Ali Abdollahzadeh - UEFConnect

Tarkenna hakuasi

Tiedot Julkaisut

Tutkimusryhmät

Avainsanat

biophysics brain image analysis brain microstructure computer vision diffusion MRI electron microscopy

Julkaisut

18/18 kappaletta

Dependence of the Extra‐Cellular Diffusion Coefficient on the Fractions of Neurites and Cell Bodies in Gray Matter
Lee, Hong‐Hsi; Abdollahzadeh, Ali; Lee, Hansol; Coronado‐Leija, Ricardo; Fieremans, Els; Huang, Susie Y; Novikov, Dmitry S, 2026, Magnetic resonance in medicine, 1-14. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Indirect crosstalk between signalling pathways activated by CGRP and Piezo1 in human iPSC-derived endothelial cells relevant to migraine
Gkouzioti, Vasiliki; Abdollahzadeh, Ali; van den Hil, Francijna; Orlova, Valeria; Giniatullin, Rashid; van den Maagdenberg, Arn MJM; Frimat, Jean Philippe, 2025, Cephalalgia, 45, 12, 1-13. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Scattering approach to diffusion quantifies axonal damage in brain injury
Abdollahzadeh, Ali; Coronado-Leija, Ricardo; Lee, Hong-Hsi; Sierra, Alejandra; Fieremans, Els; Novikov, Dmitry S, 2025, Nature communications, 16, 1, 9808. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Editorial: Deep learning and neuroimage processing in understanding neurological diseases
Carvalho, Joana; Abdollahzadeh, Ali; Ferrari, Ricardo José, 2024, Frontiers in computational neuroscience, 18, 1523973. B1 Kirjoitus tieteellisessä aikakauslehdessä
Node of Ranvier remodeling in chronic psychosocial stress and anxiety
Koskinen, Maija-Kreetta; Laine, Mikaela; Abdollahzadeh, Ali; Gigliotta, Adrien; Mazzini, Giulia; Journée, Sarah; Alenius, Varpu; Trontti, Kalevi; Tohka, Jussi; Hyytiä, Petri; Sierra, Alejandra; Hovatta, Iiris, 2023, Neuropsychopharmacology, 48, 10, 1532-1540. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
SproutAngio: an open-source bioimage informatics tool for quantitative analysis of sprouting angiogenesis and lumen space
Beter, M; Abdollahzadeh, A; Pulkkinen, HH; Huang, H; Orsenigo, F; Magnusson, PU; Ylä-Herttuala, S; Tohka, J; Laakkonen, JP, 2023, Scientific reports, 13, 1, 7279. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
The role of the meningeal lymphatic system in local meningeal inflammation and trigeminal nociception
Mikhailov, Nikita; Virenque, Anaïs; Koroleva, Kseniia; Eme-Scolan, Elisa; Teleman, Matei; Abdollahzadeh, Ali; Giniatullina, Raisa; Gafurov, Oleg; Krivoshein, Georgii; Malm, Tarja; Hämäläinen, Riikka H; Sierra, Alejandra; Tohka, Jussi; Rua, Rejane; Noe, Francesco M; Giniatullin, Rashid, 2022, Scientific reports, 12, 1, 8804. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
gACSON software for automated segmentation and morphology analyses of myelinated axons in 3D electron microscopy
Behanova, Andrea; Abdollahzadeh, Ali; Belevich, Ilya; Jokitalo, Eija; Sierra, Alejandra; Tohka, Jussi, 2022, Computer methods and programs in biomedicine, 220, 106802. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Automated 3D segmentation and morphometry of white matter ultrastructures
Abdollahzadeh, Ali, 2021, Publications of the University of Eastern Finland. Dissertations in Health Sciences. G5 Artikkeliväitöskirja
Cylindrical Shape Decomposition for 3D Segmentation of Tubular Objects
Abdollahzadeh, Ali; Sierra, Alejandra; Tohka, Jussi, 2021, IEEE access, 9, 23979-23995. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
DeepACSON automated segmentation of white matter in 3D electron microscopy
Abdollahzadeh, Ali; Belevich, Ilya; Jokitalo, Eija; Sierra, Alejandra; Tohka, Jussi, 2021, Communications biology, 4, 1, 179. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Steerable3D: An ImageJ plugin for neurovascular enhancement in 3-D segmentation
Miocchi, Paolo; Sierra, Alejandra; Maugeri, Laura; Stefanutti, Eleonora; Abdollahzadeh, Ali; Mangini, Fabio; Moraschi, Marta; Bukreeva, Inna; Massimi, Lorenzo; Brun, Francesco; Tohka, Jussi; Gröhn, Olli; Mittone, Alberto; Bravin, Alberto; Nicaise, Charles; Giove, Federico; Cedola, Alessia; Fratini, Michela, 2021, Physica medica, 81, 197-209. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Transfer Learning in Magnetic Resonance Brain Imaging: A Systematic Review
Valverde, Juan Miguel; Imani, Vandad; Abdollahzadeh, Ali; De Feo, Riccardo; Prakash, Mithilesh; Ciszek, Robert; Tohka, Jussi, 2021, Journal of imaging, 7, 4, 66. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
BV-2 Microglial Cells Overexpressing C9orf72 Hexanucleotide Repeat Expansion Produce DPR Proteins and Show Normal Functionality but No RNA Foci
Rostalski, Hannah; Hietanen, Tomi; Leskelä, Stina; Behánová, Andrea; Abdollahzadeh, Ali; Wittrahm, Rebekka; Mäkinen, Petra; Huber, Nadine; Hoffmann, Dorit; Solje, Eino; Remes, Anne M; Natunen, Teemu; Takalo, Mari; Tohka, Jussi; Hiltunen, Mikko; Haapasalo, Annakaisa, 2020, Frontiers in neurology, 11, 550140. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
In vivo diffusion tensor imaging in acute and subacute phases of mild traumatic brain injury in rats
San Martín Molina, Isabel; Salo, Raimo A; Abdollahzadeh, Ali; Tohka, Jussi; Gröhn, Olli; Sierra, Alejandra, 2020, eNeuro, 7, 3, ENEURO.0476-19.2020. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Multiscale Imaging Approach for Studying the Central Nervous System: Methodology and Perspective
Fratini, Michela; Abdollahzadeh, Ali; DiNuzzo, Mauro; Salo, Raimo; Maugeri, Laura; Cedola, Alessia; Giove, Federico; Gröhn, Olli; Tohka, Jussi; Sierra, Alejandra, 2020, Frontiers in neuroscience, 14, 72. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Automated 3D Axonal Morphometry of White Matter
Abdollahzadeh, A; Belevich, I; Jokitalo, E; Tohka, J; Sierra, A, 2019, Scientific reports, 9, 1, 6084. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä
Local Adaptive Wiener Filtering for Class Averaging in Single Particle Reconstruction
Abdollahzadeh Ali, Acar Erman, Peltonen Sari, Ruotsalainen Ulla, 2017, Sharma Puneet, Bianchi Filippo Maria, Image Analysis 20th Scandinavian Conference, SCIA 2017, Tromsø, Norway, June 12-14, 2017, Proceedings, Part II, 233-244, Scandinavian Conference on Image Analysis. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa