Transkriptiotekijöiden ristiinkytkentä syövissä - Paakinaho lab

Tutkimuksemme keskittyy selvittämään kuinka steroidireseptorit ja pioneeritekijät säätelevät transkriptiota sekä normaaleissa että tautitiloissa. Erityinen mielenkiinnon kohteemme on transkriptiotekijöiden ristiinkytkentä eturauhassyövässä; miten steroidireseptorit ja pioneeritekijät muuttavat toistensa toimintaa vaikuttaen syövän syntyyn, kehitykseen, ja lääkeresistenssiin. Steroidireseptoreista tutkimme pääasiassa glukokortikoidireseptori (GR) ja androgeenireseptori (AR), ja pioneeritekijöistä forkhead-transkriptiotekijä A1 (FOXA1) ja aktivaattori proteiini 1 (AP-1) toimintaa. Käytämme tutkimuksessamme koko genominlaajuisia syväsekvensointitekniikoita, kromatiini-proteomiikan menetelmiä, yksisolugenomiikan menetelmiä, ja CRISPR-välitteistä geenien muokkaustekniikoita. Tavoitteenamme on löytää uusia lääkekohteita ja hoitomuotoja pahanlaatuisten ja lääkeresistenttien syöpien kukistamiseen.

Tutkimusryhmä:
Ville Paakinaho
Akatemiatutkija, FT, dosentti (molekulaarinen endokrinologia)

Projektitutkija, FaT Niina Aaltonen
Väitöskirjatutkija, FM Laura Helminen
Väitöskirjatutkija, FM Johannes Hiltunen
Väitöskirjatutkija, FM Jasmin Huttunen
Tutkimusavustaja, FM Mitali Mishra
Tutkimusavustaja, LuK Heini Sohlberg

Tutkimusprojektit:
(i) Transkriptiotekijöiden ristiinkytkentä mekanismit hyvänlaatuisessa verrattuna pahanlaatuiseen eturauhassyöpään.
(ii) Steroidireseptori-välitteinen lääkeresistenssi eturauhassyövässä.
(iii) Koregulaattoriproteiinit transkriptiotekijöiden ristiinkytkennässä ja niiden merkitys eturauhassyövässä.

Tutkimustuloksia:
Viimeaikaiset tutkimuksemme ovat osoittaneet, että FOXA1:llä on ratkaiseva rooli GR-välitteisessä lääkeresistenssissä ja että vaikuttamalla transkriptiotekijöiden ristiinkytkentään voidaan torjua niiden haitallisia vaikutuksia eturauhassyövässä (Helminen et al., 2024, Nucleic Acids Res; Huttunen et al., 2024, Cell Mol Life Sci). Olemme myös havainneet, että AR:n läsnä ollessa GR:llä on eturauhassyöpää rajaava vaikutus, kun taas ilman AR:n vaikutusta GR edistää syövän selviytymistä (Hiltunen et al., 2025, Genome Res).

Katso tutkimuksemme tarkempi kuvaus englanninkielisiltä sivuiltamme.