
Johtajat
Levonen Lab jakautuu kahteen päätutkimusaiheeseen: syöpään ja metabolisiin sairauksiin.
Syöpätutkimuksemme kohdentuu NRF2 transkriptiotekijän kaksijakoiseen rooliin syövässä, keskittyen erityisesti keuhkosyöpätutkimukseen. Lisäksi tutkimme metabolisia sairauksia, NRF2:n roolia aineenvaihdunnan säätelijänä ja ympäristöaltisteiden aiheuttamia haittavaikutuksia ihmisessä.
Ajankohtaista
-
Levonen Lab on LinkedIn:ssä!
-
Uusi julkaisu!
Käy lukemassa uusin artikkelimme Redox Biology lehdessä!
Projektit
-
Redox signalointi
Reaktiivisilla happi- ja typpiradikaaleilla (ROS ja RNS), sekä niiden reaktioissa solujen makromolekyylien kanssa syntyvillä tuotteilla on merkittävä rooli syövän ja kardiometabolisten sairauksien kehittymisessä. Solut ovat kehittäneet monimutkaisia mekanismeja, joilla ne reagoivat happi- ja typpiradikaaleihin, mikä tasapainottaa niiden vaikutuksia soluissa ja kudoksissa. Suojavaikutukset välittyvät transkriptionaalisten vasteiden myötä, solujen homeostaasin palauttamiseksi. Soluissa transkriptiotekijä NRF2, joka säätelee lukuisten suojaavien geenien ilmentymistä, on avainroolissa suojautumisessa ROS ja RNS vastaan.
Perinteisesti NRF2:ta on pidetty hyödyllisenä ja suojaavana tekijänä monilta sairauksilta, mikä on edistänyt NRF2:ta aktivoivien lääkkeiden kehittämistä muun muassa neurodegeneratiivisten sairauksien hoitoon, sekä syövän kemopreventioon. NRF2-tasot ovat kuitenkin usein kohonneet syövässä, mikä lisää solujen eloonjäämistä ja aiheuttaa resistenssiä kemoterapialle. NRF2:n rooli sydän- ja verisuonisairauksissa on myös kiistanalainen, sillä NRF2:lla on osoitettu olevan suojaavia vaikutuksia verisuonistoon, mutta epäsuotuisia vaikutuksia metaboliaan.
Tutkimusaiheet liittyen NRF2-tutkimukseen
- Syöpä:
- NRF2:n kaksijakoinen rooli syövässä, keskittyen erityisesti keuhkosyöpään
- NRF2:n roolin tunnistaminen endoteelisoluissa
- Metabolia:
- NRF2:n rooli metabolian säätelyssä
- NRF2:n rooli metabolisessa oireyhtymässä ja ei-alkoholiperäisissä rasvamaksasairauksissa
Tutkimusmenetelmät
Nykyaikaiset biokemialliset, sekä molekyyli- ja solubiologiset tekniikat, mukaan lukien uuden sukupolven sekvensointi (NGS), kloonaus ja vektorikehitys, RNA-interferenssitekniikat, microRNA-tekniikat, MS-proteomiikka, Seahorse-teknologia, in vivo hiirimallit, kuvantamistekniikat (MRI ja ultraääni), primaarisolujen eristäminen, sekä histopatologia.
- Syöpä:
-
Metabolisiin sairauksiin kuuluu joukko sairauksia, jotka häiritsevät ihmiskehon normaalia aineenvaihduntaa. Näihin lukeutuvat lihavuus, tyypin 2 diabetes, sydän- ja verisuonitaudit, sekä rasvamaksa. Metabolisiset sairaudet ovat merkittävä globaali haaste, joiden esiintyvyys on lisääntynyt maailmanlaajuisesti.
Levonen Lab -tutkimusryhmässä pyrimme ymmärtämään metabolisten sairauksien kehittymisen ja etenemisen taustalla olevia mekanismeja, sekä selvittämään normaalia metaboliaa häiritsevien ympäristöaltisteiden vaikutuksia terveyteemme.
Avainsanat
Johtajat
Vanhemmat tutkijat
Tutkijatohtorit
-
Henriikka Hakomäki
TutkijatohtoriA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Ponnuswamy Mohanasundaram
ApurahatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta
Väitöskirjatutkijat
-
Sini Pitkänen
VäitöskirjatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Simone Adinolfi
ProjektitutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Tommi Patinen
VäitöskirjatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Akshatha Kalavathi Shivakumar
VäitöskirjatutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta -
Jouni Härkönen
-
Sreejita Das
ProjektitutkijaA.I. Virtanen -instituutti, Terveystieteiden tiedekunta
Teknikot
Opiskelijat
Julkaisut
44 kappaletta-
Electrophilic metabolites targeting the KEAP1/NRF2 partnership
Dinkova-Kostova, Albena T; Hakomäki, Henriikka; Levonen, Anna-Liisa. 2024. Current opinion in chemical biology. 78: A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Metabolic effects of nuclear receptor activation in vivo after 28-day oral exposure to three endocrine-disrupting chemicals
Attema, Brecht; Kummu, Outi; Pitkänen, Sini; Weisell, Jonna; Vuorio, Taina; Pennanen, Erika; Vorimo, Maria; Rysä, Jaana; Kersten, Sander; Levonen, Anna-Liisa; Hakkola, Jukka. 2024. Archives of toxicology. 98: 911-928 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Oncogenic KEAP1 mutations activate TRAF2-NFκB signaling to prevent apoptosis in lung cancer cells
Deen, Ashik Jawahar; Adinolfi, Simone; Härkönen, Jouni; Patinen, Tommi; Liu, Xiaonan; Laitinen, Tuomo; Takabe, Piia; Kainulainen, Kirsi; Pasonen-Seppänen, Sanna; Gawriyski, Lisa M; Arasu, Uma Thanigai; Selvarajan, Ilakya; Mäkinen, Petri; Laitinen, Hanna; Kansanen, Emilia; Kaikkonen, Minna U; Poso, Antti; Varjosalo, Markku; Levonen, Anna-Liisa. 2024. Redox biology. 69: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
Elomaa, Hanna; Härkönen, Jouni; Väyrynen, Sara A; Ahtiainen, Maarit; Ogino, Shuji; Nowak, Jonathan A; Lau, Mai Chan; Helminen, Olli; Wirta, Erkki Ville; Seppälä, Toni T; Böhm, Jan; Mecklin, Jukka Pekka; Kuopio, Teijo; Väyrynen, Juha P. 2024. Modern pathology. 37: . 100450 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A pan-cancer analysis shows immunoevasive characteristics in NRF2 hyperactive squamous malignancies
Härkönen, Jouni; Pölönen, Petri; Deen, Ashik Jawahar; Selvarajan, Ilakya; Teppo, Hanna-Riikka; Dimova, Elitsa Y.; Kietzmann, Thomas; Ahtiainen, Maarit; Väyrynen, Juha P.; Väyrynen, Sara A.; Elomaa, Hanna; Tynkkynen, Niko; Eklund, Tiia; Kuopio, Teijo; Talvitie, Eva-Maria; Taimen, Pekka; Kallajoki, Markku; Kaikkonen, Minna U.; Heinäniemi, Merja; Levonen, Anna-Liisa. 2023. Redox biology. 61: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genetic variation is a key determinant of chromatin accessibility and drives differences in the regulatory landscape of C57BL/6J and 129S1/SvImJ mice
Mononen, Juho; Taipale, Mari; Malinen, Marjo; Velidendla, Bharadwaja; Niskanen, Einari; Levonen, Anna-Liisa; Ruotsalainen, Anna-Kaisa; Heikkinen, Sami. 2023. Nucleic acids research. 2024; 52: 2904-2923 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
PI3Kβ inhibition enhances ALK ‐inhibitor sensitivity in ALK‐rearranged lung cancer
Talwelkar, Sarang S; Mäyränpää, Mikko I; Schüler, Julia; Linnavirta, Nora; Hemmes, Annabrita; Adinolfi, Simone; Kankainen, Matti; Sommergruber, Wolfgang; Levonen, Anna‐Liisa; Räsänen, Jari; Knuuttila, Aija; Verschuren, Emmy W.; Wennerberg, Krister. 2023. Molecular oncology. 17: 747-764 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Single-cell functional genomics reveals determinants of sensitivity and resistance to natural killer cells in blood cancers
Dufva, Olli; Gandolfi, Sara; Huuhtanen, Jani; Dashevsky, Olga; Duàn, Hanna; Saeed, Khalid; Klievink, Jay; Nygren, Petra; Bouhlal, Jonas; Lahtela, Jenni; Näätänen, Anna; Ghimire, Bishwa R.; Hannunen, Tiina; Ellonen, Pekka; Lähteenmäki, Hanna; Rumm, Pauliina; Theodoropoulos, Jason; Laajala, Essi; Härkönen, Jouni; Pölönen, Petri; Heinäniemi, Merja; Hollmén, Maija; Yamano, Shizuka; Shirasaki, Ryosuke; Barbie, David A.; Roth, Jennifer A.; Romee, Rizwan; Sheffer, Michal; Lähdesmäki, Harri; Lee, Dean A. 2023. Immunity. 56: 2816-2835.e13 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
The KEAP1-NRF2 pathway: Targets for therapy and role in cancer
Adinolfi, Simone; Patinen, Tommi; Jawahar Deen, Ashik; Pitkänen, Sini; Härkönen, Jouni; Kansanen, Emilia; Küblbeck, Jenni; Levonen, Anna-Liisa. 2023. Redox biology. 63: A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A novel uterine leiomyoma subtype exhibits NRF2 activation and mutations in genes associated with neddylation of the Cullin 3-RING E3 ligase
Mehine, Miika; Ahvenainen, Terhi; Khamaiseh, Sara; Härkönen, Jouni; Reinikka, Siiri; Heikkinen, Tuomas; Äyräväinen, Anna; Pakarinen, Päivi; Härkki, Päivi; Pasanen, Annukka; Levonen, Anna-Liisa; Bützow, Ralf; Vahteristo, Pia. 2022. Oncogenesis. 11: . 52 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä