Piia Bartos
Yliopistotutkija
Tietokoneavusteista lääkeainesuunnittelua ja RNA-molekyylien simulointia, kohteena syöpä ja sydän...
Farmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Olen lääketutkija, jonka kiinnostuksen kohteena ovat nyt RNA sekvenssit sekä miten voitaisiin kehittää lääkeaine jolla olisi samantyyppisiä vaikutuksia kuin näillä lyhyillä RNA-sekvensseillä. Taustaltani olen proviisori, ja väittelin farmaseuttiselta kemialta lääkeainekehityksestä sirtuiineille syksyllä 2015 UEF:ssa. Väitöskirjani jälkeen lähdin maailmalle oppimaan molekyylidynamiikan ja entsyymisuunnittelun perusteita Brnoon, Tsekkiin. Käytän sujuvasti kaikkia tietokoneavusteisen lääkeainekehityksen menetelmiä telakoinnista ja molekyylidynamiikan simulaatiosta yksinkertaisiin kvanttimekaniikan laskuihin asti.
Tutkimusryhmät
Avainsanat
3D-QSAR
ei-koodaava RNA
entsyymi
farmaseuttinen kemia
farmasia
kemia
laskennallinen kemia
ligandien simulointi
lääkeaine
lääkeaineen suunnittelu
lääkeaineiden kohdentaminen
lääkeainekemia
mallinnus
molekulaariset mekanismit
molekyylidynamiikka
molekyylidynamiikkasimulaatiot
molekyylimallitus
molekyylimekanismit
proteiini
sirtuiinit
sydän- ja verisuonisairaudet
syöpätutkimus
telakointi
Julkaisut
13/13 kappaletta-
Lääkkeen vaikutuskohteen tietokonemalleista apua yksilöidyn syöpälääkkeen valintaan
Bartos, Piia; Kuittinen, Outi; Poso, Antti. 2024. Duodecim. 140: 1703-9 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Solid-State NMR Validation of OPLS4: Structure of PC-Lipid Bilayers and Its Modulation by Dehydration
Kurki, Milla; Nesterenko, Alexey M; Alsaker, Nicolai E; M Ferreira, Tiago; Kyllönen, Sami; Poso, Antti; Bartos, Piia; Miettinen, Markus S. 2024. Journal of physical chemistry b. [Online ahead of print December 9, 2024]: 1-10 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Targeting ocular tissues with intravenously administered aptamers selected by in vivo SELEX
Korhonen, Sonja; Stenberg, Katja; Seemab, Umair; Bartos, Piia; Mäkiniemi, Katariina; Kjems, Jørgen; Dupont, Daniel Miotto; Subrizi, Astrid. 2024. Molecular therapy nucleic acids. 35: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Direct pathway cloning and expression of the radiosumin biosynthetic gene cluster
Ouyang, Xiaodan; D'Agostino, Paul M; Wahlsten, Matti; Delbaje, Endrews; Jokela, Jouni; Permi, Perttu; Gaiani, Greta; Poso, Antti; Bartos, Piia; Gulder, Tobias AM; Koistinen, Hannu; Fewer, David P. 2023. Organic and biomolecular chemistry. 21: 4893-4908 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
RNA-protein complexes and force field polarizability
Baltrukevich, Hanna; Bartos, Piia. 2023. Frontiers in chemistry. 11: . 1217506 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Structure of POPC Lipid Bilayers in OPLS3e Force Field
Kurki, Milla; Poso, Antti; Bartos, Piia; Miettinen, Markus S. 2022. Journal of chemical information and modeling. 62: 6462–6474 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Transcription and Translation Inhibitors in Cancer Treatment
Laham-Karam, Nihay; Pinto, Gaspar; Poso, Antti; Kokkonen, Piia. 2020. Frontiers in chemistry. 8: 276 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Studying sirtuin inhibitors with in silico and in vitro approaches
Kokkonen Piia. 2015. Publications of the University of Eastern Finland. Dissertations in Health Sciences G5 Artikkeliväitöskirja -
Virtual screening approach of sirtuin inhibitors results in two new scaffolds
Kokkonen Piia, Kokkola Tarja, Suuronen Tiina, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija. 2015. European journal of pharmaceutical sciences. 76: 27-32 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Quantitative insights for the design of substrate-based SIRT1 inhibitors
Kokkonen Piia, Mellini Paolo, Nyrhilä Olli, Rahnasto-Rilla Minna, Suuronen Tiina, Kiviranta Päivi, Huhtiniemi Tero, Poso Antti, Jarho Elina, Lahtela-Kakkonen Maija. 2014. European journal of pharmaceutical sciences. 59: 12-19 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä