, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija. 2014. European journal of pharmaceutical sciences. 59: 12-19 -
Studying SIRT6 regulation using H3K56 based substrate and small molecules
Kokkonen Piia, Rahnasto-Rilla Minna, Mellini Paolo, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija, Kokkola Tarja. 2014. European journal of pharmaceutical sciences. 63: 71-76 -
Peptides and Pseudopeptides as SIRT6 Inhibitors
Piia Kokkonen, Minna Rahnasto-Rilla, Päivi Kiviranta, Tero Huhtiniemi, Tuomo Laitinen, Antti Poso, Elina Jarho, Maija Lahtela-Kakkonen. 2012. -
Peptides and pseudopeptides as SIRT6 deacetylation inhibitors
Kokkonen Piia, Rahnasto-Rilla Minna, Kiviranta Päivi H, Huhtiniemi Tero, Laitinen Tuomo, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija. 2012. Acs medicinal chemistry letters. 3: 969-974