Hyönteistutkimus Joensuu
Entomologia on eläintieteen tutkimussuuntaus, jossa pääkohteena ovat hyönteiset. Tällä sivulla esittelemme tämänhetkistä hyönteistutkimusta Joensuussa ympäristö- ja biotieteiden laitoksella.
Hyönteiset, ravintoverkot ja ekosysteemien ennallistaminen
Hyönteiset ovat kaikkialla ympärillämme ja ne toimivat tärkeissä rooleissa ekosysteemeissä kuten pölyttäjinä, kasvinsyöjinä, saaliina, saalistajina, loisina ja parasitoideina. Hyönteiset ovat siten tärkeitä ottaa huomioon kun ennallistetaan ekosysteemejä. Pääpaino ekosysteemien ennallistamisessa on ollut kasvillisuuden palautumisessa, mutta se ei ole ainut osa-alue, jota ennallistaa.
Olemme tutkineet perhosia Ugandassa sijaitsevalla ennallistamisalueella, joka koostuu eri-ikäisistä ennallistetuista metsistä. Olemme keränneet dataa niin aikuisista perhosista (hedelmiä syövien perhosten ryhmä) kuin perhostoukista ja niiden ravintokasveista ja parasitoideista. Tämän datan avulla tarkoituksenamme on selvittää, miten hedelmiä syövät perhosyhteisöt ja kasvi-toukka-parasitoidi ruokaverkot palautuvat ennallistamisikägradientilla. Jälkimmäisen aineiston analysointiin käytämme DNA-pohjaisia menetelmiä, jotta voimme paljastaa aikaisemmin hämärän peitossa olleet vuorovaikutussuhteet erittäin monimoutoisten hyönteisryhmien väliltä.
Tutkijat: Anu Valtonen, Eveliina Korkiatupa & Coen Westerduin
Kaksisiipisten tuntematon diversiteetti
Jaakko Pohjoismäen johtama tutkimusryhmä tutkii kaksisiipisten biodiversiteettiä hyödyntämällä yhdisteleviä DNA-menetelmiä, jossa hyödynnetään sekä DNA viivakoodausta, että morfologiaa. Iso osa maailman biodiversiteetistä on edelleen löytämättä, varsinkin vähemmän tutkituista, pienikokoisista ja hyvin monimuotoisista ryhmistä, joita löytyy kaksisiipisistä ja pistiäisistä. Näitä “pimeitä ryhmiä” ei kyetä tutkimaan perinteisillä morfologisilla menetelmillä, sillä näiltä ryhmiltä usein puuttuvat helposti erotettavat morfologiset erot lajien väliltä. Yksi tällainen ryhmä on ryhäkärpäset (Diptera: Phoridae), jota pidetään yhtenä globaalisti lajirikkaimmista ryhmistä. Tavoitteena on hyödyntää DNA viivakoodeja (COI, sekä useampi nukleaarilokus) morfologian tukena, pystyäksemme luomaan luotettava viitetietokanta Suomen ryhäkärpäsistä, ja tarjota uusia työkaluja lajien löytämiseen.
Lisäksi teemme metaviivakoodausta Nanoporen PromethION sekvensointijärjestelmällä, jossa tavoitteenamme on testata järjestelmän toimivuutta lajikartoituksien tekemisessä hyödyntämällä pitkiä DNA viivakoodeja. Tässä projektissa olemme keränneet näytteitä Malaise-pyydyksillä ympäri Suomen ja eristäneet DNA:n tuhoamatta näytettä. Tällä hetkellä sekvensointi on vielä kesken.
Tutkijat: Jaakko Pohjoismäki & Jiri Vihavainen
Biodiversiteettigenomiikka
Jaakko Pohjoismäen tutkimusryhmä myös osallistuu kansallisiin ja kansainvälisiin genomihankkeisiin tarjoamalla näytteitä referenssi- eli verrokkigenomien tuottamiseen suomalaisista hyönteisistä.
Projektit
Yhteistyö
Avainsanat
Professorit
Vanhemmat tutkijat
Tutkijatohtorit
Väitöskirjatutkijat
-
Jiri Vihavainen
VäitöskirjatutkijaYmpäristö- ja biotieteiden laitos, Luonnontieteiden, metsätieteiden ja tekniikan tiedekunta -
Eveliina Korkiatupa
Vieraileva tutkijaYmpäristö- ja biotieteiden laitos, Luonnontieteiden, metsätieteiden ja tekniikan tiedekunta
Projektitutkija
Yliopisto-opettaja
Julkaisut
51 kappaletta-
Chronosequence Resampling Elucidates Tree Community and Forest Structure Recovery Patterns in Restored Tropical Rainforest
Korkiatupa, Eveliina; Malinga, Geoffrey M.; Holm, Sille; van Goor, Wouter; Kigenyi, Richard; Valtonen, Anu, 2025, Ecology and evolution, 15, 8, e72033. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Global progress in domesticating edible crickets: a review
Sengendo, Francis; Egonyu, James Peter; Valtonen, Anu; Nyeko, Philip; Alaroker, Martha Franny; Malinga, Geoffrey Maxwell; Van Miert, Sabine, 2025, International journal of tropical insect science, 45, 3, 951-961. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Individual-level size distribution patterns in fruit-feeding butterfly communities along a forest restoration gradient in the Afrotropics
Nakadai, Ryosuke; Akite, Perpetra; Holm, Sille; Kigenyi, Richard; Korkiatupa, Eveliina; Leinonen, Lotta; Malinga, Geoffrey M; Nyafwono, Margaret; van Goor, Wouter; Valtonen, Anu, 2025, Global Ecology and Conservation, 62, e03679. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Machimus rusticus (Meigen, 1820) (Diptera, Asilidae) esiintymä lähellä Suomea [The occurrence of Machimus rusticus (Meigen, 1820) (Diptera, Asilidae) near Finland]
Haarto, Antti; Kakko, Iiro; Pohjoismäki, Jaakko, 2025, W-album, 34, 3–7. D1 Artikkeli ammattilehdessä -
Megabarcoding dark taxa – Assessing the utility of mass DNA barcoding for phorid fly species discovery
Vihavainen, Jiri; Kiljunen, Niina; Pohjola, Pekka; McKeown, Jaclyn; Oinonen, Eveliina; Mutanen, Marko; Pohjoismäki, Jaakko, 2025, PLoS ONE, 20, 12, e0334948. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Strides in farming edible African bush cricket, Ruspolia differens (Serville) (Orthoptera: Tettigoniidae) in East Africa: a systematic review of rearing protocols
Malinga, Geoffrey Maxwell; Angwech, Harriet; Alemu, Mohammed Hussen; Valtonen, Anu; Nyeko, Philip; Egonyu, James Peter, 2025, International journal of tropical insect science, [Epub ahead of print 08 July 2025], 1-18. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The genome sequence of the Black Hairstreak, Satyrium pruni (Linnaeus, 1758) (Lepidoptera: Lycaenidae)
Pohjoismäki, Jaakko; Mutanen, Marko; Wright, Charlotte J.; Meier, Joana I.; Blaxter, Mark L.; Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory team; Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations; Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics team; Tree of Life Core Informatics collective; Project Psyche Community, 2025, Wellcome open research, 10, 377. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The genome sequence of the Poplar Admiral, Limenitis populi (Linnaeus, 1758) (Lepidoptera: Nymphalidae)
Pohjoismaki, Jaakko; Mutanen, Marko; Wright, Charlotte J.; Meier, Joana I.; Blaxter, Mark L.; Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory team; Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations; Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics team; Tree of Life Core Informatics collective; Project Psyche Community, 2025, Wellcome open research, 10, 438. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Inferring long-distance movements of insects using combined hydrogen isotope and genetic analyses: A case study of the African edible bush-cricket
Valtonen, Anu; Holm, Sille; Korkiatupa, Eveliina; Malinga, Geoffrey M.; Nakadai, Ryosuke; Nyeko, Philip; Roininen, Heikki; Strandberg, Ursula; Wassenaar, Leonard I; Pilecky, Matthias, 2024, Ecological entomology, [Epub ahead of print 01 December 2024], 1-12. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Phylogenomics and biogeography of sawflies and woodwasps (hymenoptera, symphyta)
Wutke, Saskia; Blank, Stephan M; Boevé, Jean-Luc; Faircloth, Brant C; Koch, Frank; Linnen, Catherine R; Malm, Tobias; Niu, Gengyun; Prous, Marko; Schiff, Nathan M.; Schmidt, Stefan; Taeger, Andreas; Vilhelmsen, Lars; Wahlberg, Niklas; Wei, Meicai; Nyman, Tommi, 2024, Molecular phylogenetics and evolution, 199, 108144. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

