Syövän stressivasteiden tutkimuksessa selvitämme niitä molekyyli-, solu- ja kudostason mekanismeja, jotka aikaansaavat syöpäsolujen kohonneen sietokyvyn stressiä kohtaan. Tutkimme mm. molekyylireittejä, jotka johtavat syöpä- ja hermosolujen erilaistiin kykyihin käsitellä proteiini- ja RNA-kertymiä, sekä syövän kykyä muodostaa vastustuskyky lääkeaineille. Tutkimme myös syövän kasvutapoja kudoksessa ja yhdistämme tätä tietoa syöpäsolujen molekyylitietoihin ymmärtääksemme paremmin niitä mekanismeja, joiden avulla syöpäsolut selviävät monenlaisten stressien ristipaineessa. Kudosbiologian yhteistyöprojekteissamme etsimme parempia tapoja kuvantaa, visualisoida ja analysoida kvantitatiivisesti histologiaa digitaalisen patologian, koneoppimisen ja tekoälyn keinoin.
Molekyylimekanismien tunteminen ja niiden yhdistäminen kudostason seurauksiin on tärkeää parempien hoitojen kehittämiseksi lukuisia sairauksia vastaan. Tarkempi ymmärrys solujen stressivasteiden toiminnasta mahdollistaa uusien lääke- ja terapiakohteiden tunnistamisen. Jos voimme estää syöpäsolujen lisääntynyttä kykyä puskuroida stressiä, voimme löytää keinoja tuhota syöpäsolut. Toisaalta taas aktivoimalla tällaisia reittejä puskurikyvyttömissä soluissa, voimme estää solu- ja kudosstressin haittavaikutuksia, kuten solukuolemaa hermorappeumassa.
Tutkimusryhmän nettisivut:
https://sites.uef.fi/cancer-stress-biology-latonen/
Tutkimusryhmät
Julkaisut
37/37 kappaletta-
A PEG-assisted membrane coating to prepare biomimetic mesoporous silicon for PET/CT imaging of triple-negative breast cancer
Wen, Huang; Martínez, María Gómez; Happonen, Emilia; Qian, Jing; Vallejo, Vanessa Gómez; Mendazona, Helena Jorge; Jokivarsi, Kimmo; Scaravilli, Mauro; Latonen, Leena; Llop, Jordi; Lehto, Vesa-Pekka; Xu, Wujun. 2024. International journal of pharmaceutics. 652: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Long noncoding RNA EPCART regulates translation through PI3K/AKT/mTOR pathway and PDCD4 in prostate cancer
Kohvakka, Annika; Sattari, Mina; Nättinen, Janika; Aapola, Ulla; Gregorová, Pavlína; Tammela, Teuvo LJ; Uusitalo, Hannu; Sarin, L Peter; Visakorpi, Tapio; Latonen, Leena. 2024. Cancer gene therapy. 31: 1536-1546 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Platinum-based drugs induce phenotypic alterations in nucleoli and Cajal bodies in prostate cancer cells
Batnasan, Enkhzaya; Kärkkäinen, Minttu; Koivukoski, Sonja; Sadeesh, Nithin; Tollis, Sylvain; Ruusuvuori, Pekka; Scaravilli, Mauro; Latonen, Leena. 2024. Cancer cell international. 24: . 29 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
RNA:han sitoutuvat proteiinit syövän lääkehoidossa ja -resistenssissä
Latonen, Leena. 2024. Duodecim. 140: 281-287 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer
Kiviaho, Antti; Eerola, Sini K.; Kallio, Heini M. L.; Andersen, Maria K.; Hoikka, Miina; Tiihonen, Aliisa M.; Salonen, Iida; Spotbeen, Xander; Giesen, Alexander; Parker, Charles T. A.; Taavitsainen, Sinja; Hantula, Olli; Marttinen, Mikael; Hermelo, Ismaïl; Ismail, Mazlina; Midtbust, Elise; Wess, Maximilian; Devlies, Wout; Sharma, Abhibhav; Krossa, Sebastian; Häkkinen, Tomi; Afyounian, Ebrahim; Vandereyken, Katy; Kint, Sam; Kesseli, Juha; Tolonen, Teemu; Tammela, Teuvo L. J.; Viset, Trond; Størke. 2024. Nature communications. 15: . 9949 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The ACROBAT 2022 Challenge: Automatic Registration Of Breast Cancer Tissue
Weitz, Philippe; Valkonen, Masi; Solorzano, Leslie; Carr, Circe; Kartasalo, Kimmo; Boissin, Constance; Koivukoski, Sonja; Kuusela, Aino; Rasic, Dusan; Feng, Yanbo; Pouplier, Sandra Sinius; Sharma, Abhinav; Eriksson, Kajsa Ledesma; Robertson, Stephanie; Marzahl, Christian; Gatenbee, Chandler D; Anderson, Alexander RA; Wodzinski, Marek; Jurgas, Artur; Marini, Niccolò; Atzori, Manfredo; Müller, Henning; Budelmann, Daniel; Weiss, Nick; Heldmann, Stefan; Lotz, Johannes; Wolterink, Jelmer M; De Santi,. 2024. Medical image analysis. 97: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Virtuaalimaailma histologian oppimisen tukena
Mairinoja, Laura; Liimatainen, Kaisa; Koivukoski, Sonja; Latonen, Leena; Strauss, Leena; Ruusuvuori, Pekka. 2024. Yliopistopedagogiikka. 31: . B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä -
Virtuaalivärjäys mahdollistaa ympäristöystävällisempää histologiaa kemikaaleja vähentämällä
Koivukoski, Sonja; Ruusuvuori, Pekka; Latonen, Leena. 2024. Duodecim. 140: 1071-1078 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Virtual staining for histology by deep learning
Latonen, Leena; Koivukoski, Sonja; Khan, Umair; Ruusuvuori, Pekka. 2024. Trends in biotechnology. 42: 1177-1191 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A Multi-Stain Breast Cancer Histological Whole-Slide-Image Data Set from Routine Diagnostics
Weitz, Philippe; Valkonen, Masi; Solorzano, Leslie; Carr, Circe; Kartasalo, Kimmo; Boissin, Constance; Koivukoski, Sonja; Kuusela, Aino; Rasic, Dusan; Feng, Yanbo; Sinius Pouplier, Sandra; Sharma, Abhinav; Ledesma Eriksson, Kajsa; Latonen, Leena; Laenkholm, Anne-Vibeke; Hartman, Johan; Ruusuvuori, Pekka; Rantalainen, Mattias. 2023. Scientific data. 10: . 562 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä