
Jäniseläintutkimus
Johtajat
Jänistutkimus alkoi Itä-Suomen yliopiston ympäristö- ja biotieteiden laitoksella 2013. Uusimmassa tutkimushankkeessa, Suomen akatemian rahoittamassa HARECY-konsortiohankkeessa tutkimme yhteistyössä Tampereen yliopiston mitokondriometabolian tutkimusryhmän kanssa elintapastrategioiden evoluutiota ja miten aineenvaihdunnallisista sopeumista johtuvat kustannukset vaikuttavat mm. solusyklin säätelyyn ja siten ikääntymiseen, lisääntymiseen ja syöpäalttiuteen käyttäen jäniksiä mallieläiminä. Hanke on jatkoa CROSSHARES-konsortiolle, jossa selvitimme mm. lajirajoja ylläpitäviä solunsisäisiä mekanismeja jäniseläimillä.
Olemme kiinnostuneet myös kiinnostuneet suomalaisten jänisten populaatiogenetiikasta, rusakon sopeutumismekanismeista pohjoisiin oloihin ja lajien levittäytymishistoriasta.
Käytämme työssä laajasti niin genomiikan kuin solu- ja molekyylibiologian työkaluja. Työtä mahdollistaaksemme olemme myös julkaisseet metsäjäniksen ja rusakon verrokkiperimät, jotka ovat kromosomeittain vapaasti tarkasteltavissa NCBI-genomiselaimen kautta.
Tutkimusryhmämme on myös osallistunut Biodiversity Genomics Europe-hankkeeseen tapaustutkimuksella, jossa hyödynnämme koostamiamme verrokkiperimiä ruskon ja metsäjäniksen risteytymisen tutkimukseen sekä rusakon levittäytymishistorian selvittämiseen.
Yhteistyö
Avainsanat
Johtajat
Tutkijatohtorit
Väitöskirjatutkijat
Muut ryhmän jäsenet
-
Manu Soininmäki
Julkaisut
14 kappaletta-
Chromosome-level reference genome assembly for the mountain hare (Lepus timidus)
Fekete, Zsófia; Absolon, Dominic E.; Michell, Craig; Wood, Jonathan M.D.; Goffart, Steffi; Pohjoismäki, Jaakko L.O.. 2025. Peer community journal. 5: . e14 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Exploring mitonuclear interactions in the regulation of cell physiology: insights from interspecies cybrids
Gaertner, Kateryna; Tapanainen, Riikka; Saari, Sina; Fekete, Zsófia; Goffart, Steffi; Pohjoismäki, Jaakko LO; Dufour, Eric. 2025. Experimental cell research. 446: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Whole-Genome Sequencing-Based Population Genetic Analysis of Wild and Domestic Rabbit Breeds
Fekete, Zsófia; Német, Zoltán; Ninausz, Nóra; Fehér, Péter; Schiller, Mátyás; Alnajjar, Maher; Szenes, Áron; Nagy, Tibor; Stéger, Viktor; Kontra, Levente; Barta, Endre. 2025. Animals. 15: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
High quality genome assembly of the brown hare (Lepus europaeus) with chromosome-level scaffolding
Michell, Craig; Collins, Joanna; Laine, Pia K; Fekete, Zsófia; Tapanainen, Riikka; Wood, Jonathan M D; Goffart, Steffi; Pohjoismäki, Jaakko L O. 2024. Peer community journal. 4: . e26 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Rusakon aikakausi
Pohjoismäki, Jaakko. 2024. Metsästäjä. 73: 10–13 E1 Yleistajuinen artikkeli, sanomalehtiartikkeli -
Species differences in glycerol-3-phosphate metabolism reveals trade-offs between metabolic adaptations and cell proliferation
Gaertner, Kateryna; Terzioglu, Mügen; Michell, Craig; Tapanainen, Riikka; Pohjoismäki, Jaakko; Dufour, Eric; Saari, Sina. 2024. Biochimica et biophysica acta: bioenergetics. 2025; 1866: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Species-specific variation in mitochondrial genome tandem repeat polymorphisms in hares (Lepus spp., Lagomorpha, Leporidae) provides insight into their evolution
Tapanainen, Riikka; Aasumets, Koit; Fekete, Zsófia; Goffart, Steffi; Dufour, Eric; LO Pohjoismäki, Jaakko. 2024. Gene. 926: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Molecular phenotyping uncovers differences in basic housekeeping functions among closely related species of hares (Lepus spp., Lagomorpha: Leporidae)
Gaertner, Kateryna; Michell, Craig; Tapanainen, Riikka; Goffart, Steffi; Saari, Sina; Soininmäki, Manu; Dufour, Eric; Pohjoismäki, Jaakko LO. 2022. Molecular ecology. 2023; 32: 4097-4117 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Mountain- and brown hare genetic polymorphisms to survey local adaptations and conservation status of the heath hare (Lepus timidus sylvaticus, Nilsson 1831)
Michell, Craig T; Pohjoismäki, Jaakko LO; Spong, Göran; Thulin, Carl-Gustaf. 2022. Scientific data. 9: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Hybridization with mountain hares increases the functional allelic repertoire in brown hares
Pohjoismäki, Jaakko LO; Michell, Craig; Levänen, Riikka; Smith, Steve. 2021. Scientific reports. 11: 15771 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä