Johtajat
Levonen Lab jakautuu kahteen päätutkimusaiheeseen: syöpään ja metabolisiin sairauksiin.
Syöpätutkimuksemme kohdentuu Nrf2 transkriptiotekijän kaksijakoiseen rooliin syövässä, keskittyen erityisesti keuhkosyöpätutkimukseen. Lisäksi tutkimme Nrf2:n roolia metabolian säätelijänä. Professori Anna-Liisa Levonen on Euroopan Unionin rahoittaman hankkeen, EDCMET:n, koordinaattori. Hankkeessa tutkimme ympäristöaltisteiden aiheuttamia metabolisia haittoja ja kehitämme menetelmiä näiden haittojen tutkimiseen.
Ajankohtaista
-
Julkaisu
Tuore artikkelimme Redox Biology lehdessä: Oncogenic KEAP1 mutations activate TRAF2-NFκB signaling to prevent apoptosis in lung cancer cells -
Julkaisu
Tuore julkaisumme Current Opinion in Chemical Biology lehdessä: Electrophilic metabolites targeting the KEAP1/NRF2 partnership -
Julkaisu
Tuore artikkelimme Archives of Toxicology lehdessä: Metabolic effects of nuclear receptor activation in vivo after 28‑day oral exposure to three… -
Levonen Lab osana uutta EU rahoitteista hanketta
Itä-Suomen yliopiston koordinoima kansainvälinen NEMESIS-tutkimushanke on saanut 8 miljoonan euron rahoituksen EU:n Horisontti Eurooppa -ohjelmasta.…
Projektit
-
Redox signalointi
Reaktiivisilla happi- ja typpiradikaaleilla (ROS ja RNS), sekä niiden reaktioissa solujen makromolekyylien kanssa syntyvillä tuotteilla on merkittävä rooli syövän ja kardiometabolisten sairauksien kehittymisessä. Solut ovat kehittäneet monimutkaisia mekanismeja, joilla ne reagoivat happi- ja typpiradikaaleihin, mikä tasapainottaa niiden vaikutuksia soluissa ja kudoksissa. Suojavaikutukset välittyvät transkriptionaalisten vasteiden myötä, solujen homeostaasin palauttamiseksi. Soluissa transkriptiotekijä Nrf2, joka säätelee lukuisten suojaavien geenien ilmentymistä, on avainroolissa suojautumisessa ROS ja RNS vastaan.
Perinteisesti Nrf2:ta on pidetty hyödyllisenä ja suojaavana tekijänä monilta sairauksilta, mikä on edistänyt Nrf2:ta aktivoivien lääkkeiden kehittämistä muun muassa neurodegeneratiivisten sairauksien hoitoon, sekä syövän kemopreventioon. Nrf2-tasot ovat kuitenkin usein kohonneet syövässä, mikä lisää solujen eloonjäämistä ja aiheuttaa resistenssiä kemoterapialle. Nrf2:n rooli sydän- ja verisuonisairauksissa on myös kiistanalainen, sillä Nrf2:lla on osoitettu olevan suojaavia vaikutuksia verisuonistoon, mutta epäsuotuisia vaikutuksia metaboliaan.
Tutkimusaiheet liittyen Nrf2-tutkimukseen
- Syöpä:
- Nrf2:n kaksijakoinen rooli syövässä, keskittyen erityisesti keuhkosyöpään
- Nrf2:n roolin tunnistaminen endoteelisoluissa
- Metabolia:
- Nrf2:n rooli metabolian säätelyssä
- Nrf2:n rooli metabolisessa oireyhtymässä ja ei-alkoholiperäisissä rasvamaksasairauksissa
Tutkimusmenetelmät
Nykyaikaiset biokemialliset, sekä molekyyli- ja solubiologiset tekniikat, mukaan lukien Uuden sukupolven sekvenssointi (NGS-menetelmä), kloonaus ja vektorikehitys, RNA-interferenssitekniikat, microRNA-tekniikat, MS-proteomiikka, Agilent Seahorse XFCell Mito Stress testaus, in vivo hiirimallit, kuvantamistekniikat (MRI ja ultraääni), primaarisolujen eristäminen, sekä histopatologia.
- Syöpä:
-
Metabolisiin sairauksiin kuuluu joukko sairauksia, jotka häiritsevät ihmiskehon normaalia aineenvaihduntaa. Näihin lukeutuvat lihavuus, tyypin 2 diabetes, sydän- ja verisuonitaudit, sekä rasvamaksa. Metabolisiset sairaudet ovat merkittävä globaali haaste, joiden esiintyvyys on lisääntynyt maailmanlaajuisesti.
Levonen Lab -tutkimusryhmässä pyrimme ymmärtämään metabolisten sairauksien kehittymisen ja etenemisen taustalla olevia mekanismeja, sekä selvittämään normaalia metaboliaa häiritsevien ympäristöaltisteiden vaikutuksia terveyteemme.
EDCMET (Horisontti 2020)
Metabolic effects of Endocrine Disrupting Chemicals: novel testing METhods and adverse outcome pathways (EDCMET), on Euroopan Unionin (Horisontti 2020) rahoittama hanke, jota koordinoi Professori Anna-Liisa Levonen.
EDCMET tuo yhteen eri tutkimusalojen asiantuntijoita, mukaan lukien toksikologeja ja biologeja, jotka omaavat perusteellisen ymmärryksen aineenvaihduntasairauksien molekyylimekanismeista, sekä kattavat in vitro– ja in vivo-metodologiset taidot, ja lisäksi epidemiologeja, jotka kykenevät yhdistämään ympäristöaltistukset haitallisiin metabolisiin muutoksiin. Yhdessä pyrimme kehittämään uusia validoituja testimenetelmiä ja -malleja ympäristöaltisteiden aiheuttamien metabolisten haittojen arvioimiseksi, sekä näiden haittojen molekyylitason alkutapahtumien tunnistamiseksi.
Levonen Lab tutkijat työskentelevät hankkeen erittäin mielenkiintoisella osa-alueella, kehittäen in vitro– ja in vivo-testimenetelmiä ympäristöaltisteiden metabolisten haittojen tunnitamiseen.
Voit löytää lisää tietoa hankkeesta EDCMET verkkosivuilta ja UEF Connect-sivuilta (EDCMET).
Avainsanat
Johtajat
Vanhemmat tutkijat
Tutkijatohtorit
-
Ashik Jawahar Deen
ProjektitutkijaFarmasian laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Henriikka Hakomäki
TutkijatohtoriA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta
Väitöskirjatutkijat
-
Sini Pitkänen
VäitöskirjatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Simone Adinolfi
ProjektitutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Tommi Patinen
VäitöskirjatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Akshatha Kalavathi Shivakumar
VäitöskirjatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Jouni Härkönen
Teknikot
Opiskelijat
Julkaisut
126 kappaletta-
Electrophilic metabolites targeting the KEAP1/NRF2 partnership
Dinkova-Kostova, Albena T; Hakomäki, Henriikka; Levonen, Anna-Liisa. 2024. Current opinion in chemical biology. 78: A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Metabolic effects of nuclear receptor activation in vivo after 28-day oral exposure to three endocrine-disrupting chemicals
Attema, Brecht; Kummu, Outi; Pitkänen, Sini; Weisell, Jonna; Vuorio, Taina; Pennanen, Erika; Vorimo, Maria; Rysä, Jaana; Kersten, Sander; Levonen, Anna-Liisa; Hakkola, Jukka. 2024. Archives of toxicology. 98: 911-928 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Oncogenic KEAP1 mutations activate TRAF2-NFκB signaling to prevent apoptosis in lung cancer cells
Deen, Ashik Jawahar; Adinolfi, Simone; Härkönen, Jouni; Patinen, Tommi; Liu, Xiaonan; Laitinen, Tuomo; Takabe, Piia; Kainulainen, Kirsi; Pasonen-Seppänen, Sanna; Gawriyski, Lisa M; Arasu, Uma Thanigai; Selvarajan, Ilakya; Mäkinen, Petri; Laitinen, Hanna; Kansanen, Emilia; Kaikkonen, Minna U; Poso, Antti; Varjosalo, Markku; Levonen, Anna-Liisa. 2024. Redox biology. 69: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
Elomaa, Hanna; Härkönen, Jouni; Väyrynen, Sara A; Ahtiainen, Maarit; Ogino, Shuji; Nowak, Jonathan A; Lau, Mai Chan; Helminen, Olli; Wirta, Erkki Ville; Seppälä, Toni T; Böhm, Jan; Mecklin, Jukka Pekka; Kuopio, Teijo; Väyrynen, Juha P. 2024. Modern pathology. 37: . 100450 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A pan-cancer analysis shows immunoevasive characteristics in NRF2 hyperactive squamous malignancies
Härkönen, Jouni; Pölönen, Petri; Deen, Ashik Jawahar; Selvarajan, Ilakya; Teppo, Hanna-Riikka; Dimova, Elitsa Y.; Kietzmann, Thomas; Ahtiainen, Maarit; Väyrynen, Juha P.; Väyrynen, Sara A.; Elomaa, Hanna; Tynkkynen, Niko; Eklund, Tiia; Kuopio, Teijo; Talvitie, Eva-Maria; Taimen, Pekka; Kallajoki, Markku; Kaikkonen, Minna U.; Heinäniemi, Merja; Levonen, Anna-Liisa. 2023. Redox biology. 61: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genetic variation is a key determinant of chromatin accessibility and drives differences in the regulatory landscape of C57BL/6J and 129S1/SvImJ mice
Mononen, Juho; Taipale, Mari; Malinen, Marjo; Velidendla, Bharadwaja; Niskanen, Einari; Levonen, Anna-Liisa; Ruotsalainen, Anna-Kaisa; Heikkinen, Sami. 2023. Nucleic acids research. 2024; 52: 2904-2923 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
PI3Kβ inhibition enhances ALK ‐inhibitor sensitivity in ALK‐rearranged lung cancer
Talwelkar, Sarang S; Mäyränpää, Mikko I; Schüler, Julia; Linnavirta, Nora; Hemmes, Annabrita; Adinolfi, Simone; Kankainen, Matti; Sommergruber, Wolfgang; Levonen, Anna‐Liisa; Räsänen, Jari; Knuuttila, Aija; Verschuren, Emmy W.; Wennerberg, Krister. 2023. Molecular oncology. 17: 747-764 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Single-cell functional genomics reveals determinants of sensitivity and resistance to natural killer cells in blood cancers
Dufva, Olli; Gandolfi, Sara; Huuhtanen, Jani; Dashevsky, Olga; Duàn, Hanna; Saeed, Khalid; Klievink, Jay; Nygren, Petra; Bouhlal, Jonas; Lahtela, Jenni; Näätänen, Anna; Ghimire, Bishwa R.; Hannunen, Tiina; Ellonen, Pekka; Lähteenmäki, Hanna; Rumm, Pauliina; Theodoropoulos, Jason; Laajala, Essi; Härkönen, Jouni; Pölönen, Petri; Heinäniemi, Merja; Hollmén, Maija; Yamano, Shizuka; Shirasaki, Ryosuke; Barbie, David A.; Roth, Jennifer A.; Romee, Rizwan; Sheffer, Michal; Lähdesmäki, Harri; Lee, Dean A. 2023. Immunity. 56: 2816-2835.e13 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The KEAP1-NRF2 pathway: Targets for therapy and role in cancer
Adinolfi, Simone; Patinen, Tommi; Jawahar Deen, Ashik; Pitkänen, Sini; Härkönen, Jouni; Kansanen, Emilia; Küblbeck, Jenni; Levonen, Anna-Liisa. 2023. Redox biology. 63: A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A novel uterine leiomyoma subtype exhibits NRF2 activation and mutations in genes associated with neddylation of the Cullin 3-RING E3 ligase
Mehine, Miika; Ahvenainen, Terhi; Khamaiseh, Sara; Härkönen, Jouni; Reinikka, Siiri; Heikkinen, Tuomas; Äyräväinen, Anna; Pakarinen, Päivi; Härkki, Päivi; Pasanen, Annukka; Levonen, Anna-Liisa; Bützow, Ralf; Vahteristo, Pia. 2022. Oncogenesis. 11: . 52 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä