Syövän stressivasteiden biologia
Tutkimusryhmä
01.01.2019 -
Biolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Terveystieteiden tiedekunta
Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Johtajat
Selvitämme niitä molekyyli-, solu- ja kudostason mekanismeja, jotka aikaansaavat syöpäsolujen kohonneen sietokyvyn stressiä kohtaan. Tutkimme mm. molekyylireittejä, jotka johtavat syöpä- ja hermosolujen erilaistiin kykyihin käsitellä proteiini- ja RNA-kertymiä, sekä syövän kykyä muodostaa vastustuskyky lääkeaineille. Tutkimme myös syövän kasvutapoja kudoksessa ja yhdistämme tätä tietoa syöpäsolujen molekyylitietoihin ymmärtääksemme paremmin niitä mekanismeja, joiden avulla syöpäsolut selviävät monenlaisten stressien ristipaineessa. Kudosbiologian yhteistyöprojekteissamme etsimme parempia tapoja kuvantaa, visualisoida ja analysoida kvantitatiivisesti histologiaa digitaalisen patologian, koneoppimisen ja tekoälyn keinoin. Tutkimuksemme tähtää parempien diagnostisten työkalujen ja uusien syöpähoitojen kehittämiseen.
Johtajat
Tutkijatohtorit
-
Mauro Scaravilli
Vieraileva tutkijaLääketieteen laitos, Biolääketiede -
Enkhzaya Batnasan
TutkijatohtoriLääketieteen laitos, Biolääketiede
Väitöskirjatutkijat
-
Sonja Koivukoski
VäitöskirjatutkijaLääketieteen laitos, Biolääketiede -
Nithin Sadeesh
ProjektitutkijaLääketieteen laitos, Biolääketiede
Teknikot
Muut ryhmän jäsenet
-
Nikolas Nurmesviita
-
Miia Romo
-
Elina Kallio
-
Siiri Sirviö
-
Jenni Ruokolainen
Julkaisut
22 kappaletta-
Unstained Tissue Imaging and Virtual Hematoxylin and Eosin Staining of Histologic Whole Slide Images
Koivukoski, Sonja; Khan, Umair; Ruusuvuori, Pekka; Latonen, Leena. 2023. Laboratory investigation. 103: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chemical Interrogation of Nuclear Size Identifies Compounds with Cancer Cell Line-Specific Effects on Migration and Invasion
Tollis, Sylvain; Rizzotto, Andrea; Pham, Nhan T; Koivukoski, Sonja; Sivakumar, Aishwarya; Shave, Steven; Wildenhain, Jan; Zuleger, Nikolaj; Keys, Jeremy T; Culley, Jayne; Zheng, Yijing; Lammerding, Jan; Carragher, Neil O; Brunton, Valerie G; Latonen, Leena; Auer, Manfred; Tyers, Mike; Schirmer, Eric C. 2022. Acs chemical biology. 17: 680-700 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Nonmalignant AR-positive prostate epithelial cells and cancer cells respond differently to androgen
Kukkonen, Konsta; Autio-Kimura, Bryn; Rauhala, Hanna; Kesseli, Juha; Nykter, Matti; Latonen, Leena; Visakorpi, Tapio. 2022. Endocrine-related cancer. 29: 717–733 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Nuclear Organization in Response to Stress: A Special Focus on Nucleoli
Batnasan, Enkhzaya; Koivukoski, Sonja; Kärkkäinen, Minttu; Latonen, Leena. Teoksessa: Kloc, Malgorzat ; Kubiak, Jacek Z, 2022. Nuclear, Chromosomal, and Genomic Architecture in Biology and Medicine. s. 469-494. Springer A3 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa -
Nuclear size rectification: A potential new therapeutic approach to reduce metastasis in cancer
Schirmer, Eric C; Latonen, Leena; Tollis, Sylvain. 2022. Frontiers in cell and developmental biology. 10: A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Spatial analysis of histology in 3D: quantification and visualization of organ and tumor level tissue environment
Ruusuvuori, Pekka; Valkonen, Masi; Kartasalo, Kimmo; Valkonen, Mira; Visakorpi, Tapio; Nykter, Matti; Latonen, Leena. 2022. Heliyon. 8: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
miR-32 promotes MYC-driven prostate cancer
Scaravilli, Mauro; Koivukoski, Sonja; Gillen, Andrew; Bouazza, Aya; Ruusuvuori, Pekka; Visakorpi, Tapio; Latonen, Leena. 2022. Oncogenesis. 11: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A systematic comparison of data- and knowledge-driven approaches to disease subtype discovery
Rintala, TJ; Federico, A; Latonen, L; Greco, D; Fortino, V. 2021. Briefings in bioinformatics. 22: bbab314 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Androgen-Driven Fusion Genes and Chimeric Transcripts in Prostate Cancer
Scaravilli, Mauro; Koivukoski, Sonja; Latonen, Leena. 2021. Frontiers in cell and developmental biology. 9: 623809 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Building a central repository landmarks a new era for artificial intelligence - assisted digital pathology development in Europe
Latonen, Leena; Ruusuvuori, Pekka. 2021. European journal of cancer. 150: 31-32 B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä