Biolääketieteellinen informatiikka
Tutkimusryhmä
01.02.2019 -
Biolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Johtajat
Hyödynnämme laajamittaisia biolääketieteellisiä tietoja, kuten geneettisiä, genomisia, transkriptomisia tietoja sekä biologisia tietokantoja ja datakaivausalgoritmeja luodaksemme sovelluksia biolääketieteelliseen tutkimukseen.
Ryhmämme erityinen kiinnostuksen kohde on kehittää ja yhdistää koneoppimista ja biologisen datan verkostoanalyysiä mahdollistaen:
- Biomarkkerien ja lääkekohteiden löytämisen täsmälääketieteeseen.
- Omics-tietojen ja biologisen tiedon verkoston integroiva analyysi tautimekanismien tutkimiseen ja lääkkeiden/yhdisteiden ‘molekulaaristen toimintojen’ selvittämiseen.
- Tautialatyypien/endotyyppien dataohjattu löytäminen ja niihin liittyvien biomarkkerien tunnistaminen.
- Luokittelumallien käyttö omics-vetoisilla ominaisuuksilla in silico-tehokkuuden ja/tai myrkyllisyyden ennustamiseksi lääkekehityksessä.
Meillä on asiantuntemusta omics-datan analysointityökalujen, verkosto- ja datakaivausalgoritmien sekä tekoälypohjaisten menetelmien, mukaan lukien koneoppimisen, kehittämisessä.
https://github.com/UEFBiomedicalInformaticsLab
Johtajat
Professorit
Tutkijatohtorit
Väitöskirjatutkijat
-
Arindam Ghosh
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Teemu Rintala
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Juho Mikkonen
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta