
Johtajat
Selvitämme niitä molekyyli-, solu- ja kudostason mekanismeja, joilla syöpä syntyy ja muuttuu hoidolle vastustuskykyiseksi. Tutkimme mm. molekyylireittejä, jotka aikaansaavat syöpäsolujen kohonneen sietokyvyn stressiä kohtaan, esimerkiksi kun syöpä muodostaa vastustuskyky lääkeaineille. Tutkimme myös syövän kasvutapoja kudoksessa ja yhdistämme tätä tietoa syöpäsolujen molekyylitietoihin ymmärtääksemme paremmin niitä mekanismeja, joiden avulla syöpäsolut selviävät monenlaisten stressien ristipaineessa. Kudosbiologian yhteistyöprojekteissamme etsimme parempia tapoja kuvantaa, visualisoida ja analysoida kvantitatiivisesti histologiaa digitaalisen patologian, koneoppimisen ja tekoälyn keinoin. Tutkimuksemme tähtää parempien diagnostisten työkalujen ja uusien syöpähoitojen kehittämiseen.
Ajankohtaista
-
Biolääketieteen opetuksessa testattiin virtuaalista syöpäkasvainta
Itä-Suomen yliopiston biolääketieteen yksikössä kokeiltiin äskettäin virtuaalitodellisuuden käyttöä kasvainten histologian opetukseen.… -
Tutkijoiden kehittämä tekoälymenetelmä korvaa kemiallisen kudosvärjäyksen
Itä-Suomen yliopiston, Turun yliopiston ja Tampereen yliopiston tutkijat kehittivät osana pohjoismaista ABCAP-konsortiota tekoälypohjaisen… -
Syöpäsäätiö myönsi apurahoja Itä-Suomen yliopistoon
Syöpäsäätiö on myöntänyt Itä-Suomen yliopistoon ja Kuopion yliopistolliseen sairaalaan kuusi uutta apurahaa syöpätutkimukseen, yhteensä 254… -
Eturauhassyövän ja Alzheimerin taudin mekanismit löytyvät soluista
Miksi eturauhassyöpä muuttuu vastustuskykyiseksi hoidolle, entä mitä vaikutuksia on suomalaisella Alzheimerin taudin riskigeenillä? Itä-Suomen…
Johtajat
Tutkijatohtorit
-
Enkhzaya Batnasan
TutkijatohtoriBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Annika Kohvakka
TutkijatohtoriBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Väitöskirjatutkijat
-
Sonja Koivukoski
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Minttu Kärkkäinen
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Hanqing Xia
ProjektitutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Erika Aikio
ProjektitutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Teknikot
Tukihenkilöstö
-
Melina Tulonen
HarjoittelijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Maria Haapakoski
HarjoittelijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Muut ryhmän jäsenet
-
Siiri Sirviö
-
Jenni Ruokolainen
-
Salla Takkinen
-
Kirsikka Wirtanen
-
Heshani Jayasuriya Arachchige Dona
-
Petra Taka-Eilola
-
Nathaniel Tetteh
Julkaisut
38 kappaletta-
A PEG-assisted membrane coating to prepare biomimetic mesoporous silicon for PET/CT imaging of triple-negative breast cancer
Wen, Huang; Martínez, María Gómez; Happonen, Emilia; Qian, Jing; Vallejo, Vanessa Gómez; Mendazona, Helena Jorge; Jokivarsi, Kimmo; Scaravilli, Mauro; Latonen, Leena; Llop, Jordi; Lehto, Vesa-Pekka; Xu, Wujun. 2024. International journal of pharmaceutics. 652: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Long noncoding RNA EPCART regulates translation through PI3K/AKT/mTOR pathway and PDCD4 in prostate cancer
Kohvakka, Annika; Sattari, Mina; Nättinen, Janika; Aapola, Ulla; Gregorová, Pavlína; Tammela, Teuvo LJ; Uusitalo, Hannu; Sarin, L Peter; Visakorpi, Tapio; Latonen, Leena. 2024. Cancer gene therapy. 31: 1536-1546 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Platinum-based drugs induce phenotypic alterations in nucleoli and Cajal bodies in prostate cancer cells
Batnasan, Enkhzaya; Kärkkäinen, Minttu; Koivukoski, Sonja; Sadeesh, Nithin; Tollis, Sylvain; Ruusuvuori, Pekka; Scaravilli, Mauro; Latonen, Leena. 2024. Cancer cell international. 24: . 29 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
RNA:han sitoutuvat proteiinit syövän lääkehoidossa ja -resistenssissä
Latonen, Leena. 2024. Duodecim. 140: 281-287 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer
Kiviaho, Antti; Eerola, Sini K.; Kallio, Heini M. L.; Andersen, Maria K.; Hoikka, Miina; Tiihonen, Aliisa M.; Salonen, Iida; Spotbeen, Xander; Giesen, Alexander; Parker, Charles T. A.; Taavitsainen, Sinja; Hantula, Olli; Marttinen, Mikael; Hermelo, Ismaïl; Ismail, Mazlina; Midtbust, Elise; Wess, Maximilian; Devlies, Wout; Sharma, Abhibhav; Krossa, Sebastian; Häkkinen, Tomi; Afyounian, Ebrahim; Vandereyken, Katy; Kint, Sam; Kesseli, Juha; Tolonen, Teemu; Tammela, Teuvo L. J.; Viset, Trond; Størke. 2024. Nature communications. 15: . 9949 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The ACROBAT 2022 Challenge: Automatic Registration Of Breast Cancer Tissue
Weitz, Philippe; Valkonen, Masi; Solorzano, Leslie; Carr, Circe; Kartasalo, Kimmo; Boissin, Constance; Koivukoski, Sonja; Kuusela, Aino; Rasic, Dusan; Feng, Yanbo; Pouplier, Sandra Sinius; Sharma, Abhinav; Eriksson, Kajsa Ledesma; Robertson, Stephanie; Marzahl, Christian; Gatenbee, Chandler D; Anderson, Alexander RA; Wodzinski, Marek; Jurgas, Artur; Marini, Niccolò; Atzori, Manfredo; Müller, Henning; Budelmann, Daniel; Weiss, Nick; Heldmann, Stefan; Lotz, Johannes; Wolterink, Jelmer M; De Santi,. 2024. Medical image analysis. 97: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Virtuaalimaailma histologian oppimisen tukena
Mairinoja, Laura; Liimatainen, Kaisa; Koivukoski, Sonja; Latonen, Leena; Strauss, Leena; Ruusuvuori, Pekka. 2024. Yliopistopedagogiikka. 31: . B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä -
Virtuaalivärjäys mahdollistaa ympäristöystävällisempää histologiaa kemikaaleja vähentämällä
Koivukoski, Sonja; Ruusuvuori, Pekka; Latonen, Leena. 2024. Duodecim. 140: 1071-1078 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Virtual staining for histology by deep learning
Latonen, Leena; Koivukoski, Sonja; Khan, Umair; Ruusuvuori, Pekka. 2024. Trends in biotechnology. 42: 1177-1191 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A Multi-Stain Breast Cancer Histological Whole-Slide-Image Data Set from Routine Diagnostics
Weitz, Philippe; Valkonen, Masi; Solorzano, Leslie; Carr, Circe; Kartasalo, Kimmo; Boissin, Constance; Koivukoski, Sonja; Kuusela, Aino; Rasic, Dusan; Feng, Yanbo; Sinius Pouplier, Sandra; Sharma, Abhinav; Ledesma Eriksson, Kajsa; Latonen, Leena; Laenkholm, Anne-Vibeke; Hartman, Johan; Ruusuvuori, Pekka; Rantalainen, Mattias. 2023. Scientific data. 10: . 562 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä