Jäniseläintutkimus
Johtajat
Jänistutkimus alkoi Itä-Suomen yliopiston ympäristö- ja biotieteiden laitoksella 2013. Tutkimuksen nykyvaihe on jatkoa Suomen akatemian rahoittamalle CROSSHARES-konsortiolle, joka toteutettiin yhteistyössä Tampereen yliopiston mitokondriometabolian tutkimusryhmän kanssa. Olemme kiinnostuneet lajirajoja ylläpitävistä solunsisäisitä mekanismeista, suomalaisten jänisten populaatiogenetiikasta, rusakon sopeutumismekanismeista ja lajien levittäytymishistoriasta.
Käytämme työssä laajasti niin genomiikan kuin solu- ja molekyylibiologian työkaluja. Työtä mahdollistaaksemme olemme myös julkaisseet ensimmäisen rusakon verrokkiperimän, joka on kromosomeittain vapaasti tarkasteltavissa NCBI-genomiselaimen kautta.
Olemme aloittaneet kesällä 2024 Biodiversity Genomics Europe-hankkeeseen liittyvän tapaustutkimuksen, jossa hyödynnämme koostamiamme verrokkiperimiä ruskon ja metsäjäniksen risteytymisen tutkimukseen sekä rusakon levittäytymishistorian selvittämiseen.
Yhteistyö
Avainsanat
Johtajat
Tutkijatohtorit
Väitöskirjatutkijat
Muut ryhmän jäsenet
-
Manu Soininmäki
Julkaisut
11 kappaletta-
High quality genome assembly of the brown hare (Lepus europaeus) with chromosome-level scaffolding
Michell, Craig; Collins, Joanna; Laine, Pia K; Fekete, Zsófia; Tapanainen, Riikka; Wood, Jonathan M D; Goffart, Steffi; Pohjoismäki, Jaakko L O. 2024. Peer community journal. 4: . e26 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Rusakon aikakausi
Pohjoismäki, Jaakko. 2024. Metsästäjä. 73: 10–13 E1 Yleistajuinen artikkeli, sanomalehtiartikkeli -
Species differences in glycerol-3-phosphate metabolism reveals trade-offs between metabolic adaptations and cell proliferation
Gaertner, Kateryna; Terzioglu, Mügen; Michell, Craig; Tapanainen, Riikka; Pohjoismäki, Jaakko; Dufour, Eric; Saari, Sina. 2024. Biochimica et biophysica acta: bioenergetics. 2025; 1866: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Species-specific variation in mitochondrial genome tandem repeat polymorphisms in hares (Lepus spp., Lagomorpha, Leporidae) provides insight into their evolution
Tapanainen, Riikka; Aasumets, Koit; Fekete, Zsófia; Goffart, Steffi; Dufour, Eric; LO Pohjoismäki, Jaakko. 2024. Gene. 926: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Molecular phenotyping uncovers differences in basic housekeeping functions among closely related species of hares (Lepus spp., Lagomorpha: Leporidae)
Gaertner, Kateryna; Michell, Craig; Tapanainen, Riikka; Goffart, Steffi; Saari, Sina; Soininmäki, Manu; Dufour, Eric; Pohjoismäki, Jaakko LO. 2022. Molecular ecology. 2023; 32: 4097-4117 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Mountain- and brown hare genetic polymorphisms to survey local adaptations and conservation status of the heath hare (Lepus timidus sylvaticus, Nilsson 1831)
Michell, Craig T; Pohjoismäki, Jaakko LO; Spong, Göran; Thulin, Carl-Gustaf. 2022. Scientific data. 9: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Hybridization with mountain hares increases the functional allelic repertoire in brown hares
Pohjoismäki, Jaakko LO; Michell, Craig; Levänen, Riikka; Smith, Steve. 2021. Scientific reports. 11: 15771 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Home ranges of semi-urban brown hares (Lepus europaeus) and mountain hares (Lepus timidus) at northern latitudes
Levänen, Riikka; Pohjoismäki, Jaakko LO; Kunnasranta, Mervi. 2019. Annales zoologici Fennici. 56: 107-120 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Mitochondrial DNA introgression at the northern edge of the brown hare (Lepus europaeus) range
Levänen, R; Kunnasranta, M; Pohjoismäki, J. 2018. Annales zoologici Fennici. 55: 15-24 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Widespread introgression of mountain hare genes into Fennoscandian brown hare populations
Levänen, R; Thulin, CG; Spong, G; Pohjoismäki, JLO. 2018. PLoS ONE. 13: e0191790 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä