VILLE PAAKINAHO
Tutkijatohtori
Suomen Akatemian tutkijatohtori
Tutkimukseni keskittyy selvittämään kuinka steroidireseptorit säätelevät transkriptiota sekä normaaleissa että tautitiloissa. Erityinen mielenkiinnon kohteeni steroidireseptoreista on glukokortikoidireseptori (GR). Käytän sekä koko genominlaajuisia syväsekvensointi- (esim. ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq, GRO-seq) että yksittäisten molekyylien kuvantamistekniikoita. Tarkoituksenani on selvittää 1) kuinka post-translationaaliset modifikaatiot sekä reseptorin oligomerisaatio vaikuttaa GR:n transkriptionaaliseen aktiivisuuteen, 2) mekanismit, joiden kautta GR ja muut transkriptiotekijät ja koregulaattorit vuorovaikuttavat keskenään muuttaen transkriptiota sekä tautien edistymistä, 3) miten reseptori avaa suljettuja kromatiinialueita yhdessä kromatiiniamuokkaavien kompleksien (esim. SWI/SNF) kanssa.
Yhteystiedot
Huoneen tiedot
Kuopio Snellmania 3176
Organisaatio
Lääketieteen laitos, Biolääketiede