Molekyylimallinnuksen ja lääkeainesuunnittelun tutkimusryhmä
Tutkimusryhmä
01.01.2010 -
Farmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Johtajat
Yhteyshenkilöt
Molekyylimallinnus ja lääkeainesuunnittelu tutkimusryhmässämme etsitään uusia lääkeaineita, tutkitaan lääkeaineiden vuorovaikutuksia proteiinien kanssa ja rakennetaan kohdeproteiinimalleja. Lääkeaineen kohdeproteiinin rakennetta voidaan hyödyntää selvitettäessä siihen tunnetusti sitoutuvien lääke- tai muiden molekyylien välisiä vuorovaikutuksia sekä etsittäessä uusia lääkeaineita virtuaalisesti. Kohdeproteiinin rakenteesta voidaan yleensä tunnistaa lääkeaineen sitoutumispaikka. Telakointi eli kohdeproteiinin ja lääkeaineen rakenteiden toisiinsa sovittamisen avulla voidaan ennustaa miten hyvin erilaiset pienmolekyylit voisivat sitoutua ko. proteiinin sitoutumispaikkaan.
Projektit
Yhteistyö
-
Kuljetinproteiini-välitteinen lääkeaineiden kohdentaminen 01.09.2012 - -
Silmälääketutkimusryhmä 01.01.2010 - -
Ketola lab: Cancer Cell Plasticity
-
Kaarniranta AMD Lab 01.01.2004 - -
Pantsar dynamics 01.10.2022 - -
Mechanisms of cancer and metabolic disease (Levonen Lab) 01.01.2010 - -
GeneCellNano-lippulaiva 01.07.2020 - 31.12.2024 -
SimuRNA Lab 01.01.2023 -
Avainsanat
Johtajat
Professorit
Vanhemmat tutkijat
-
Tuomo Laitinen
ErikoistutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Maija Lahtela-Kakkonen
YliopistotutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Ina Pöhner
TutkijatohtoriFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Christopher Asquith
YliopistotutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Tutkijatohtorit
Väitöskirjatutkijat
-
Arun Tonduru
VäitöskirjatutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Katayun Bahrami
VäitöskirjatutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Renne Leini
VäitöskirjatutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Ville Kuorikoski
VäitöskirjatutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Milla Kurki
ApurahatutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Toni Sivula
ProjektitutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Teknikot
Yhteyshenkilöt
Julkaisut
5 kappaletta-
SARS-COV-2 Mpro conformational changes induced by covalently bound ligands
Ferreira, Glaucio Monteiro; Kronenberger, Thales; Tonduru, Arun Kumar; Hirata, Rosario Dominguez, Crespo; Hirata, Mario Hiroyuki; Poso, Antti. 2021. Journal of biomolecular structure and dynamics. Published online: 13 Sep 2021: 1 - 11 -
SARS-CoV-2--host proteome interactions for antiviral drug discovery
Liu, Xiaonan; Huuskonen, Sini; Laitinen, Tuomo; Redchuk, Taras; Bogacheva, Mariia; Salokas, Kari; Pöhner, Ina; Öhman, Tiina; Tonduru, Arun Kumar; Hassinen, Antti; Gawriyski, Lisa; Keskitalo, Salla; Vartiainen, Maria K.; Pietiäinen, Vilja; Poso, Antti; Varjosalo, Markku. 2021. Molecular systems biology. 17: e10396 -
Structure-Based Design of Selective Salt-Inducible Kinase Inhibitors
Tesch, R; Rak, M; Raab, M; Berger, LM; Kronenberger, T; Joerger, AC; Berger, BT; Abdi, I; Hanke, T; Poso, A; Strebhardt, K; Sanhaji, M; Knapp, S. 2021. Journal of medicinal chemistry. 64: 8142-8160 -
Targeting extracellular and juxtamembrane FGFR2 mutations in chemotherapy-refractory cholangiocarcinoma
Bitzer, Michael; Spahn, Stephan; Babaei, Sepideh; Horger, Marius; Singer, Stephan; Schulze-Osthoff, Klaus; Missios, Pavlos; Gatidis, Sergios; Nann, Dominik Mattern, Sven; Scheble, Veit; Nikolaou, Konstantin; Armeanu-Ebinger, Sorin; Schulze, Martin; Schroeder, Christopher; Biskup, Saskia; Beha, Janina; Claassen, Manfred; Ruhm, Kristina; Poso, Antti et al. 2021. npj precision oncology. 5: 80 -
The Future of Medicinal Chemistry, PROTAC, and Undruggable Drug Targets
Poso, Antti. 2021. Journal of medicinal chemistry. 64: 10680-10681