Vittorio Fortino
Professori
Associate Professor (tenure track) of Health Bioinformatics
Biolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
[email protected] | 050 326 6148
Minulla on kandidaatin ja maisterin tutkinnot tietojenkäsittelytieteessä, tohtorin tutkinto bioinformatiikassa ja dosentin pätevyys terveysbioinformatiikassa. Tutkimukseni keskittyy koneoppimisen, heuristisen optimoinnin ja verkostotietojen louhinta-algoritmien kehittämiseen ja soveltamiseen tähtäimenä ratkaista tarkkuuslääketieteen (PM) keskeiset laskennalliset haasteet. Tarkkuuslääketiede pyrkii yhdistämään molekyylimarkkereita perinteisen kliinisen tiedon kanssa henkilökohtaisen lääkehoidon räätälöimiseksi ja potilastulosten parantamiseksi. Ryhmäni nykyisiin projekteihin kuuluu: 1) potilaiden stratifiointi käyttäen yksittäisiä ja moninäkökulmaisia tietoaineistoja, hyödyntäen syväoppimista, ulottuvuuden vähentämistä ja tietoon pohjautuvaa ryhmittelyanalyysiä; 2) biomarkkereiden löytäminen laajamittaisista genomiikan aineistoista, soveltaen metaheuristisia menetelmiä ominaisuuksien valintaan, ja; 3) verkostotietojen louhinta-algoritmien luominen lääkekohteiden löytämiseksi ja olemassa olevien lääkkeiden uudelleen kohdentamiseksi. Työmme on keskeistä monimutkaisten biologisten tietojen kääntämisessä toiminnallisiksi oivalluksiksi tarkkuuslääketieteessä, tavoitteenamme on optimoida yksilöllinen potilashoito.
Tutkimusryhmät
Projektit
Julkaisut
47/47 kappaletta-
Comparison of missing data handling methods for variant pathogenicity predictors
Särkkä, Mikko; Myöhänen, Sami; Marinov, Kaloyan; Saarinen, Inka; Lahti, Leo; Fortino, Vittorio; Paananen, Jussi, 2025, NAR genomics and bioinformatics, 7, 4, lqaf133. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Oral Immunotherapy Induces Shift in lncRNA Expression Modulating Allergen‐Specific Immune Responses
Liong, Olivia; Palosuo, Kati; Hinkkanen, Victoria; Fortino, Vittorio; Mäkelä, Mika J; Karisola, Piia, 2025, Allergy, [Epub ahead of print 28 Nov 2025], 1-12. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Unmasking metabolic disruptors: The NEMESIS project's quest for Novel Biomarkers, Evidence on Adverse Effects, and Efficient Methodologies
Hakomäki, Henriikka; Pitkänen, Sini; Levonen, Anna-Liisa; Honkakoski, Paavo; Greco, Dario; D'Alessandro, Nicoletta; Saarimäki, Laura Aliisa; Viegas, Susana; Godinho, Cristina; Fyhrquist, Nanna; Wincent, Emma; Lauschke, Volker M; Hukkanen, Janne; Hakkola, Jukka; Vallier, Ludovic; Fortino, Vittorio; Afantitis, Antreas; Sawatani, Toshiaki; Guzman, Tereso J; Cnop, Miriam; Nawrot, Tim; Harlid, Sophia; Vinnars, Marie-Therese; Tardon, Adonina; Grimalt, Joan O; Küblbeck, Jenni; Rysä, Jaana, 2025, Open research Europe, 4, 194. B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä -
A comprehensive evaluation framework for benchmarking multi-objective feature selection in omics-based biomarker discovery
Cattelani, Luca; Ghosh, Arindam; Rintala, Teemu; Fortino, Vittorio, 2024, IEEE-ACM transactions on computational biology and bioinformatics, 21, 6, 2432-2446. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
COPS: A novel platform for multi-omic disease subtype discovery via robust multi-objective evaluation of clustering algorithms
Rintala, Teemu J; Fortino, Vittorio, 2024, PLoS computational biology, 20, 8, e1012275. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Differential expression analysis identifies a prognostically significant extracellular matrix–enriched gene signature in hyaluronan-positive clear cell renal cell carcinoma
Jokelainen, Otto; Rintala, Teemu J; Fortino, Vittorio; Pasonen-Seppänen, Sanna; Sironen, Reijo; Nykopp, Timo K, 2024, Scientific reports, 14, 1, 10626. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Dual-stage optimizer for systematic overestimation adjustment applied to multi-objective genetic algorithms for biomarker selection
Cattelani, Luca; Fortino, Vittorio, 2024, Briefings in bioinformatics, 26, 1, 1-10. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Enhancing prediction accuracy of coronary artery disease through machine learning-driven genomic variant selection
Alireza, Z.; Maleeha, M.; Kaikkonen, M.; Fortino, V., 2024, Journal of translational medicine, 22, 1, 356. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Integrative network analysis suggests prioritised drugs for atopic dermatitis
Federico, Antonio; Möbus, Lena; Al-Abdulraheem, Zeyad; Pavel, Alisa; Fortino, Vittorio; del Giudice, Giusy; Alenius, Harri; Fyhrquist, Nanna; Greco, Dario, 2024, Journal of translational medicine, 22, 1, 64. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Multi-objective genetic algorithm for multi-view feature selection
Imani, Vandad; Sevilla-Salcedo, Carlos; Moradi, Elaheh; Fortino, Vittorio; Tohka, Jussi; for the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative, 2024, Applied soft computing, 167, Part B, 112332. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä


