Steroidireseptorien säätelymekanismit - Niskanen lab
Johtajat
Selvitämme millä mekanismeilla koregulaattoriproteiinit vaikuttavat transkription säätelyyn. Malleina käytämme kortisoli ja tulehdussignalointireittejä, jotka voidaan aktivoida soluissa hallitusti.
Synteettiset glukokortikoidit (GK) ovat voimakkaita tulehdusta ehkäiseviä lääkkeitä, joita käytetään laajasti tulehdussairauksien kuten astman ja nivelreuman hoidossa. GK:n pitkäaikaisella käytöllä on kuitenkin vakavia sivuvaikutuksia, jotka voivat johtaa esimerkiksi diabeteksen tai osteoporoosin kehittymiseen. GK:t toimivat aktivoimalla transkriptiotekijän, GK reseptorin, joka aktivoi ja vaimentaa geenien ilmentymistä. GK:n tulehdusta ehkäisevät vaikutukset johtuvat tulehdusgeenien vaimentamisesta, kun taas sivuvaikutukset metabolisten geenien aktivoinnista. Geenien aktivaatioon johtavat mekanismit tunnetaan melko hyvin, mutta vaimentamiseen johtavia ei juurikaan.
Yhteistyö
-
Professori
-
Akatemiatutkija
-
Professori, Biolääketiede
-
Akatemiatutkija
-
Yliopistotutkija, dosentti (syöpäbiologia)
-
Suomen Akatemian Tutkijatohtori
-
Academy Research Fellow, Assistant Professor of Health Bioinformatics (tenure track)
-
Yliopistotutkija (Tenure Track)
-
Grégoire Stik
Ryhmänjohtaja
Avainsanat
Julkaisut
23 kappaletta-
Central role of SUMOylation in the regulation of chromatin interactions and transcriptional outputs of the androgen receptor in prostate cancer cells
Launonen, Kaisa-Mari; Varis, Vera; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Varjosalo, Markku; Paakinaho, Ville; Palvimo, Jorma J. 2024. Nucleic acids research. 52: 9519-9535 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Secreted factors from M1 macrophages drive prostate cancer stem cell plasticity by upregulating NANOG, SOX2, and CD44 through NFκB-signaling
Kainulainen, Kirsi; Niskanen, Einari A; Kinnunen, Johanna; Mäki-Mantila, Kaisa; Hartikainen, Kiia; Paakinaho, Ville; Malinen, Marjo; Ketola, Kirsi; Pasonen-Seppänen, Sanna. 2024. Oncoimmunology. 13: . 2393442 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Steroidireseptorien säätely
Paakinaho, Ville; Niskanen, Einari A. 2024. Duodecim. 140: 759-767 A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chromatin accessibility and pioneer factor FOXA1 restrict glucocorticoid receptor action in prostate cancer
Helminen, Laura; Huttunen, Jasmin; Tulonen, Melina; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville. 2023. Nucleic acids research. 2024; 52: 625-642 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Complementary analysis of proteome‐wide proteomics reveals changes in RNA binding protein‐profiles during prostate cancer progression
Aikio, Erika; Koivukoski, Sonja; Kallio, Elina; Sadeesh, Nithin; Niskanen, Einari A; Latonen, Leena. 2023. Cancer reports. 6: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Genetic variation is a key determinant of chromatin accessibility and drives differences in the regulatory landscape of C57BL/6J and 129S1/SvImJ mice
Mononen, Juho; Taipale, Mari; Malinen, Marjo; Velidendla, Bharadwaja; Niskanen, Einari; Levonen, Anna-Liisa; Ruotsalainen, Anna-Kaisa; Heikkinen, Sami. 2023. Nucleic acids research. 2024; 52: 2904-2923 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
International Online Team-Based Learning in Higher Education of Biomedicine - Evaluation by Learning Analytics
Mairinoja, Laura; López-Pernas, Sonsoles; Elmoazen, Ramy; Niskanen, Einari A.; Kuningas, Tiina; Wärri, Anni; Saqr, Mohammed; Strauss, Leena. Teoksessa: Elmoazen, Ramy; López-Pernas, Sonsoles; Misiejuk, Kamila; Khalil, Mohammad; Wasson, Barbara; Saqr, Mohammed(toim.) , 2023. Proceedings of the Technology-Enhanced Learning in Laboratories Workshop (TELL 2023). s. 49-60. A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa -
Parvovirus nonstructural protein 2 interacts with chromatin-regulating cellular proteins
Mattola, Salla; Salokas, Kari; Aho, Vesa; Mäntylä, Elina; Salminen, Sami; Hakanen, Satu; Niskanen, Einari A.; Svirskaite, Julija; Ihalainen, Teemu O.; Airenne, Kari J.; Kaikkonen-Määttä, Minna; Parrish, Colin R.; Varjosalo, Markku; Vihinen-Ranta, Maija. 2022. PLoS pathogens. 18: A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
BCOR modulates transcriptional activity of a subset of glucocorticoid receptor target genes involved in cell growth and mobility
Manjur, ABMK; Lempiäinen, JK; Malinen, M; Varjosalo, M; Palvimo, JJ; Niskanen, EA. 2021. Journal of steroid biochemistry and molecular biology. 210: 105873 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells
Launonen, Kaisa-Mari; Paakinaho, Ville; Sigismondo, Gianluca; Malinen, Marjo; Sironen, Reijo; Hartikainen, Jaana M; Laakso, Hanna; Visakorpi, Tapio; Krijgsveld, Jeroen; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J. 2021. Oncogene. 40: 4567-4579 A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä