
Linna Lab
Johtajat
Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet ihmiskudosten sisältävän muovia. Erityisen huolestuttavia ovat löydökset, joiden mukaan muovien kertyminen olisi kiihtynyt viime vuosien aikana korreloiden kasvaneen ympäristökuorman kanssa. Kliinisten tutkimusten mukaan muovikertymät ovat suurempia sairaissa verisuonissa terveisiin nähden korreloiden korkeamman potilaskuolleisuuden kanssa. Tutkimuksessamme selvitetään muovien yhteyttä sydän- ja verisuonitauteihin. Hypoteesimme mukaan muovit aiheuttavat sydämelle “hiekkaa sukassa”-tyyppisen uhan: Hiekka sukassa on kävelijälle ärsyttävä, mutta ei välittömästi henkeä uhkaava tila. Jos iho rikkoutuu tai on jo valmiiksi haavainen, tilanne muuttuu. Samaan tapaan terve ihmissydän saattaa mukautua muovien läsnäoloon ja pyrkiä poistamaan ne vierasesineinä, kun taas sairaalle kudokselle uhka saattaa olla suurempi ja kudosvaurio vakavampi. Tutkimuksessa kerätty tieto voi tautimekanismien lisäksi informoida ympäristöpolitiikkaa ja -säädöksiä ja siten vaikuttaa välittömästi ihmisten elämään.
Tutkimustamme tukevat: Itä-Suomen yliopisto, Suomen Akatemia, Sigrid Juséliuksen säätiö, Yrjö Jahnssonin säätiö, Paavo Nurmen säätiö ja Aarne Koskelon säätiö.
Avainsanat
Julkaisut
24 kappaletta-
Protocol for achieving enhanced snRNA-seq data quality using Quality Clustering
Tavi, Paavo J; Ojanen, Johannes; Laitinen, Pia; Linna-Kuosmanen, Suvi. 2025. STAR protocols. 6: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Serum RNA Profile Reflects Fluid Status and Atrophic Retinal Changes in Neovascular Age-Related Macular Degeneration
Helotera, Hanna; Kostanek, Joanna; Liukkonen, Mikko; Siintamo, Leea; Linna-Kuosmanen, Suvi; Watala, Cezary; Blasiak, Janusz; Kaarniranta, Kai. 2025. International journal of molecular sciences. 26: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genetics, transcriptomics, metagenomics, and metabolomics in the pathogenesis and prediction of atrial fibrillation
Linna-Kuosmanen, Suvi; Vuori, Matti; Kiviniemi, Tuomas; Palmu, Joonatan; Niiranen, Teemu. 2024. European heart journal supplements. 26: iv33-iv40 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
Schmauch, Eloi; Piening, Brian; Mohebnasab, Maedeh; Xia, Bo; Zhu, Chenchen; Stern, Jeffrey; Zhang, Weimin; Dowdell, Alexa K; Kim, Jacqueline I; Andrijevic, David; Khalil, Karen; Jaffe, Ian S; Loza, Bao Li; Gragert, Loren; Camellato, Brendan R; Oliveira, Michelli F; O’Brien, Darragh P; Chen, Han M; Weldon, Elaina; Gao, Hui; Gandla, Divya; Chang, Andrew; Bhatt, Riyana; Gao, Sarah; Lin, Xiangping; Reddy, Kriyana P; Kagermazova, Larisa; Habara, Alawi H; Widawsky, Sophie; Liang, Feng Xia; Sall, Josep. 2024. Nature medicine. 30: 1448-1460 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
QClus: a droplet filtering algorithm for enhanced snRNA-seq data quality in challenging samples
Schmauch, Eloi; Ojanen, Johannes; Galani, Kyriakitsa; Jalkanen, Juho; Harju, Kristiina; Hollmen, Maija; Kokki, Hannu; Gunn, Jarmo; Halonen, Jari; Hartikainen, Juha; Kiviniemi, Tuomas; Tavi, Pasi; Kaikkonen, Minna U.; Kellis, Manolis; Linna-Kuosmanen, Suvi. 2024. Nucleic acids research. 2025; 53: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Targeting IL-1 controls refractory pityriasis rubra pilaris
Schmauch, Eloi; Severin, Yannik; Xing, Xianying; Mangold, Aaron; Conrad, Curdin; Johannsen, Pål; Kahlenberg, J Michelle; Mellett, Mark; Navarini, Alexander; Nobbe, Stefan; Sarkar, Mrinal K; Satyam, Abhigyan; Tsoi, Lam C; French, Lars E; Nilsson, Jakob; Linna-Kuosmanen, Suvi; Kaikkonen, Minna U; Snijder, Berend; Kellis, Manolis; Gudjonsson, Johann E.; Tsokos, George C; Contassot, Emmanuel; Kolios, Antonios GA. 2024. Science advances. 10: . eado2365 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The impact of multi-omics in medicine
Wang, Linghua; Qu, Jing; Harari, Oscar; Boddey, Justin A; Wang, Zhang; Linna-Kuosmanen, Suvi. 2024. Cell reports medicine. 5: B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä -
Transcriptomic and spatial dissection of human ex vivo right atrial tissue reveals proinflammatory microvascular changes in ischemic heart disease
Linna-Kuosmanen, Suvi; Schmauch, Eloi; Galani, Kyriakitsa; Ojanen, Johannes; Boix, Carles A; Örd, Tiit; Toropainen, Anu; Singha, Prosanta K; Moreau, Pierre R; Harju, Kristiina; Blazeski, Adriana; Segerstolpe, Åsa; Lahtinen, Veikko; Hou, Lei; Kang, Kai; Meibalan, Elamaran; Agudelo, Leandro Z; Kokki, Hannu; Halonen, Jari; Jalkanen, Juho; Gunn, Jarmo; MacRae, Calum A; Hollmén, Maija; Hartikainen, Juha EK; Kaikkonen, Minna U; García-Cardeña, Guillermo; Tavi, Pasi; Kiviniemi, Tuomas; Kellis, Manolis. 2024. Cell reports medicine. 5: . 101556 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genomic approaches to identify and investigate genes associated with atrial fibrillation and heart failure susceptibility
Patel, Kush Ketan; Venkatesan, Cynthia; Abdelhalim, Habiba; Zeeshan, Saman; Arima, Yuichiro; Linna-Kuosmanen, Suvi; Ahmed, Zeeshan. 2023. Human genomics. 17: . 47 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Global MicroRNA Profiling of Vascular Endothelial Cells
Schmauch, Eloi; Levonen, Anna-Liisa; Linna-Kuosmanen, Suvi. Teoksessa: Fiedler, L.R.; Pellet-Many, C(toim.) , 2022. VEGF Signaling. s. 157-186. Humana press A3 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa