Vittorio Fortino
Akatemiatutkija
Associate Professor (tenure track) of Health Bioinformatics
Biolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
[email protected] | 050 326 6148
Minulla on kandidaatin ja maisterin tutkinnot tietojenkäsittelytieteessä, tohtorin tutkinto bioinformatiikassa ja dosentin pätevyys terveysbioinformatiikassa. Tutkimukseni keskittyy koneoppimisen, heuristisen optimoinnin ja verkostotietojen louhinta-algoritmien kehittämiseen ja soveltamiseen tähtäimenä ratkaista tarkkuuslääketieteen (PM) keskeiset laskennalliset haasteet. Tarkkuuslääketiede pyrkii yhdistämään molekyylimarkkereita perinteisen kliinisen tiedon kanssa henkilökohtaisen lääkehoidon räätälöimiseksi ja potilastulosten parantamiseksi. Ryhmäni nykyisiin projekteihin kuuluu: 1) potilaiden stratifiointi käyttäen yksittäisiä ja moninäkökulmaisia tietoaineistoja, hyödyntäen syväoppimista, ulottuvuuden vähentämistä ja tietoon pohjautuvaa ryhmittelyanalyysiä; 2) biomarkkereiden löytäminen laajamittaisista genomiikan aineistoista, soveltaen metaheuristisia menetelmiä ominaisuuksien valintaan, ja; 3) verkostotietojen louhinta-algoritmien luominen lääkekohteiden löytämiseksi ja olemassa olevien lääkkeiden uudelleen kohdentamiseksi. Työmme on keskeistä monimutkaisten biologisten tietojen kääntämisessä toiminnallisiksi oivalluksiksi tarkkuuslääketieteessä, tavoitteenamme on optimoida yksilöllinen potilashoito.
Tutkimusryhmät
Projektit
Julkaisut
44/44 kappaletta-
A comprehensive evaluation framework for benchmarking multi-objective feature selection in omics-based biomarker discovery
Cattelani, Luca; Ghosh, Arindam; Rintala, Teemu; Fortino, Vittorio. 2024. IEEE-ACM transactions on computational biology and bioinformatics. 21: 2432-2446 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
COPS: A novel platform for multi-omic disease subtype discovery via robust multi-objective evaluation of clustering algorithms
Rintala, Teemu J; Fortino, Vittorio. 2024. PLoS computational biology. 20: . e1012275 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Differential expression analysis identifies a prognostically significant extracellular matrix–enriched gene signature in hyaluronan-positive clear cell renal cell carcinoma
Jokelainen, Otto; Rintala, Teemu J; Fortino, Vittorio; Pasonen-Seppänen, Sanna; Sironen, Reijo; Nykopp, Timo K. 2024. Scientific reports. 14: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Dual-stage optimizer for systematic overestimation adjustment applied to multi-objective genetic algorithms for biomarker selection
Cattelani, Luca; Fortino, Vittorio. 2024. Briefings in bioinformatics. 2025; 26: 1-10 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Enhancing prediction accuracy of coronary artery disease through machine learning-driven genomic variant selection
Alireza, Z.; Maleeha, M.; Kaikkonen, M.; Fortino, V.. 2024. Journal of translational medicine. 22: . 356 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Integrative network analysis suggests prioritised drugs for atopic dermatitis
Federico, Antonio; Möbus, Lena; Al-Abdulraheem, Zeyad; Pavel, Alisa; Fortino, Vittorio; del Giudice, Giusy; Alenius, Harri; Fyhrquist, Nanna; Greco, Dario. 2024. Journal of translational medicine. 22: . 64 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Multi-objective genetic algorithm for multi-view feature selection
Imani, Vandad; Sevilla-Salcedo, Carlos; Moradi, Elaheh; Fortino, Vittorio; Tohka, Jussi; for the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative. 2024. Applied soft computing. 167: . 112332 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Multi-task deep latent spaces for cancer survival and drug sensitivity prediction
Rintala, Teemu J; Napolitano, Francesco; Fortino, Vittorio. 2024. Bioinformatics. 40: ii182-ii189 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Network-based estimation of therapeutic efficacy and adverse reaction potential for prioritisation of anti-cancer drug combinations
Ghosh, Arindam; Fortino, Vittorio. 2024. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2025; 27: 65-77 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Optimizing Feature Selection for Binary Classification with Noisy Labels: A Genetic Algorithm Approach
Imani, Vandad; Moradi, Elaheh; Sevilla-Salcedo, Carlos; Fortino, Vittorio; Tohka, Jussi. Teoksessa: Daimi, Kevin; Al Sadoon, Abeer(toim.) , 2024. Proceedings of the Second International Conference on Advances in Computing Research (ACR’24). s. 392-403. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa