Prasanthi Medarametla
Akatemiatutkija
Farmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Prasanthi Medarametla on Akatemiatutkija Itä-Suomen yliopiston Farmasian laitoksella. Hän suoritti kandidaatin tutkinnon farmaseuttisissa tieteissä ja maisterin tutkinnon farmakoinformatiikassa NIPER‑instituutissa Intiassa. Tämän jälkeen hän työskenteli projektitutkijana sekä TATA–CSIR–OSDD‑stipendiaattina Indian Institute of Chemical Technology ‑tutkimuslaitoksessa Hyderabadissa.
Prasanthi toimi Marie Skłodowska‑Curie ‑varhaisvaiheen tutkijana EU‑MSCA ITN ‑projektissa INTEGRATE (Interdisciplinary Training Network for Validation of Gram‑Negative Antibacterial Targets). Hän valmistui tohtoriksi Itä‑Suomen yliopistosta Kuopiosta vuonna 2020, ja hänen väitöskirjansa keskittyi uusien antibakteeristen yhdisteiden laskennalliseen seulontaan osana INTEGRATE‑projektia.
Vuonna 2022 hän aloitti postdoc‑tutkijana Cambridgen yliopistossa Postdoc Pooli ‑rahoituksen (Jenny ja Antti Wihurin säätiö) tukemana, perehtyen kokeelliseen mikrobiologiaan ja rakennebiologian menetelmiin, kuten kryo‑EM:ään ja röntgenkristallografiaan. Myöhemmin hän palasi Itä‑Suomen yliopistoon ja työskenteli vanhempana tutkijana biofarmasian laitoksella, kunnes hänelle myönnettiin Akatemiatutkijan tehtävä vuonna 2025.
Tällä hetkellä hän johtaa AVID‑tutkimusryhmää (Anti‑Virulence Drug Discovery) Itä‑Suomen yliopistossa ja toimii myös NORDFORSK NORD‑AViD ‑konsortion vetäjänä.
Jos olet kiinnostunut pro gradu ‑projekteista tai suunnittelet väitöskirjan tekemistä, joka liittyy antibakteerisiin proteiinikohteisiin ja bakteerien virulenssin taustalla oleviin mekanismeihin, ota rohkeasti yhteyttä — keskustelen mielelläni mahdollisista tutkimusmahdollisuuksista.
Tutkimusryhmät
Julkaisut
11/11 kappaletta-
A Twist of Fate: The Helix–Turn–Helix Motif in Pseudomonas aeruginosa ExsA Can Allosterically Stabilize the Ligand-Binding Domain
Medarametla, Prasanthi; Greenhalgh, Jack Calum; Pöhner, Ina; Welch, Martin; Poso, Antti; Kronenberger, Thales; Rahman, Taufiq, 2025, Journal of chemical information and modeling, 65, 22, 12448-12463. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Look What You Made Me Do: Discerning Feature for Classification of Endocrine-Disrupting Chemical Binding to Steroid Hormone Receptors
Rashidian, Azam; Pitkänen, Sini; Maltarollo, Vinicius Goncalves; Schoppmeier, Ulrich; Shevchenko, Ekaterina; Medarametla, Prasanthi; Poso, Antti; Küblbeck, Jenni; Honkakoski, Paavo; Kronenberger, Thales, 2025, Journal of chemical information and modeling, 65, 8, 4148-4162. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Pseudomonas aeruginosa acyl-CoA dehydrogenases and structure-guided inversion of their substrate specificity
Wang, Meng; Medarametla, Prasanthi; Kronenberger, Thales; Deingruber, Tomas; Brear, Paul; Figueroa, Wendy; Ho, Pok-Man; Krueger, Thomas; Pearce, James C.; Poso, Antti; Wakefield, James G.; Spring, David R.; Welch, Martin, 2025, Nature communications, 16, 1, 2334. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Stoichiometric transport of estrone 3-sulfate among genetic variants of OATP1A2 and OATP2B1 and structural analysis by molecular dynamics simulation: Impairment of gating mechanism in the unstable inward-open conformation of OATP2B1 (Asp215Val) significantly suppress the transport activity
Akiyoshi, Takeshi; Tonduru, Arun Kumar; Kataoka, Hiroki; Morita, Tokio; Yajima, Kodai; Imaoka, Ayuko; Katayama, Kazuhiro; Medarametla, Prasanthi; Uchida, Yasuo; Poso, Antti; Ohtani, Hisakazu; Terasaki, Tetsuya, 2025, Drug metabolism and disposition, 53, 12, 100198. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Structural Characterization of LsrK as a Quorum Sensing Target and a Comparison between X-ray and Homology Models
Medarametla, Prasanthi; Kronenberger, Thales; Laitinen, Tuomo; Poso, Antti, 2021, Journal of chemical information and modeling, 61, 3, 1346-1353. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Identification and Design of New Antibacterial Agents Using Computational Approaches
Medarametla, Prasanthi, 2020, Publications of the University of Eastern Finland. Dissertations in Health Sciences. G4 Monografiaväitöskirja -
DPD-Inspired Discovery of Novel LsrK Kinase Inhibitors: An Opportunity To Fight Antimicrobial Resistance
Stotani, Silvia; Gatta, Viviana; Medarametla, Prasanthi; Padmanaban, Mohan; Karawajczyk, Anna; Giordanetto, Fabrizio; Tammela, Päivi; Laitinen, Tuomo; Poso, Antti; Tzalis, Dimitros; Collina, Simona, 2019, Journal of medicinal chemistry, 62, 5, 2720-2737. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Molecular Modelling Approaches to Antibacterial Drug Design and Discovery
Kaczor, Agnieszka A; Medarametla, Prasanthi; Bartuzi, Damian; Kondej, Magdalena; Matosiuk, Dariusz; Poso, Antti, 2018, Rahman, Atta-ur; Choudhary, Iqbal M, Frontiers in Anti-Infective Drug Discovery, 153-222. B2 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa -
Structure-based virtual screening of LsrK kinase inhibitors to target quorum sensing
Medarametla, Prasanthi; Gatta, Viviana; Kajander, Tommi; Laitinen, Tuomo; Tammela, Päivi; Poso Antti, 2018, Chemmedchem, 13, 22, 2400-2407. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A QSAR and molecular modelling study towards new lead finding: polypharmacological approach to Mycobacterium tuberculosis
Janardhan S, John L, Prasanthi M, Poroikov V, Narahari Sastry G, 2017, Sar and qsar in environmental research, 28, 10, 815-832. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

