Ville Paakinaho
Akatemiatutkija
Akatemiatutkija, apulaisprofessori (tenure track); Filosofian tohtori (FT), Dosentti
Biolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
[email protected] | 050 512 8721
Toimin akatemiatutkijana ja tutkimusryhmän johtajana Biolääketieteen yksikössä Itä-Suomen yliopistossa. Tutkimukseni keskittyy selvittämään kuinka tumansisäiset proteiinien vuorovaikutukset muuttavat geenien säätelyä eturauhassyövässä, ja miten nämä muutokset johtavat lääkeresistenssin syövän kehittymiseen. Eturauhassyövän lisäksi, tutkin näiden proteiinien toimintaa, vuorovaikutuksia, ja muutoksia myös muissa tautitiloissa. Tarkempi kuvaus tutkimuksestani löytyy tutkimusryhmäni sivuilta (Paakinaho lab).
Tutkimusryhmät
Akateemiset tutkinnot ja tehtävät
-
2021 Dosentti (molekulaarinen endokrinologia), Itä-Suomen yliopisto
2014 FT (lääketieteellinen biokemia), Itä-Suomen yliopisto
-
Nykyiset työtehtävät
2023 Apulaisprofessori (tenure track), Biolääketiede, Itä-Suomen yliopisto
2021 Akatemiatutkija, Biolääketiede, Itä-Suomen yliopisto
Edelliset työtehtävät
2019, Special Volunteer, Yhdysvaltain kansallinen syöpäinstituutti, NIH, Yhdysvallat
2018 – 2021, Tutkijatohtori (Suomen Akatemia), Biolääketiede, Itä-Suomen yliopisto
2015 – 2017, Tutkijatohtori, Yhdysvaltain kansallinen syöpäinstituutti, NIH, Yhdysvallat
2010 – 2014, Nuorempi tutkija, Biolääketiede, Itä-Suomen yliopisto
Opetus- ja luottamustehtävät
-
Nykyiset opetustehtävät
2025 lähtien
Luennoitsija: Molecular Medicine, Master’s program in Biomedicine, Itä-Suomen yliopisto
2018 lähtien
Vastuuopettaja: Genome-wide gene expression project (GEP), Master’s program in Biomedicine, Itä-Suomen yliopisto
Aiemmat opetustehtävät
2023-2024
Kurssijärjestäjä: Cancer Journal Club, Tieteellinen jatkokoulutus, Itä-Suomen yliopisto
2014
Luennoitsija: Johdatus bioinformatiikkaan (JOBI), Terveyden biotieteiden koulutusohjelma, Itä-Suomen yliopisto
Laboratorioharjoitusten ohjaaja: Advanced laboratory works in molecular biology (ALMB), Terveyden biotieteiden koulutusohjelma, Itä-Suomen yliopisto
2013
Laboratorioharjoitusten ohjaaja: Molekyylibiologian laboratoriotyöt biokemisteille (BIK390), Biotieteiden koulutusohjelma, Itä-Suomen yliopisto
Laboratorioharjoitusten ohjaaja: Lääketieteellinen biokemia 2 (LBK2), Lääketieteen koulutusohjelma, Itä-Suomen yliopisto
2012
Laboratorioharjoitusten ohjaaja: Molekyylibiologian laboratoriotyöt biokemisteille (BIK390), Biotieteiden koulutusohjelma, Itä-Suomen yliopisto
2011
Laboratorioharjoitusten ohjaaja: Lääketieteellinen biokemia 2 (LBK2), Lääketieteen koulutusohjelma, Itä-Suomen yliopisto
-
2023 lähtien
Ohjausryhmän jäsen, Monitieteinen syöpätutkimus (CANCER) -tutkimusyhteisö, Itä-Suomen yliopisto
2022 lähtien
Hallituksen jäsen, Suomen endokrinologiyhdistys ry
Kunnianosoitukset
-
2022, Unto Uotila palkinto, Suomen Endokrinologiyhdistys, Suomi
2019, The Endocrine Society Outstanding Abstract Award, Endocrine Society, Yhdysvallat
2017, The Fellows Award for Research Excellence (FARE), NIH, Yhdysvallat
2015, Nuoren tutkijan palkinto, UEF, Suomi
Linkkejä
-
Julkaisut Pubmed-tietokannassa
Uutinen: Steroidireseptorien tutkimuskeskus yhdistää nuoria huippututkijoita
Uutinen: Ville Paakinaholle Unto Uotila -palkinto
Uutinen: Ville Paakinaholle jaettiin Unto Uotila-palkinto Endopäivillä 2022
Uutinen: Uusia näkökulmia lääkeresistenttiä eturauhassyöpää vastaan
Uutinen: Glukokortikoidireseptorilla on kaksiteräinen rooli eturauhassyövässä
Julkaisut
32/32 kappaletta-
Androgen receptor-mediated assisted loading of the glucocorticoid receptor modulates transcriptional responses in prostate cancer cells
Hiltunen, Johannes; Helminen, Laura; Aaltonen, Niina; Launonen, Kaisa-Mari; Laakso, Hanna; Malinen, Marjo; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville, 2025, Genome research, 35, 8, 1717-1732. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Matrix stiffness modulates androgen response genes and chromatin state in prostate cancer
Kaarijärvi, Roosa; Kaljunen, Heidi; Niemi, Onni; Räsänen, Merja; Paakinaho, Ville; Ketola, Kirsi, 2025, NAR cancer, 7, 1, zcaf010. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
SUMOylation inhibition potentiates the glucocorticoid receptor to program growth arrest of acute lymphoblastic leukemia cells
Valima, Emma; Varis, Vera; Bureiko, Kseniia; Lempiäinen, Joanna K; Schroderus, Anna-Mari; Oksa, Laura; Lohi, Olli; Kinnunen, Tuure; Varjosalo, Markku; Niskanen, Einari A; Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J, 2025, Oncogene, 44, 18, 1259–1271. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
A critical role for HNF4α in polymicrobial sepsis-associated metabolic reprogramming and death
Van Dender, Céline; Timmermans, Steven; Paakinaho, Ville; Vanderhaeghen, Tineke; Vandewalle, Jolien; Claes, Maarten; Garcia, Bruno; Roman, Bart; De Waele, Jan; Croubels, Siska; De Bosscher, Karolien; Meuleman, Philip; Herpain, Antoine; Palvimo, Jorma J; Libert, Claude, 2024, Embo molecular medicine, 16, 10, 2485-2515. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Central role of SUMOylation in the regulation of chromatin interactions and transcriptional outputs of the androgen receptor in prostate cancer cells
Launonen, Kaisa-Mari; Varis, Vera; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Varjosalo, Markku; Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J, 2024, Nucleic acids research, 52, 16, 9519-9535. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
DPYSL5 is highly expressed in treatment-induced neuroendocrine prostate cancer and promotes lineage plasticity via EZH2/PRC2
Kaarijärvi, Roosa; Kaljunen, Heidi; Nappi, Lucia; Fazli, Ladan; Kung, Sonia H. Y.; Hartikainen, Jaana M.; Paakinaho, Ville; Capra, Janne; Rilla, Kirsi; Malinen, Marjo; Mäkinen, Petri I.; Ylä-Herttuala, Seppo; Zoubeidi, Amina; Wang, Yuzhuo; Gleave, Martin E.; Hiltunen, Mikko; Ketola, Kirsi, 2024, Communications biology, 7, 1, 108. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
EP300/CREBBP acetyltransferase inhibition limits steroid receptor and FOXA1 signaling in prostate cancer cells
Huttunen, Jasmin; Aaltonen, Niina; Helminen, Laura; Rilla, Kirsi; Paakinaho, Ville, 2024, Cellular and molecular life sciences, 81, 1, 160. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Glucocorticoid receptor action in prostate cancer: the role of transcription factor crosstalk
Hiltunen, Johannes; Helminen, Laura; Paakinaho, Ville, 2024, Frontiers in endocrinology, 15, 1437179. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
RNA sequencing analysis reveals distinct gene expression patterns in infrapatellar fat pads of patients with end-stage osteoarthritis or rheumatoid arthritis
Mustonen, Anne-Mari; Malinen, Marjo; Paakinaho, Ville; Lehenkari, Petri; Palosaari, Sanna; Kärjä, Vesa; Nieminen, Petteri, 2024, Biochimica et biophysica acta: molecular and cell biology of lipids, 2025; 1870, 1, 159576. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
SIX2 promotes cell plasticity via Wnt/β-catenin signalling in androgen receptor independent prostate cancer
Leppänen, Noora; Kaljunen, Heidi; Takala, Eerika; Kaarijärvi, Roosa; Mäkinen, Petri I; Ylä-Herttuala, Seppo; Paatero, Ilkka; Paakinaho, Ville; Ketola, Kirsi, 2024, Nucleic acids research, 52, 10, 5610-5623. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä