
Transkriptiotekijöiden ristiinkytkentä syövissä - Paakinaho lab
Johtajat
Tutkimuksemme keskittyy selvittämään kuinka steroidireseptorit ja pioneeritekijät säätelevät transkriptiota sekä normaaleissa että tautitiloissa. Erityinen mielenkiinnon kohteemme on transkriptiotekijöiden ristiinkytkentä eturauhassyövässä; miten steroidireseptorit ja pioneeritekijät muuttavat toistensa toimintaa vaikuttaen syövän syntyyn, kehitykseen, ja lääkeresistenssiin. Steroidireseptoreista tutkimme pääasiassa glukokortikoidireseptori (GR) ja androgeenireseptori (AR), ja pioneeritekijöistä forkhead-transkriptiotekijä A1 (FOXA1) ja aktivaattori proteiini 1 (AP-1) toimintaa. Käytämme tutkimuksessamme koko genominlaajuisia syväsekvensointitekniikoita, kromatiini-proteomiikan menetelmiä, yksisolugenomiikan menetelmiä, ja CRISPR-välitteisiä geenien muokkaustekniikoita. Tavoitteenamme on löytää uusia lääkekohteita ja hoitomuotoja pahanlaatuisten ja lääkeresistenttien syöpien kukistamiseen. Tuloksiamme pystytään myös soveltamaan muiden tautitilojen, kuten metabolisten sairauksien, tutkimuksessa.
Tutkimusryhmä:
Ville Paakinaho
Akatemiatutkija, apulaisprofessori
FT, dosentti (molekulaarinen endokrinologia)
Projektitutkija, FaT Niina Aaltonen
Väitöskirjatutkija, FM Laura Helminen
Väitöskirjatutkija, FM Johannes Hiltunen
Väitöskirjatutkija, FM Jasmin Huttunen
Tutkimusavustaja, LuK Heini Sohlberg
Tutkimusprojektit:
(i) Transkriptiotekijöiden ristiinkytkentä mekanismit hyvänlaatuisessa verrattuna pahanlaatuiseen eturauhassyöpään.
(ii) Steroidireseptori-välitteinen lääkeresistenssi eturauhassyövässä.
(iii) Koregulaattoriproteiinit transkriptiotekijöiden ristiinkytkennässä ja niiden merkitys eturauhassyövässä.
Tutkimustuloksia:
Viimeaikaiset tutkimuksemme ovat osoittaneet, että FOXA1:llä on ratkaiseva rooli GR-välitteisessä lääkeresistenssissä ja että vaikuttamalla transkriptiotekijöiden ristiinkytkentään voidaan torjua niiden haitallisia vaikutuksia eturauhassyövässä (Helminen et al., 2024, Nucleic Acids Res; Huttunen et al., 2024, Cell Mol Life Sci). Olemme myös havainneet, että AR:n läsnä ollessa GR:llä on eturauhassyöpää rajaava vaikutus, kun taas ilman AR:n vaikutusta GR edistää syövän selviytymistä (Hiltunen et al., 2025, Genome Res).
Popularisoidut uutiset tutkimustuloksistamme:
9.6.2025: Glukokortikoidireseptorilla on kaksiteräinen rooli eturauhassyövässä
9.4.2024: Uusia näkökulmia lääkeresistenttiä eturauhassyöpää vastaan
Katso tutkimuksemme tavoitteiden ja tulosten tarkempi kuvaus englanninkielisiltä sivuiltamme.
Ajankohtaista
-
Preprint julkaisu: bioRxiv
p63-GATA2 molecular switch mediates the tumor suppressor to oncogene transition of glucocorticoid receptor in the prostate -
Glukokortikoidireseptorilla on kaksiteräinen rooli eturauhassyövässä
Tuore tutkimus Itä-Suomen yliopiston biolääketieteen yksiköstä osoittaa, että glukokortikoidireseptori voi tilanteesta riippuen joko edistää… -
Tutkimusjulkaisu: Genome Res
Androgen receptor-mediated assisted loading of the glucocorticoid receptor modulates transcriptional responses in prostate cancer cells
Labran uutiset
2025-10:

2025-09: Jasmin ja Johannes esittelivät tutkimustuloksiaan iCAN Symposium kokouksessa.
2025-08: Tutkimusprojekti (i) -liittyvä toinen bioRxiv preprint on julkaistu.
2025-06: Tutkimusprojekti (i) -liittyvä tutkimuksemme julkaistu Genome Res -julkaisusarjassa. Popularisoitu uutinen tutkimuksestamme julkaistu uef.fi-sivustolla.
2024-11: Tutkimusprojekti (i) -liittyvä bioRxiv preprint julkaistu.
2024-09: Johannes ja Laura esittelivät tutkimustuloksiaan EMBO Nuclear Receptor kokouksessa.
2024-07: Katsausartikkeli tutkimusaihealueestamme julkaistu Front Endocrinol -julkaisusarjassa.
2024-04: Tutkimusprojekti (iii) -liittyvä tutkimuksemme julkaistu Cell Mol Life Sci -julkaisusarjassa. Popularisoitu uutinen tutkimuksestamme julkaistu uef.fi-sivustolla.
2023-11: Tutkimusprojekti (ii) -liittyvä tutkimuksemme julkaistu Nucleic Acids Res -julkaisusarjassa. Laura esitteli tutkimustuloksiaan EMBL Cancer genomics kokouksessa.
2023-10

2023-08: Johannes esitteli tutkimustuloksiaan FEBS Epigenomics, Nuclear Receptors and Diseases kokouksessa.
2023-06: Ville esitteli tutkimusryhmän tuloksia ENDO 2023 kokouksessa.
2023-03: Tutkimusprojekti (ii) -liittyvä bioRxiv preprint julkaistu.
-
Kansainväliset yhteistyökumppanit
- Gordon L. Hager (National Cancer Institute, NIH, Bethesda, MD, USA)
- Claude Libert (Ghent University, Ghent, Belgium)
Kansalliset yhteistyökumppanit
-
- Suomen Akatemia (päätös)
- Sigrid Juséliuksen Säätiö
- Syöpäsäätiö
- UEF strateginen rahoitus
Avainsanat
Johtajat
Tutkijatohtorit
Väitöskirjatutkijat
-
Laura Helminen
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Johannes Hiltunen
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta -
Jasmin Huttunen
VäitöskirjatutkijaBiolääketieteen yksikkö, Lääketieteen laitos, Terveystieteiden tiedekunta
Tukihenkilöstö
Julkaisut
4 kappaletta-
Androgen receptor-mediated assisted loading of the glucocorticoid receptor modulates transcriptional responses in prostate cancer cells
Hiltunen, Johannes; Helminen, Laura; Aaltonen, Niina; Launonen, Kaisa-Mari; Laakso, Hanna; Malinen, Marjo; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville, 2025, Genome research, 35, 8, 1717-1732. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
EP300/CREBBP acetyltransferase inhibition limits steroid receptor and FOXA1 signaling in prostate cancer cells
Huttunen, Jasmin; Aaltonen, Niina; Helminen, Laura; Rilla, Kirsi; Paakinaho, Ville, 2024, Cellular and molecular life sciences, 81, 1, 160. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Glucocorticoid receptor action in prostate cancer: the role of transcription factor crosstalk
Hiltunen, Johannes; Helminen, Laura; Paakinaho, Ville, 2024, Frontiers in endocrinology, 15, 1437179. A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä -
Chromatin accessibility and pioneer factor FOXA1 restrict glucocorticoid receptor action in prostate cancer
Helminen, Laura; Huttunen, Jasmin; Tulonen, Melina; Aaltonen, Niina; Niskanen, Einari A; Palvimo, Jorma J; Paakinaho, Ville, 2023, Nucleic acids research, 2024; 52, 2, 625-642. A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä