Leena Latonen
Yliopistotutkija
K. Albin Johansson Cancer Research Fellow
Dosentti (syöpäbiologia)
Varajohtaja, Biolääketieteen yksikkö
Lääketieteen laitos, Biolääketiede
leena.latonen@uef.fi | 050 576 7822
Syövän stressivasteiden tutkimuksessa selvitämme niitä molekyyli-, solu- ja kudostason mekanismeja, jotka aikaansaavat syöpäsolujen kohonneen sietokyvyn stressiä kohtaan. Tutkimme mm. molekyylireittejä, jotka johtavat syöpä- ja hermosolujen erilaistiin kykyihin käsitellä proteiini- ja RNA-kertymiä, sekä syövän kykyä muodostaa vastustuskyky lääkeaineille. Tutkimme myös syövän kasvutapoja kudoksessa ja yhdistämme tätä tietoa syöpäsolujen molekyylitietoihin ymmärtääksemme paremmin niitä mekanismeja, joiden avulla syöpäsolut selviävät monenlaisten stressien ristipaineessa. Kudosbiologian yhteistyöprojekteissamme etsimme parempia tapoja kuvantaa, visualisoida ja analysoida kvantitatiivisesti histologiaa digitaalisen patologian, koneoppimisen ja tekoälyn keinoin.
Molekyylimekanismien tunteminen ja niiden yhdistäminen kudostason seurauksiin on tärkeää parempien hoitojen kehittämiseksi lukuisia sairauksia vastaan. Tarkempi ymmärrys solujen stressivasteiden toiminnasta mahdollistaa uusien lääke- ja terapiakohteiden tunnistamisen. Jos voimme estää syöpäsolujen lisääntynyttä kykyä puskuroida stressiä, voimme löytää keinoja tuhota syöpäsolut. Toisaalta taas aktivoimalla tällaisia reittejä puskurikyvyttömissä soluissa, voimme estää solu- ja kudosstressin haittavaikutuksia, kuten solukuolemaa hermorappeumassa.
Tutkimusryhmän nettisivut:
https://sites.uef.fi/cancer-stress-biology-latonen/
Julkaisut
14 kappaletta-
Expression and ERG regulation of PIM kinases in prostate cancer
Eerola, Sini K; Kohvakka, Annika; Tammela, Teuvo LJ; Koskinen, Päivi J; Latonen, Leena; Visakorpi, Tapio. Cancer medicine 10 10: 3427-3436. 2021 -
Building a central repository landmarks a new era for artificial intelligence - assisted digital pathology development in Europe
Latonen, Leena; Ruusuvuori, Pekka. European journal of cancer 150: 31-32. 2021 -
Convolutional Neural Network-Based Artificial Intelligence for Classification of Protein Localization Patterns
Liimatainen, Kaisa; Huttunen, Riku; Latonen, Leena; Ruusuvuori, Pekka. Biomolecules 11 2: 264. 2021 -
Virtual reality for 3D histology: multi-scale visualization of organs with interactive feature exploration
Liimatainen, Kaisa; Latonen, Leena; Valkonen, Masi; Kartasalo, Kimmo; Ruusuvuori, Pekka. Bmc cancer 21 1: 1133. 2021 -
A systematic comparison of data- and knowledge-driven approaches to disease subtype discovery
Rintala, TJ; Federico, A; Latonen, L; Greco, D; Fortino, V. Briefings in bioinformatics 22 6: bbab314. 2021 -
Proteomic Landscape of Prostate Cancer: The View Provided by Quantitative Proteomics, Integrative Analyses, and Protein Interactomes
Sadeesh, Nithin; Scaravilli, Mauro; Latonen, Leena. Cancers 13 19: 4829. 2021 -
Androgen-Driven Fusion Genes and Chimeric Transcripts in Prostate Cancer
Scaravilli, Mauro; Koivukoski, Sonja; Latonen, Leena. Frontiers in cell and developmental biology 9: 623809. 2021 -
ANHIR: Automatic Non-Rigid Histological Image Registration Challenge
Borovec, Jiri; Kybic, Jan; Arganda-Carreras, Ignacio; Sorokin, Dmitry V; Bueno, Gloria; Khvostikov, Alexander V; Bakas, Spyridon; Chang, Eric I-Chao; Heidmann, Stefan; Kartasalo, Kimmo; Latonen, Leena; Lotz, Johannes; Noga, Michelle; Pati, Sarthak; Punithakumar, Kumaradevan; Ruusuvuori, Pekka; Skalski, Andrzej; Tahmasebi, Nazanin; Valkonen, Masi; Venet, Ludovic et al.. IEEE transactions on medical imaging 39 10: 3042-3052. 2020 -
AR and ERG drive the expression of prostate cancer specific long noncoding RNAs
Kohvakka, Annika; Sattari, Mina; Shcherban, Anastasia; Annala, Matti; Urbanucci, Alfonso; Kesseli, Juha; Tammela, Teuvo L J; Kivinummi, Kati; Latonen, Leena; Nykter, Matti; Visakorpi, Tapio. Oncogene 39 30: 5241-5251. 2020 -
Integrative proteomics of prostate cancer
Scaravilli, M; Afyounian, E; Nykter, M; Visakorpi, T; Latonen, L. Current opinion in endocrine and metabolic research 10: 43-49. 2020