Mikko Nissi
Professori
Teknillisen fysiikan laitos, Luonnontieteiden, metsätieteiden ja tekniikan tiedekunta
mikko.nissi@uef.fi | 050 595 5517
FT Nissi on professori Teknillisen fysiikan laitoksella Itä-Suomen yliopistossa. FT Nissi johtaa tutkimusryhmää, joka keskittyy prekliinisen kvantitatiivisen magneettikuvauksen (MRI) tutkimukseen. Vuonna 2021 FT Nissi toimi myös laitoksen varajohtajana. Ryhmän tutkimuskohteet käsittelevät erilaisia relaksometrisiä menetelmiä, kuten esimerkiksi useita pyörivän ja laboratoriokoordinaatiston relaksaatiomenetelmiä ja niiden kuvausstrategioita, sekä kvantitatiivisen magneettisen suskeptibiliteetin määritysmenetelmiä. Pääasiallinen sovellusala FT Nissin ryhmän tutkimuksessa on ollut tuki- ja liikuntaelimistön sairaudet ja niiden diagnostiikka, mutta ryhmän tutkimuskohteisiin kuuluvat myös erityisesti ultralyhyen kaikuajan menetelmien kuten SWIFT-kuvaussekvenssin, erilaisten kuvankeräyksen ja kuvarekonstruktion menetelmien kehittäminen useisiin erilaisiin sovelluskohteisiin.
FT Nissin viimeisimmät tutkimusrahoitukset on myönnetty projektiin, jossa kehitetään virtuaalisen histologien menetelmää tekoälyavusteisella sormenjälkimagneettikuvauksella (Suomen Akatemia, #354693) sekä nopeiden kvantitatiivisten ultralyhyen kaikuajan magneettikuvausmenetelmiä SWIFT-sekvenssiä ja sen variantteja sekä iteratiivisia kuvarekonstruktiomenetelmiä hyödyntäen (Suomen Akatemia, #325146), ja mikromagneettikuvauksen teollisten sovellusten innovaatio- ja kehitysympäristön kehittämishankkeeseen, jossa hankittiin 11.74 Teslan mikroMRI-laitteisto sekä pilotoitiin kasvituotannon ja teollisten materiaalien mikromagneettikuvausta (Euroopan aluekehitysrahasto, #A73998 ja #A74016).
Tutkimusryhmät
Opetus- ja muut tehtävät
Opetustehtävät
Magneettikuvauksen kurssin (5 op) luennointi, kandi-, maisteri- ja tohtoriopintojen ohjaus. Lääketieteellisen fysiikan seminaarisarjan koordinointi.
Yhteiskunnalliset tehtävät
Lääketieteellisen fysiikan ja tekniikan yhdistys, hallituksen jäsen; Suomen fyysikkoseura, hallituksen jäsen; International Society for Magnetic Resonance in Medicine, jäsen; Suomen Radiologiyhdistys, jäsen
Tutkimusprojektit
Akatemian konsortioprojekti: Tekoälyavusteinen virtuaalinen histologia sormenjälkimagneettikuvauksella / Konsortio: QMRI-CO (354693). Akatemiaprojekti: Uusia nopeita ultralyhyen kaikuajan kvantitatiivisia magneettikuvausmenetelmiä (QuUSTE) (325146). EAKR-hanke: Mikromagneettikuvaukseen perustuva kehitys- ja innovaatioympäristö materiaalitutkimuksen teollisiin sovelluksiin, kehitys ja investointi (MikroMRI). Akatemiatutkijaprojekti: Nivelruston ja rustonalaisen luun magneettikuvauksen anisotropia (Akatemiahankkeet 285909, 293970, 319440)
Julkaisut
79/79 kappaletta-
Anisotropy of T2 and T1ρ relaxation time in articular cartilage at 3 T
Kantola, Ville; Karjalainen, Jouni; Jaakola, Tomi; Leskinen, Henri PP; Nissi, Mikko J; Casula, Victor; Nieminen, Miika T. 2024. Magnetic resonance in medicine. 92: 1177-1188 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Measurement of T1ρ dispersion with compressed sensing and magnetization prepared radial balanced steady‐state free precession in spontaneous human osteoarthritis
Pala, S; Paajanen, A; Ristaniemi, A; Nippolainen, E; Afara, IO; Nykänen, O; Nissi, MJ. 2024. Magnetic resonance in medicine. 92: 2127-2139 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Non-invasive assessment and visualization of Phytophthora cactorum infection in strawberry crowns using quantitative magnetic resonance imaging
Tuomainen, Teemu Valtteri; Toljamo, Anna; Kokko, Harri; Nissi, Mikko Johannes. 2024. Scientific reports. 14: . 2129 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
3-D T1 relaxation time measurements in an equine model of subtle post-traumatic osteoarthritis using MB-SWIFT
Pala, Swetha; Hänninen, Nina E; Mohammadi, Ali; Ebrahimi, Mohammadhossein; te Moller, Nikae CR; Brommer, Harold; René van Weeren, P; Mäkelä, Janne TA; Korhonen, Rami K; Afara, Isaac O; Töyräs, Juha; Mikkonen, Santtu; Nissi, Mikko J; Nykänen, Olli. 2023. Journal of orthopaedic research. 41: 2657-2666 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Assessing post-traumatic changes in cartilage using T1 dispersion parameters
Elsayed, Hassaan; Karjalainen, Jouni; Nissi, Mikko J.; Ketola, Juuso; Kajabi, Abdul Wahed; Casula, Victor; Zbýň, Štefan; Nieminen, Miika T.; Hanni, Matti. 2023. Magnetic resonance imaging. 97: 91-101 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Axon fiber orientation as the source of T1 relaxation anisotropy in white matter: A study on corpus callosum in vivo and ex vivo
Kauppinen, Risto A; Thothard, Jeromy; Leskinen, Henri PP; Pisharady, Pramod K; Manninen, Eppu; Kettunen, Mikko; Lenglet, Christophe; Gröhn, Olli HJ; Garwood, Michael; Nissi, Mikko J. 2023. Magnetic resonance in medicine. 90: 708-721 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Does T1ρ Measure Proteoglycan Concentration in Cartilage?
Casula, Victor; Karjalainen, Jouni; Mlynarik, Vladimir; Liimatainen, Timo; Hanni, Matti; Oei, Edwin H.G.; Nissi, Mikko J.; Nieminen, Miika T.. 2023. Journal of magnetic resonance imaging. 2024; 59: 1874-1875 B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä -
Epiphyseal cartilage vascular architecture at the distal humeral osteochondritis dissecans predilection site in juvenile pigs
Toth, Ferenc; Nissi, Mikko J; Armstrong, Alexandra R; Buko, Erick O; Johnson, Casey P. 2023. Journal of orthopaedic research. 2024; 42: 737-744 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Fast Compressed Sensing of 3D Radial T1 Mapping with Different Sparse and Low-Rank Models
Paajanen, Antti; Hanhela, Matti; Hänninen, Nina; Nykänen, Olli; Kolehmainen, Ville; Nissi, Mikko J. 2023. Journal of imaging. 9: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Magnetic resonance imaging of water vapor absorption in simulated corrugated board
Tuomainen, Teemu V; Silvennoinen, Jukka; Mattila, Terhi; Kettunen, Mikko I; Nissi, Mikko J. 2023. Cellulose. 30: 9271-9281 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä