Einari Niskanen - UEFConnect

Activation of steroid hormone receptors by metabolism-disrupting chemicals

Pitkänen, Sini; Niskanen, Jonna; Mysore, Raghavendra; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Pijnenburg, Dirk; van Beuningen, Rinie; Rashidian, Azam; Kronenberger, Thales; Poso, Antti; Levonen, Anna-Liisa; Küblbeck, Jenni; Honkakoski, Paavo, 2025, Toxicology and applied pharmacology, 499, 117335. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Androgen receptor-mediated assisted loading of the glucocorticoid receptor modulates transcriptional responses in prostate cancer cells

Hiltunen, Johannes; Helminen, Laura; Aaltonen, Niina; Launonen, Kaisa-Mari; Laakso, Hanna; Malinen, Marjo; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville, 2025, Genome research, 35, 8, 1717-1732. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

SUMOylation inhibition potentiates the glucocorticoid receptor to program growth arrest of acute lymphoblastic leukemia cells

Valima, Emma; Varis, Vera; Bureiko, Kseniia; Lempiäinen, Joanna K; Schroderus, Anna-Mari; Oksa, Laura; Lohi, Olli; Kinnunen, Tuure; Varjosalo, Markku; Niskanen, Einari A; Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J, 2025, Oncogene, 44, 18, 1259–1271. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

k-mer manifold approximation and projection for visualizing DNA sequences

Fu, Chengbo; Niskanen, Einari A; Wei, Gong-Hong; Yang, Zhirong; Sanvicente-García, Marta; Güell, Marc; Cheng, Lu, 2025, Genome research, 35, 5, 1234-1246. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Central role of SUMOylation in the regulation of chromatin interactions and transcriptional outputs of the androgen receptor in prostate cancer cells

Launonen, Kaisa-Mari; Varis, Vera; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Varjosalo, Markku; Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J, 2024, Nucleic acids research, 52, 16, 9519-9535. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Secreted factors from M1 macrophages drive prostate cancer stem cell plasticity by upregulating NANOG, SOX2, and CD44 through NFκB-signaling

Kainulainen, Kirsi; Niskanen, Einari A; Kinnunen, Johanna; Mäki-Mantila, Kaisa; Hartikainen, Kiia; Paakinaho, Ville; Malinen, Marjo; Ketola, Kirsi; Pasonen-Seppänen, Sanna, 2024, Oncoimmunology, 13, 1, 2393442. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Steroidireseptorien säätely

Paakinaho, Ville; Niskanen, Einari A, 2024, Duodecim, 140, 9, 759-767. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Chromatin accessibility and pioneer factor FOXA1 restrict glucocorticoid receptor action in prostate cancer

Helminen, Laura; Huttunen, Jasmin; Tulonen, Melina; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville, 2023, Nucleic acids research, 2024; 52, 2, 625-642. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Complementary analysis of proteome‐wide proteomics reveals changes in RNA binding protein‐profiles during prostate cancer progression

Aikio, Erika; Koivukoski, Sonja; Kallio, Elina; Sadeesh, Nithin; Niskanen, Einari A; Latonen, Leena, 2023, Cancer reports, 6, 10, e1886. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Genetic variation is a key determinant of chromatin accessibility and drives differences in the regulatory landscape of C57BL/6J and 129S1/SvImJ mice

Mononen, Juho; Taipale, Mari; Malinen, Marjo; Velidendla, Bharadwaja; Niskanen, Einari; Levonen, Anna-Liisa; Ruotsalainen, Anna-Kaisa; Heikkinen, Sami, 2023, Nucleic acids research, 2024; 52, 6, 2904-2923. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

International Online Team-Based Learning in Higher Education of Biomedicine - Evaluation by Learning Analytics

Mairinoja, Laura; López-Pernas, Sonsoles; Elmoazen, Ramy; Niskanen, Einari A.; Kuningas, Tiina; Wärri, Anni; Saqr, Mohammed; Strauss, Leena, 2023, Elmoazen, Ramy; López-Pernas, Sonsoles; Misiejuk, Kamila; Khalil, Mohammad; Wasson, Barbara; Saqr, Mohammed, Proceedings of the Technology-Enhanced Learning in Laboratories Workshop (TELL 2023), 49-60. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa

Parvovirus nonstructural protein 2 interacts with chromatin-regulating cellular proteins

Mattola, Salla; Salokas, Kari; Aho, Vesa; Mäntylä, Elina; Salminen, Sami; Hakanen, Satu; Niskanen, Einari A.; Svirskaite, Julija; Ihalainen, Teemu O.; Airenne, Kari J.; Kaikkonen-Määttä, Minna; Parrish, Colin R.; Varjosalo, Markku; Vihinen-Ranta, Maija, 2022, PLoS pathogens, 18, 4, e1010353. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility

Manjur, ABMK; Lempiäinen, JK; Malinen, M; Varjosalo, M; Palvimo, JJ; Niskanen, EA, 2021, Journal of steroid biochemistry and molecular biology, 210, 105873. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells

Launonen, Kaisa-Mari; Paakinaho, Ville; Sigismondo, Gianluca; Malinen, Marjo; Sironen, Reijo; Hartikainen, Jaana M; Laakso, Hanna; Visakorpi, Tapio; Krijgsveld, Jeroen; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J, 2021, Oncogene, 40, 27, 4567-4579. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

SUMOylation regulates the protein network and chromatin accessibility at glucocorticoid receptor-binding sites

Paakinaho, Ville; Lempiäinen, Joanna K; Sigismondo, Gianluca; Niskanen, Einari A; Malinen, Marjo; Jääskeläinen, Tiina; Varjosalo, Markku; Krijgsveld, Jeroen; Palvimo, Jorma J, 2021, Nucleic acids research, 49, 4, 1951-1971. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Stress-induced nuclear condensation of NELF drives transcriptional downregulation

Rawat, Prashant; Boehning, Marc; Hummel, Barbara; Aprile-Garcia, Fernando; Pandit, Anwit S; Eisenhardt, Nathalie; Khavaran, Ashkan; Niskanen, Einari; Vos, Seychelle M; Palvimo, Jorma J; Pichler, Andrea; Cramer, Patrick; Sawarkar, Ritwick, 2021, Molecular cell, 81, 5, 1013-1026. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

BCOR-coupled H2A monoubiquitination represses a subset of androgen receptor target genes regulating prostate cancer proliferation

Lempiäinen, JK; Manjur, ABMK; Malinen, M; Ketola, K; Niskanen, EA; Palvimo, JJ, 2020, Oncogene, 39, 2391-2407. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Histonien muokkaukset ja geenien säätely

Sutinen, Siiri; Niskanen, Einari, 2020, Solubiologi, 1, 12-21. D1 Artikkeli ammattilehdessä

IRF2BP2 Modulates the Crosstalk between Glucocorticoid and TNF Signaling

Kaiser Manjur, ABM; Lempiäinen, Joanna K; Malinen, Marjo; Palvimo, Jorma J; Niskanen, Einari A, 2019, Journal of steroid biochemistry and molecular biology, 192, 105382. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Lack of androgen receptor SUMOylation results in male infertility due to epididymal dysfunction

Zhang, Fu-Ping; Malinen, Marjo; Mehmood, Arfa; Lehtiniemi, Tiina; Jääskeläinen, Tiina; Niskanen, Einari A; Korhonen, Hanna; Laiho, Asta; Elo, Laura L; Ohlsson, Claes; Kotaja, Noora; Poutanen, Matti; Sipilä, Petra; Palvimo, Jorma J, 2019, Nature communications, 10, 777. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Agonist-specific Protein Interactomes of Glucocorticoid and Androgen Receptor as Revealed by Proximity Mapping

Lempiäinen Joanna K, Niskanen Einari A, Vuoti Kaisa-Mari, Lampinen Riikka E, Göös Helka, Varjosalo Markku, Palvimo Jorma J, 2017, Molecular and cellular proteomics, 16, 8, 1462-1474. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Chromatin SUMOylation in heat stress : to protect, pause and organise?

Niskanen Einari A, Palvimo Jorma J, 2017, Bioessays, 39, 6, 1600263. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Crosstalk between androgen and pro-inflammatory signaling remodels androgen receptor and NF-kB cistrome to reprogram the prostate cancer cell transcriptome

Malinen Marjo, Niskanen Einari A, Kaikkonen Minna U, Palvimo Jorma J, 2016, Nucleic acids research, 45, 2, 619-630. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Global analysis of transcription in castration-resistant prostate cancer cells uncovers active enhancers and direct androgen receptor targets

Toropainen Sari, Niskanen Einari A, Malinen Marjo, Sutinen Päivi, Kaikkonen Minna U, Palvimo Jorma J, 2016, Scientific reports, 6, 33510. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Promoter-Targeted Histone Acetylation of Chromatinized Parvoviral Genome Is Essential for the Progress of Infection

Mäntylä E, Salokas K, Oittinen M, Aho V, Mäntysaari P, Palmujoki L, Kalliolinna O, Ihalainen TO, Niskanen EA, Timonen J, Viiri K, Vihinen-Ranta M, 2016, Journal of virology, 90, 8, 4059-4066. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Global SUMOylation on active chromatin is an acute heat stress response restricting transcription

Niskanen Einari A, Malinen Marjo, Sutinen Päivi, Toropainen Sari, Paakinaho Ville, Vihervaara Anniina, Joutsen Jenny, Kaikkonen Minna U, Sistonen Lea, Palvimo Jorma J, 2015, Genome biology, 16, 153. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Reorganization of nuclear pore complexes and the lamina in late-stage parvovirus infection

Mäntylä Elina, Niskanen Einari A, Ihalainen Teemu O, Vihinen-Ranta Maija, 2015, Journal of virology, Nov 15;89, 22, 11706-11710. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Tarkenna hakuasi

Einari A. Niskanen

Tutkimusryhmät

Projektit

Avainsanat

Julkaisut

Activation of steroid hormone receptors by metabolism-disrupting chemicals

Androgen receptor-mediated assisted loading of the glucocorticoid receptor modulates transcriptional responses in prostate cancer cells

SUMOylation inhibition potentiates the glucocorticoid receptor to program growth arrest of acute lymphoblastic leukemia cells

k-mer manifold approximation and projection for visualizing DNA sequences

Central role of SUMOylation in the regulation of chromatin interactions and transcriptional outputs of the androgen receptor in prostate cancer cells

Secreted factors from M1 macrophages drive prostate cancer stem cell plasticity by upregulating NANOG, SOX2, and CD44 through NFκB-signaling

Steroidireseptorien säätely

Chromatin accessibility and pioneer factor FOXA1 restrict glucocorticoid receptor action in prostate cancer

Complementary analysis of proteome‐wide proteomics reveals changes in RNA binding protein‐profiles during prostate cancer progression

Genetic variation is a key determinant of chromatin accessibility and drives differences in the regulatory landscape of C57BL/6J and 129S1/SvImJ mice

International Online Team-Based Learning in Higher Education of Biomedicine - Evaluation by Learning Analytics

Parvovirus nonstructural protein 2 interacts with chromatin-regulating cellular proteins

BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility

Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells

SUMOylation regulates the protein network and chromatin accessibility at glucocorticoid receptor-binding sites

Stress-induced nuclear condensation of NELF drives transcriptional downregulation

BCOR-coupled H2A monoubiquitination represses a subset of androgen receptor target genes regulating prostate cancer proliferation

Histonien muokkaukset ja geenien säätely

IRF2BP2 Modulates the Crosstalk between Glucocorticoid and TNF Signaling

Lack of androgen receptor SUMOylation results in male infertility due to epididymal dysfunction

Agonist-specific Protein Interactomes of Glucocorticoid and Androgen Receptor as Revealed by Proximity Mapping

Chromatin SUMOylation in heat stress : to protect, pause and organise?

Crosstalk between androgen and pro-inflammatory signaling remodels androgen receptor and NF-kB cistrome to reprogram the prostate cancer cell transcriptome

Global analysis of transcription in castration-resistant prostate cancer cells uncovers active enhancers and direct androgen receptor targets

Promoter-Targeted Histone Acetylation of Chromatinized Parvoviral Genome Is Essential for the Progress of Infection

Global SUMOylation on active chromatin is an acute heat stress response restricting transcription

Reorganization of nuclear pore complexes and the lamina in late-stage parvovirus infection